81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5900 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5677  sodium/sulphate symporter  98.28 
 
 		 465 aa  889    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0143035  normal  0.0333919 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5900  sodium/sulphate symporter  100 
 
 		 465 aa  900    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  normal  0.020602 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4275  sodium/sulphate symporter  37.02 
 
 		 441 aa  244  3e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.684538 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0456  sodium/sulphate symporter  36.83 
 
 		 433 aa  243  6e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3599  sodium/sulphate symporter  35.83 
 
 		 441 aa  237  3e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.914538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4053  sodium/sulphate symporter  36.05 
 
 		 434 aa  231  3e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3891  sodium/sulphate symporter  35.6 
 
 		 441 aa  225  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.351593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1482  sodium/sulphate symporter  32.83 
 
 		 478 aa  221  3e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0963428 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43990  sodium/solute symporter protein  38.24 
 
 		 432 aa  220  3.9999999999999997e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1867  sodium/sulphate symporter  32.25 
 
 		 462 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.970119  normal  0.269593 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6317  sodium/sulphate symporter  37.32 
 
 		 433 aa  214  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.190287  hitchhiker  0.00328538 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2111  sodium/sulphate symporter  32.25 
 
 		 462 aa  213  9e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0268819 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1922  sodium/sulphate symporter  32.82 
 
 		 462 aa  209  6e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1909  sodium/sulphate symporter  31.15 
 
 		 463 aa  201  3e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1559  sodium/sulphate symporter  33.41 
 
 		 502 aa  199  9e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7176  sodium/sulphate symporter  36.45 
 
 		 433 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.692361  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2456  sodium/sulphate symporter  31 
 
 		 463 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.240991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2007  sodium/sulphate symporter  31.24 
 
 		 463 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000568868 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2351  sodium/sulphate symporter  31 
 
 		 463 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.9001  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5269  sodium/sulphate symporter  31.43 
 
 		 530 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.438877 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2340  sodium/sulphate symporter  31 
 
 		 463 aa  191  4e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0255  sodium/sulphate symporter  32.71 
 
 		 486 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0483  DASS family Na(+)/divalent anion symporter  32.55 
 
 		 486 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2659  sodium/sulphate symporter  29.06 
 
 		 463 aa  89  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2049  sodium/sulphate symporter  28.41 
 
 		 485 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000525782  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2211  sodium/solute symporter family protein  23.46 
 
 		 476 aa  62.4  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2055  sodium/solute symporter family protein  23.46 
 
 		 476 aa  62.4  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0229525  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2239  sodium/solute symporter family protein  24.8 
 
 		 473 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.93542e-30 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2193  sodium/solute symporter family protein  24.75 
 
 		 476 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00348194  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1564  anion transporter  22.61 
 
 		 493 aa  58.5  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.43197  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2094  sodium/sulphate symporter  23.64 
 
 		 466 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0341  DASS family Na(+)/divalent anion symporter  24.26 
 
 		 514 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0364285  hitchhiker  0.00160481 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0787  sodium/sulphate symporter  26.79 
 
 		 491 aa  57.4  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3032  anion transporter  27.27 
 
 		 487 aa  56.6  0.0000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00580  citrate:succinate antiporter  27.27 
 
 		 487 aa  56.6  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0663  sodium:sulfate symporter family protein  27.27 
 
 		 487 aa  56.6  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0634  citrate transporter  27.27 
 
 		 487 aa  56.6  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00569  hypothetical protein  27.27 
 
 		 487 aa  56.6  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1663  permease  19.96 
 
 		 489 aa  56.6  0.0000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3013  anion transporter  27.27 
 
 		 487 aa  56.6  0.0000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0421609  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8313  anion transporter  22.12 
 
 		 491 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572418  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0700  sodium:sulfate symporter family protein  27.27 
 
 		 476 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4560  sodium/sulphate symporter  28.35 
 
 		 555 aa  55.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.760965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0631  sodium:sulfate symporter family protein  25.84 
 
 		 476 aa  53.9  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0777  sodium:sulfate symporter family protein  25.84 
 
 		 487 aa  53.5  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.406229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0731  sodium:sulfate symporter family protein  25.84 
 
 		 487 aa  53.5  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0672  sodium:sulfate symporter family protein  25.84 
 
 		 487 aa  53.5  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0658  sodium:sulfate symporter family protein  25.84 
 
 		 487 aa  53.5  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2672  sodium/sulphate symporter  20.4 
 
 		 486 aa  52.8  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01988  Na+/dicarboxylate symporter  26.64 
 
 		 478 aa  52  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.619169  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4511  anion transporter  22.65 
 
 		 516 aa  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0560  anion transporter  26.38 
 
 		 507 aa  51.2  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0383  anion transporter  20.25 
 
 		 470 aa  50.4  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02883  hypothetical protein  26.39 
 
 		 487 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00124392  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02933  predicted tartrate:succinate antiporter  26.39 
 
 		 487 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00145949  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4375  anion transporter  26.39 
 
 		 487 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00267264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0636  anion transporter  26.39 
 
 		 487 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000570216  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0637  anion transporter  26.39 
 
 		 487 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000275084  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0362  sodium/sulphate symporter  26.8 
 
 		 470 aa  48.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3243  anion transporter  26.39 
 
 		 487 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3527  anion transporter  26.39 
 
 		 487 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412852  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3356  anion transporter  26.39 
 
 		 487 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000525621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0363  sodium/sulphate symporter  22.07 
 
 		 532 aa  47.4  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288684  hitchhiker  0.00000731788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2574  anion transporter  27.27 
 
 		 534 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2619  anion transporter  27.27 
 
 		 534 aa  47.4  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.243228  normal  0.988073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2613  anion transporter  27.27 
 
 		 534 aa  47  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0828231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26980  anion transporter  25.76 
 
 		 499 aa  45.8  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3967  anion transporter  29.37 
 
 		 475 aa  46.6  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0091  divalent anion:Na+ symporter family protein  25.33 
 
 		 475 aa  45.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0092  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  25.33 
 
 		 475 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4122  anion transporter  25.33 
 
 		 475 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3165  anion transporter  22.97 
 
 		 487 aa  44.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2748  anion transporter  24.43 
 
 		 478 aa  44.7  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0015  anion transporter  27.93 
 
 		 475 aa  44.3  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00186698  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2238  anion transporter  22.87 
 
 		 510 aa  43.9  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.864259  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35420  Sodium/sulphate symporter-like protein  23.91 
 
 		 451 aa  43.9  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1868  sodium/sulphate symporter  27.89 
 
 		 461 aa  43.9  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4931  sodium/sulphate symporter  32.48 
 
 		 486 aa  43.5  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3879  sodium/sulphate symporter  20.23 
 
 		 533 aa  43.5  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1274  anion transporter  24.66 
 
 		 469 aa  43.5  0.009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1349  Citrate transporter  24.24 
 
 		 609 aa  43.1  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000776771  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>