233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2041 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2041  sodium/sulphate symporter  100 
 
 
488 aa  972    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.341922  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1359  anion transporter  34.38 
 
 
534 aa  227  4e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0235  anion transporter  27.29 
 
 
446 aa  149  1.0000000000000001e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000069628  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1697  anion transporter  26.93 
 
 
452 aa  149  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000215877  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1991  anion transporter  25.89 
 
 
483 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000356301  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0383  anion transporter  28.4 
 
 
470 aa  134  5e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1988  anion transporter  25.64 
 
 
482 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.241159  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0794  sodium/sulphate symporter  25.2 
 
 
490 aa  121  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000496756  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0326  transmembrane transport proteins-like  26.47 
 
 
491 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.677741  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0884  anion transporter  24.19 
 
 
456 aa  116  8.999999999999998e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195972  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  23.77 
 
 
459 aa  114  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0193  anion transporter  25.71 
 
 
498 aa  110  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00876839  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1868  sodium/sulphate symporter  26.23 
 
 
461 aa  103  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2267  Sodium/sulphate symporter  24.43 
 
 
516 aa  103  8e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0413087 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0221  anion transporter  24.48 
 
 
460 aa  102  2e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1145  conserved hypothetical protein, putative sodium/sulfate transporter  26.58 
 
 
453 aa  99.4  1e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00119531  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3967  anion transporter  24.14 
 
 
475 aa  97.8  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2857  Sodium/sulphate symporter  23.86 
 
 
482 aa  95.5  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00834763  hitchhiker  0.0000150124 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0560  anion transporter  22.31 
 
 
507 aa  94.7  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0219  NadC family transporter  26.52 
 
 
462 aa  94.4  4e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000102508  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0069  anion transporter  26.04 
 
 
509 aa  94.7  4e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.636349 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1972  anion transporter  24.03 
 
 
520 aa  94.4  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2006  anion transporter  24.03 
 
 
520 aa  94.4  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.740344  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0484  anion transporter  27.56 
 
 
468 aa  92  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.316774  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2963  anion transporter  26.19 
 
 
540 aa  91.7  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.92043  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2561  anion transporter  25 
 
 
466 aa  91.3  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.890492  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0045  CitT protein  24.77 
 
 
455 aa  90.5  6e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296324  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2459  anion transporter  26.08 
 
 
483 aa  89.7  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0341  DASS family Na(+)/divalent anion symporter  23.18 
 
 
514 aa  89  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0364285  hitchhiker  0.00160481 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3936  anion transporter  21.93 
 
 
482 aa  88.2  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603046  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1953  anion transporter  22.52 
 
 
489 aa  87.4  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312845  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8313  anion transporter  22.93 
 
 
491 aa  87.4  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572418  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02032  hypothetical protein  24.72 
 
 
456 aa  87.4  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1872  sodium/sulphate symporter  23.91 
 
 
461 aa  87  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1542  anion transporter  22.63 
 
 
482 aa  87  7e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518427  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2627  anion transporter  24.12 
 
 
607 aa  86.7  8e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2078  anion transporter  22.93 
 
 
486 aa  87  8e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0497  anion transporter  23.85 
 
 
487 aa  86.7  9e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1560  anion transporter  25.1 
 
 
465 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251545  hitchhiker  0.000139905 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003739  di-and tricarboxylate transporter  24.5 
 
 
456 aa  85.5  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45173  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0786  anion transporter  26.26 
 
 
456 aa  85.5  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1734  anion transporter  21.87 
 
 
483 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3246  anion transporter  22.84 
 
 
506 aa  85.1  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.961342 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1347  response regulator receiver protein  26.07 
 
 
688 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2446  Sodium/sulphate symporter  25.71 
 
 
491 aa  84  0.000000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2663  anion transporter  26.04 
 
 
464 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.392129  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3094  anion transporter  24.89 
 
 
464 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.962564  hitchhiker  0.00000460999 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2485  anion transporter  20.81 
 
 
483 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4649  anion transporter  22.76 
 
 
557 aa  81.3  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664934  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1946  anion transporter  24.1 
 
 
502 aa  80.9  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3574  anion transporter  24.57 
 
 
467 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2073  Na/dicarboxylate cotransporter-like protein  22.92 
 
 
531 aa  80.1  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0714  anion transporter  22.65 
 
 
517 aa  80.1  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0730  anion transporter  22.65 
 
 
517 aa  80.1  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.597447  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5321  anion transporter  25.15 
 
 
596 aa  79.7  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3907  anion transporter  25.05 
 
 
466 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4030  anion transporter  25.05 
 
 
466 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0889  anion transporter  26.6 
 
 
495 aa  79.7  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.517689  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3834  anion transporter  25.05 
 
 
466 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0455  anion transporter  24.35 
 
 
467 aa  79  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0809  NadC family protein  25.76 
 
 
476 aa  79  0.0000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000168692  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1510  hypothetical protein  22.7 
 
 
522 aa  79.3  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.807629 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0150  anion transporter  22.42 
 
 
531 aa  78.6  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0346  sodium-dependent transporter  25.79 
 
 
552 aa  78.6  0.0000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000913851  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0427  anion transporter  24.9 
 
 
466 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1936  anion transporter  25.16 
 
 
493 aa  77.8  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0197224  normal  0.483122 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2490  anion transporter  23.79 
 
 
463 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0173335 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0932  putative transporter  23.92 
 
 
487 aa  77.8  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0787  sodium/sulphate symporter  23.59 
 
 
491 aa  77.4  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2740  putative transporter  23.6 
 
 
478 aa  77.8  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000997908  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1924  anion transporter  24.72 
 
 
491 aa  77.4  0.0000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.200858  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01988  Na+/dicarboxylate symporter  25.9 
 
 
478 aa  77  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.619169  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00118  sodium-dependent transporter  24.95 
 
 
471 aa  76.6  0.0000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002249  transporter  25.21 
 
 
471 aa  76.3  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154168  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0639  putative membrane transporter  25.73 
 
 
570 aa  76.6  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0451  anion transporter  24.43 
 
 
466 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.865628  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4829  anion transporter  24.62 
 
 
543 aa  75.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003586  transporter  22.91 
 
 
472 aa  75.9  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2065  NadC family transporter  23.4 
 
 
457 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  hitchhiker  0.00141864 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0893  anion transporter  21.79 
 
 
536 aa  75.5  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1802  anion transporter  24.25 
 
 
487 aa  75.9  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.466043  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0348  anion transporter family protein  24.08 
 
 
518 aa  74.7  0.000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1564  anion transporter  24.55 
 
 
493 aa  74.7  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.43197  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1343  sodium/sulphate symporter  25.39 
 
 
618 aa  72.8  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3393  anion transporter  24.11 
 
 
466 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2049  sodium/sulphate symporter  25 
 
 
485 aa  72.4  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000525782  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2238  anion transporter  21.73 
 
 
510 aa  71.2  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.864259  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0108  NadC family protein  23.52 
 
 
462 aa  71.2  0.00000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1717  anion transporter  23.94 
 
 
458 aa  70.9  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3547  anion transporter  22.98 
 
 
422 aa  70.9  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2459  anion transporter  21.53 
 
 
513 aa  70.9  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.983995  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3207  divalent anion:sodium symporter family protein  22.87 
 
 
474 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1145  Sodium/sulphate symporter  25.85 
 
 
482 aa  70.5  0.00000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1157  citrate transporter  23.47 
 
 
447 aa  70.5  0.00000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1663  permease  21.67 
 
 
489 aa  69.7  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3548  anion transporter  23.17 
 
 
422 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6918  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1048  DASS family divalent anion:Na(+) symporter  23.91 
 
 
473 aa  68.9  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.486409 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3716  anion transporter  23.17 
 
 
422 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.672339 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07320  anion transporter  24.57 
 
 
526 aa  68.9  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.039375  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26980  anion transporter  25.21 
 
 
499 aa  68.9  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>