More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1343 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1343  sodium/sulphate symporter  100 
 
 		 618 aa  1257    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1697  anion transporter  36.17 
 
 		 452 aa  281  3e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000215877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1347  response regulator receiver protein  33.47 
 
 		 688 aa  176  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0235  anion transporter  28.44 
 
 		 446 aa  159  2e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000069628  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  26.35 
 
 		 459 aa  157  7e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3936  anion transporter  27.68 
 
 		 482 aa  154  5e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603046  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0193  anion transporter  28.15 
 
 		 498 aa  147  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00876839  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2267  Sodium/sulphate symporter  28.19 
 
 		 516 aa  145  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0413087 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2857  Sodium/sulphate symporter  29.02 
 
 		 482 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00834763  hitchhiker  0.0000150124 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1734  anion transporter  27.25 
 
 		 483 aa  140  7.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1359  anion transporter  28.57 
 
 		 534 aa  139  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2485  anion transporter  27.62 
 
 		 483 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3967  anion transporter  25.4 
 
 		 475 aa  132  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0884  anion transporter  23.96 
 
 		 456 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195972  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0893  anion transporter  25.25 
 
 		 536 aa  130  7.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0730  anion transporter  26.06 
 
 		 517 aa  130  9.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.597447  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0714  anion transporter  26.06 
 
 		 517 aa  130  9.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0150  anion transporter  26.3 
 
 		 531 aa  127  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0348  anion transporter family protein  26.39 
 
 		 518 aa  125  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0045  CitT protein  26.21 
 
 		 455 aa  125  3e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296324  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1946  anion transporter  26.13 
 
 		 502 aa  124  6e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0219  NadC family transporter  26.24 
 
 		 462 aa  123  9.999999999999999e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000102508  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3207  divalent anion:sodium symporter family protein  29.46 
 
 		 474 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1145  conserved hypothetical protein, putative sodium/sulfate transporter  24.5 
 
 		 453 aa  122  1.9999999999999998e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00119531  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2613  anion transporter  27.74 
 
 		 534 aa  120  7e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0828231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2574  anion transporter  27.74 
 
 		 534 aa  120  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2619  anion transporter  27.74 
 
 		 534 aa  120  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.243228  normal  0.988073 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1510  hypothetical protein  24.3 
 
 		 522 aa  118  3e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.807629 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2073  Na/dicarboxylate cotransporter-like protein  24.6 
 
 		 531 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1924  anion transporter  26.5 
 
 		 491 aa  116  1.0000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.200858  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1802  anion transporter  26.35 
 
 		 487 aa  115  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.466043  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2663  anion transporter  24.89 
 
 		 464 aa  114  6e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.392129  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1560  anion transporter  24.55 
 
 		 465 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251545  hitchhiker  0.000139905 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26980  anion transporter  27.79 
 
 		 499 aa  112  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4829  anion transporter  26.55 
 
 		 543 aa  111  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2627  anion transporter  25.28 
 
 		 607 aa  111  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003739  di-and tricarboxylate transporter  27.29 
 
 		 456 aa  110  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45173  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0786  anion transporter  24.72 
 
 		 456 aa  111  5e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1663  permease  25.35 
 
 		 489 aa  110  6e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2490  anion transporter  23.61 
 
 		 463 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0173335 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1123  anion transporter  25 
 
 		 660 aa  110  9.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003586  transporter  27.72 
 
 		 472 aa  110  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1358  helix-turn-helix, AraC type  22.92 
 
 		 467 aa  109  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1252  anion transporter  26.83 
 
 		 522 aa  110  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.865916 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3094  anion transporter  24.44 
 
 		 464 aa  110  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.962564  hitchhiker  0.00000460999 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0346  sodium-dependent transporter  24.27 
 
 		 552 aa  109  2e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000913851  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1542  anion transporter  24.89 
 
 		 482 aa  108  3e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02032  hypothetical protein  26.16 
 
 		 456 aa  108  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0497  anion transporter  23.21 
 
 		 487 aa  107  7e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1988  anion transporter  25.91 
 
 		 482 aa  107  8e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.241159  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2740  putative transporter  25.75 
 
 		 478 aa  106  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000997908  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0221  anion transporter  24.61 
 
 		 460 aa  105  2e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1991  anion transporter  25.71 
 
 		 483 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000356301  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0932  putative transporter  26.88 
 
 		 487 aa  105  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0349  anion transporter  24.24 
 
 		 490 aa  105  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000240953  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3834  anion transporter  24.05 
 
 		 466 aa  104  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002249  transporter  25.31 
 
 		 471 aa  105  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154168  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0427  anion transporter  24.05 
 
 		 466 aa  104  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3393  anion transporter  24.72 
 
 		 466 aa  104  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2459  anion transporter  23.71 
 
 		 513 aa  104  5e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.983995  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2459  anion transporter  23.15 
 
 		 483 aa  103  6e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4030  anion transporter  23.73 
 
 		 466 aa  103  7e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3907  anion transporter  23.73 
 
 		 466 aa  103  7e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0484  anion transporter  25.6 
 
 		 468 aa  103  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.316774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00118  sodium-dependent transporter  24.81 
 
 		 471 aa  103  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2006  anion transporter  22.88 
 
 		 520 aa  101  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.740344  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1972  anion transporter  22.88 
 
 		 520 aa  101  3e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1953  anion transporter  24.07 
 
 		 489 aa  102  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312845  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0859  anion transporter  26.86 
 
 		 579 aa  101  4e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.878292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4511  anion transporter  24.22 
 
 		 516 aa  101  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4649  anion transporter  24.12 
 
 		 557 aa  101  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1872  sodium/sulphate symporter  26.65 
 
 		 461 aa  101  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1868  sodium/sulphate symporter  24.59 
 
 		 461 aa  101  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0108  NadC family protein  24.44 
 
 		 462 aa  99.8  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2078  anion transporter  25 
 
 		 486 aa  99.4  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1717  anion transporter  22.07 
 
 		 458 aa  99.4  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3574  anion transporter  25.27 
 
 		 467 aa  99  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0451  anion transporter  24.89 
 
 		 466 aa  99  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.865628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2341  anion transporter  25.83 
 
 		 472 aa  99  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0587131 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01988  Na+/dicarboxylate symporter  22.81 
 
 		 478 aa  98.2  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.619169  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1048  DASS family divalent anion:Na(+) symporter  23.8 
 
 		 473 aa  98.2  4e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.486409 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3450  anion transporter  25.95 
 
 		 511 aa  97.8  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.502589  normal  0.0319564 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2065  NadC family transporter  24.77 
 
 		 457 aa  97.8  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  hitchhiker  0.00141864 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0455  anion transporter  24.17 
 
 		 467 aa  97.4  6e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0442  anion transporter  25.83 
 
 		 486 aa  97.1  9e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0326  transmembrane transport proteins-like  24.47 
 
 		 491 aa  96.7  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.677741  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1936  anion transporter  25.74 
 
 		 493 aa  95.9  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0197224  normal  0.483122 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3246  anion transporter  24.6 
 
 		 506 aa  95.9  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.961342 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2446  Sodium/sulphate symporter  24.19 
 
 		 491 aa  95.1  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07320  anion transporter  25.16 
 
 		 526 aa  95.1  3e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.039375  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16290  anion transporter  24.49 
 
 		 566 aa  94.7  4e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0948  anion transporter  26.76 
 
 		 509 aa  95.1  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289839  normal  0.0846649 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1421  anion transporter  23.76 
 
 		 474 aa  94  7e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0194982  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22550  anion transporter  25.91 
 
 		 517 aa  93.2  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8313  anion transporter  23.98 
 
 		 491 aa  92  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572418  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24780  anion transporter  25.85 
 
 		 502 aa  91.3  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1157  citrate transporter  26.15 
 
 		 447 aa  91.3  5e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0794  sodium/sulphate symporter  25.17 
 
 		 490 aa  91.3  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000496756  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2963  anion transporter  23.58 
 
 		 540 aa  90.1  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.92043  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3547  anion transporter  23.42 
 
 		 422 aa  89.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>