84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0483 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0255  sodium/sulphate symporter  88.68 
 
 		 486 aa  789    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0483  DASS family Na(+)/divalent anion symporter  100 
 
 		 486 aa  949    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5269  sodium/sulphate symporter  56.81 
 
 		 530 aa  520  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.438877 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1867  sodium/sulphate symporter  38.71 
 
 		 462 aa  318  1e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.970119  normal  0.269593 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2111  sodium/sulphate symporter  38.48 
 
 		 462 aa  318  2e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0268819 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2351  sodium/sulphate symporter  38.85 
 
 		 463 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.9001  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1922  sodium/sulphate symporter  39.17 
 
 		 462 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4053  sodium/sulphate symporter  42.35 
 
 		 434 aa  311  1e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2340  sodium/sulphate symporter  38.16 
 
 		 463 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2456  sodium/sulphate symporter  38.39 
 
 		 463 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.240991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2007  sodium/sulphate symporter  38.39 
 
 		 463 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000568868 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1559  sodium/sulphate symporter  44.12 
 
 		 502 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4275  sodium/sulphate symporter  43.1 
 
 		 441 aa  306  7e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.684538 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3599  sodium/sulphate symporter  42.37 
 
 		 441 aa  301  2e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.914538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0456  sodium/sulphate symporter  42.86 
 
 		 433 aa  300  4e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1909  sodium/sulphate symporter  36.89 
 
 		 463 aa  296  4e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3891  sodium/sulphate symporter  42.37 
 
 		 441 aa  293  4e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.351593  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43990  sodium/solute symporter protein  43.87 
 
 		 432 aa  288  2e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1482  sodium/sulphate symporter  36.15 
 
 		 478 aa  278  1e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0963428 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7176  sodium/sulphate symporter  42.41 
 
 		 433 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.692361  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6317  sodium/sulphate symporter  40.33 
 
 		 433 aa  262  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.190287  hitchhiker  0.00328538 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5677  sodium/sulphate symporter  32.72 
 
 		 465 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0143035  normal  0.0333919 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5900  sodium/sulphate symporter  32.55 
 
 		 465 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  normal  0.020602 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2659  sodium/sulphate symporter  29.16 
 
 		 463 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8313  anion transporter  25.12 
 
 		 491 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572418  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1564  anion transporter  23.99 
 
 		 493 aa  73.2  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.43197  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0348  anion transporter family protein  23.23 
 
 		 518 aa  71.2  0.00000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2672  sodium/sulphate symporter  22.72 
 
 		 486 aa  71.2  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0787  sodium/sulphate symporter  23.9 
 
 		 491 aa  70.5  0.00000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3879  sodium/sulphate symporter  22.44 
 
 		 533 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2049  sodium/sulphate symporter  21.26 
 
 		 485 aa  67  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000525782  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0730  anion transporter  21.72 
 
 		 517 aa  65.5  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.597447  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0714  anion transporter  21.72 
 
 		 517 aa  65.5  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2193  sodium/solute symporter family protein  23.53 
 
 		 476 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00348194  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2748  anion transporter  24.21 
 
 		 478 aa  63.9  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2238  anion transporter  22.89 
 
 		 510 aa  63.5  0.000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.864259  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2211  sodium/solute symporter family protein  23.24 
 
 		 476 aa  62.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1953  anion transporter  23.16 
 
 		 489 aa  62.8  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312845  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2239  sodium/solute symporter family protein  23.17 
 
 		 473 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.93542e-30 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2055  sodium/solute symporter family protein  23.24 
 
 		 476 aa  62.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0229525  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2094  sodium/sulphate symporter  23.03 
 
 		 466 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0341  DASS family Na(+)/divalent anion symporter  24.3 
 
 		 514 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0364285  hitchhiker  0.00160481 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0786  anion transporter  21.62 
 
 		 456 aa  60.1  0.00000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0362  sodium/sulphate symporter  24.14 
 
 		 470 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1252  cation transporter  24.02 
 
 		 448 aa  58.9  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1490  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  23.78 
 
 		 466 aa  58.2  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1435  sodium/sulphate symporter  24.31 
 
 		 568 aa  57.4  0.0000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.674057  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2490  anion transporter  21.98 
 
 		 463 aa  57.4  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0173335 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0363  sodium/sulphate symporter  22.55 
 
 		 532 aa  57  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288684  hitchhiker  0.00000731788 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0731  sodium:sulfate symporter family protein  27.61 
 
 		 487 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1663  permease  21.66 
 
 		 489 aa  55.5  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2267  Sodium/sulphate symporter  22.99 
 
 		 516 aa  54.7  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0413087 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2663  anion transporter  21.52 
 
 		 464 aa  53.9  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.392129  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00569  hypothetical protein  26.86 
 
 		 487 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3013  anion transporter  26.86 
 
 		 487 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0421609  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0700  sodium:sulfate symporter family protein  26.86 
 
 		 476 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00580  citrate:succinate antiporter  26.86 
 
 		 487 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3032  anion transporter  26.86 
 
 		 487 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1560  anion transporter  22.39 
 
 		 465 aa  52.8  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251545  hitchhiker  0.000139905 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0634  citrate transporter  26.86 
 
 		 487 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0663  sodium:sulfate symporter family protein  26.86 
 
 		 487 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0672  sodium:sulfate symporter family protein  27.36 
 
 		 487 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0560  anion transporter  22.71 
 
 		 507 aa  52.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  20.67 
 
 		 459 aa  52.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0777  sodium:sulfate symporter family protein  27.11 
 
 		 487 aa  51.2  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.406229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0658  sodium:sulfate symporter family protein  27.11 
 
 		 487 aa  51.2  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0383  anion transporter  20.49 
 
 		 470 aa  50.4  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1527  anion transporter  23.91 
 
 		 449 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.244841  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07320  anion transporter  23.7 
 
 		 526 aa  49.3  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.039375  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0235  anion transporter  23.42 
 
 		 446 aa  47.8  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000069628  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0043  anion transporter  23.41 
 
 		 470 aa  48.1  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0631  sodium:sulfate symporter family protein  25.87 
 
 		 476 aa  48.1  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3393  anion transporter  22.33 
 
 		 466 aa  47  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1734  anion transporter  22.5 
 
 		 483 aa  45.8  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0221  anion transporter  22.82 
 
 		 460 aa  45.4  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3936  anion transporter  22.7 
 
 		 482 aa  45.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603046  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0798  citrate transporter  24.17 
 
 		 446 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0037  anion transporter  22.68 
 
 		 470 aa  45.1  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4560  sodium/sulphate symporter  26.71 
 
 		 555 aa  44.7  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.760965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1204  di- and tricarboxylate transporters-like  22.17 
 
 		 461 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.183982  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1924  anion transporter  23.4 
 
 		 491 aa  44.3  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.200858  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0475  citrate transporter  26.79 
 
 		 632 aa  43.9  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  27.52 
 
 		 616 aa  43.9  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2485  anion transporter  21.75 
 
 		 483 aa  43.9  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>