152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1867 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2007  sodium/sulphate symporter  77.56 
 
 		 463 aa  695    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000568868 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1867  sodium/sulphate symporter  100 
 
 		 462 aa  899    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.970119  normal  0.269593 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2111  sodium/sulphate symporter  97.62 
 
 		 462 aa  879    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0268819 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1922  sodium/sulphate symporter  95.67 
 
 		 462 aa  848    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2351  sodium/sulphate symporter  78.43 
 
 		 463 aa  701    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.9001  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1909  sodium/sulphate symporter  76.2 
 
 		 463 aa  703    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2340  sodium/sulphate symporter  78.43 
 
 		 463 aa  701    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2456  sodium/sulphate symporter  78.43 
 
 		 463 aa  702    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.240991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5269  sodium/sulphate symporter  40.7 
 
 		 530 aa  344  2e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.438877 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0456  sodium/sulphate symporter  40.51 
 
 		 433 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3599  sodium/sulphate symporter  41.35 
 
 		 441 aa  326  6e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.914538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4275  sodium/sulphate symporter  40.75 
 
 		 441 aa  325  1e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.684538 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1482  sodium/sulphate symporter  40.28 
 
 		 478 aa  321  1.9999999999999998e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0963428 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43990  sodium/solute symporter protein  42.35 
 
 		 432 aa  320  3.9999999999999996e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4053  sodium/sulphate symporter  39.19 
 
 		 434 aa  319  7.999999999999999e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3891  sodium/sulphate symporter  41.11 
 
 		 441 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.351593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1559  sodium/sulphate symporter  38.89 
 
 		 502 aa  295  2e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7176  sodium/sulphate symporter  39.76 
 
 		 433 aa  288  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.692361  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0483  DASS family Na(+)/divalent anion symporter  38.71 
 
 		 486 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6317  sodium/sulphate symporter  39.44 
 
 		 433 aa  286  8e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.190287  hitchhiker  0.00328538 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0255  sodium/sulphate symporter  39.37 
 
 		 486 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5900  sodium/sulphate symporter  32.39 
 
 		 465 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  normal  0.020602 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5677  sodium/sulphate symporter  32.49 
 
 		 465 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0143035  normal  0.0333919 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2659  sodium/sulphate symporter  25.47 
 
 		 463 aa  134  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2049  sodium/sulphate symporter  26.04 
 
 		 485 aa  109  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000525782  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0560  anion transporter  23.72 
 
 		 507 aa  106  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2193  sodium/solute symporter family protein  24.9 
 
 		 476 aa  105  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00348194  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2055  sodium/solute symporter family protein  24.36 
 
 		 476 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0229525  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2211  sodium/solute symporter family protein  24.36 
 
 		 476 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2239  sodium/solute symporter family protein  24.42 
 
 		 473 aa  101  4e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.93542e-30 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1564  anion transporter  25.53 
 
 		 493 aa  85.5  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.43197  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4560  sodium/sulphate symporter  29.84 
 
 		 555 aa  84.3  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.760965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3879  sodium/sulphate symporter  22.25 
 
 		 533 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3967  anion transporter  22.88 
 
 		 475 aa  76.3  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0787  sodium/sulphate symporter  23.1 
 
 		 491 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2094  sodium/sulphate symporter  22.18 
 
 		 466 aa  72.8  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0363  sodium/sulphate symporter  22.75 
 
 		 532 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288684  hitchhiker  0.00000731788 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0362  sodium/sulphate symporter  21.38 
 
 		 470 aa  71.2  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8313  anion transporter  24.75 
 
 		 491 aa  70.5  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572418  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0235  anion transporter  23.62 
 
 		 446 aa  67.8  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000069628  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3547  anion transporter  24.74 
 
 		 422 aa  67.4  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3654  anion transporter  24.87 
 
 		 422 aa  67  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3716  anion transporter  24.87 
 
 		 422 aa  66.6  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.672339 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3548  anion transporter  24.87 
 
 		 422 aa  67  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6918  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0348  anion transporter family protein  23.43 
 
 		 518 aa  65.5  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1663  permease  24.01 
 
 		 489 aa  65.5  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3619  anion transporter  24.87 
 
 		 422 aa  64.3  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.254252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2672  sodium/sulphate symporter  19.57 
 
 		 486 aa  64.3  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0442  anion transporter  23.32 
 
 		 486 aa  63.2  0.000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2490  anion transporter  21.2 
 
 		 463 aa  62.8  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0173335 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0714  anion transporter  21.32 
 
 		 517 aa  62.4  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0730  anion transporter  21.32 
 
 		 517 aa  62.4  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.597447  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1490  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  27.24 
 
 		 466 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0341  DASS family Na(+)/divalent anion symporter  23.11 
 
 		 514 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0364285  hitchhiker  0.00160481 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2238  anion transporter  21.76 
 
 		 510 aa  61.2  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.864259  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0043  anion transporter  23.79 
 
 		 470 aa  60.8  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2748  anion transporter  21.46 
 
 		 478 aa  60.8  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1953  anion transporter  23.17 
 
 		 489 aa  60.5  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312845  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0935  anion transporter  23.36 
 
 		 533 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0889  anion transporter  27.18 
 
 		 495 aa  58.9  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.517689  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4511  anion transporter  24.02 
 
 		 516 aa  58.9  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0037  anion transporter  23.32 
 
 		 470 aa  58.9  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2663  anion transporter  20.49 
 
 		 464 aa  58.5  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.392129  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1343  sodium/sulphate symporter  24.63 
 
 		 618 aa  58.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  24.68 
 
 		 619 aa  58.5  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1697  anion transporter  22.78 
 
 		 452 aa  57  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000215877  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4103  anion transporter  25.27 
 
 		 470 aa  56.2  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1435  sodium/sulphate symporter  21.62 
 
 		 568 aa  56.2  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.674057  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1560  anion transporter  20.09 
 
 		 465 aa  56.2  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251545  hitchhiker  0.000139905 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1717  anion transporter  22.17 
 
 		 458 aa  55.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1851  sodium/sulphate symporter  22.68 
 
 		 521 aa  55.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  20.95 
 
 		 459 aa  55.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2073  Na/dicarboxylate cotransporter-like protein  24.76 
 
 		 531 aa  55.1  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26980  anion transporter  24.37 
 
 		 499 aa  54.7  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3834  anion transporter  20.68 
 
 		 466 aa  54.3  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0281  anion transporter  24.31 
 
 		 505 aa  54.7  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0427  anion transporter  20.68 
 
 		 466 aa  54.7  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3907  anion transporter  20.68 
 
 		 466 aa  54.7  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4030  anion transporter  20.68 
 
 		 466 aa  54.7  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3393  anion transporter  20.1 
 
 		 466 aa  53.9  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0797  anion transporter  23.79 
 
 		 477 aa  53.9  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0516558  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0793  anion transporter  23.79 
 
 		 477 aa  53.9  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3094  anion transporter  20.37 
 
 		 464 aa  53.5  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.962564  hitchhiker  0.00000460999 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24780  anion transporter  28.77 
 
 		 502 aa  53.5  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2872  anion transporter  23.59 
 
 		 477 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.675436  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0874  anion transporter  23.59 
 
 		 477 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1123  anion transporter  25.21 
 
 		 660 aa  52.8  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0824  anion transporter  23.59 
 
 		 477 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.595752  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22550  anion transporter  25.14 
 
 		 517 aa  53.1  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2892  anion transporter  23.59 
 
 		 477 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.151263 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28272  DASS family transporter: 2-oxoglutarate/malate  26.62 
 
 		 527 aa  52.4  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.133761  normal  0.927166 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35420  Sodium/sulphate symporter-like protein  22.28 
 
 		 451 aa  51.6  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1204  di- and tricarboxylate transporters-like  19.63 
 
 		 461 aa  51.2  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.183982  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1802  anion transporter  27.53 
 
 		 487 aa  51.2  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.466043  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2485  anion transporter  21.86 
 
 		 483 aa  50.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0383  anion transporter  20 
 
 		 470 aa  50.4  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2328  anion transporter family protein  25 
 
 		 472 aa  50.1  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2459  anion transporter  27.61 
 
 		 513 aa  49.3  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.983995  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0221  anion transporter  22.52 
 
 		 460 aa  49.3  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1795  anion transporter  27.17 
 
 		 481 aa  48.9  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>