139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0362 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0362  sodium/sulphate symporter  100 
 
 		 470 aa  926    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2094  sodium/sulphate symporter  32.39 
 
 		 466 aa  256  4e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2672  sodium/sulphate symporter  31.62 
 
 		 486 aa  252  9.000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1204  di- and tricarboxylate transporters-like  27.82 
 
 		 461 aa  151  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.183982  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2049  sodium/sulphate symporter  22.74 
 
 		 485 aa  104  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000525782  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1564  anion transporter  27.1 
 
 		 493 aa  97.1  6e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.43197  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0456  sodium/sulphate symporter  23.48 
 
 		 433 aa  96.3  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1435  sodium/sulphate symporter  26.5 
 
 		 568 aa  92  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.674057  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1510  hypothetical protein  26.27 
 
 		 522 aa  86.7  9e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.807629 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3599  sodium/sulphate symporter  23.26 
 
 		 441 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.914538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8313  anion transporter  25.61 
 
 		 491 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572418  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4275  sodium/sulphate symporter  23.49 
 
 		 441 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.684538 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5269  sodium/sulphate symporter  24.05 
 
 		 530 aa  85.1  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.438877 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43990  sodium/solute symporter protein  23.76 
 
 		 432 aa  83.6  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2490  anion transporter  24.34 
 
 		 463 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0173335 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3891  sodium/sulphate symporter  23.26 
 
 		 441 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.351593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0786  anion transporter  22.17 
 
 		 456 aa  80.9  0.00000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2659  sodium/sulphate symporter  25.34 
 
 		 463 aa  80.9  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0326  transmembrane transport proteins-like  27.25 
 
 		 491 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.677741  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  24.16 
 
 		 459 aa  79.3  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4053  sodium/sulphate symporter  24.49 
 
 		 434 aa  78.6  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2663  anion transporter  24.38 
 
 		 464 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.392129  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1867  sodium/sulphate symporter  21.11 
 
 		 462 aa  77  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.970119  normal  0.269593 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0341  DASS family Na(+)/divalent anion symporter  21.13 
 
 		 514 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0364285  hitchhiker  0.00160481 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1922  sodium/sulphate symporter  21.82 
 
 		 462 aa  77  0.0000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3879  sodium/sulphate symporter  24.5 
 
 		 533 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2111  sodium/sulphate symporter  21.05 
 
 		 462 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0268819 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2351  sodium/sulphate symporter  21.33 
 
 		 463 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.9001  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1560  anion transporter  22.34 
 
 		 465 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251545  hitchhiker  0.000139905 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0787  sodium/sulphate symporter  23.15 
 
 		 491 aa  74.3  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2340  sodium/sulphate symporter  21.33 
 
 		 463 aa  73.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1868  sodium/sulphate symporter  25.11 
 
 		 461 aa  73.2  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1663  permease  24.26 
 
 		 489 aa  72.8  0.00000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3574  anion transporter  22.85 
 
 		 467 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0451  anion transporter  22.85 
 
 		 466 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.865628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1988  anion transporter  24.1 
 
 		 482 aa  72.8  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.241159  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2456  sodium/sulphate symporter  20.85 
 
 		 463 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.240991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2007  sodium/sulphate symporter  20 
 
 		 463 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000568868 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0455  anion transporter  22.64 
 
 		 467 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1359  anion transporter  24.72 
 
 		 534 aa  70.5  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0884  anion transporter  21.55 
 
 		 456 aa  70.1  0.00000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195972  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0363  sodium/sulphate symporter  23.01 
 
 		 532 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288684  hitchhiker  0.00000731788 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2267  Sodium/sulphate symporter  23.77 
 
 		 516 aa  68.2  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0413087 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1482  sodium/sulphate symporter  21.69 
 
 		 478 aa  67.8  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0963428 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7176  sodium/sulphate symporter  23.53 
 
 		 433 aa  67.8  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.692361  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1909  sodium/sulphate symporter  20.96 
 
 		 463 aa  67  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0560  anion transporter  23.62 
 
 		 507 aa  66.6  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3393  anion transporter  22.17 
 
 		 466 aa  65.9  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2239  sodium/solute symporter family protein  22.83 
 
 		 473 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.93542e-30 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1559  sodium/sulphate symporter  22.17 
 
 		 502 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0794  sodium/sulphate symporter  27.4 
 
 		 490 aa  65.1  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000496756  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3094  anion transporter  22.92 
 
 		 464 aa  65.1  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.962564  hitchhiker  0.00000460999 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2055  sodium/solute symporter family protein  22.89 
 
 		 476 aa  64.3  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0229525  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2211  sodium/solute symporter family protein  22.89 
 
 		 476 aa  64.3  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3834  anion transporter  22.84 
 
 		 466 aa  63.9  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3907  anion transporter  22.84 
 
 		 466 aa  63.9  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4030  anion transporter  22.84 
 
 		 466 aa  63.9  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1145  conserved hypothetical protein, putative sodium/sulfate transporter  22.84 
 
 		 453 aa  63.5  0.000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00119531  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1946  anion transporter  26.1 
 
 		 502 aa  63.2  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0427  anion transporter  22.62 
 
 		 466 aa  63.2  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0108  NadC family protein  21.31 
 
 		 462 aa  61.6  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0714  anion transporter  23.12 
 
 		 517 aa  61.6  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0730  anion transporter  23.12 
 
 		 517 aa  61.6  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.597447  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0045  CitT protein  20.58 
 
 		 455 aa  61.6  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296324  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2193  sodium/solute symporter family protein  22.52 
 
 		 476 aa  60.5  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00348194  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2459  anion transporter  24.41 
 
 		 513 aa  60.5  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.983995  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0348  anion transporter family protein  23.06 
 
 		 518 aa  60.1  0.00000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26980  anion transporter  23.58 
 
 		 499 aa  59.7  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3949  anion transporter  24.05 
 
 		 484 aa  59.3  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0733465  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2574  anion transporter  27.09 
 
 		 534 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2619  anion transporter  27.09 
 
 		 534 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.243228  normal  0.988073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2613  anion transporter  27.09 
 
 		 534 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0828231  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3771  anion transporter  24.05 
 
 		 484 aa  58.2  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6317  sodium/sulphate symporter  20.57 
 
 		 433 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.190287  hitchhiker  0.00328538 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0370  anion transporter  22.44 
 
 		 484 aa  57.4  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35420  Sodium/sulphate symporter-like protein  25.31 
 
 		 451 aa  57  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3900  Sodium/sulphate symporter  26.34 
 
 		 501 aa  55.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1717  anion transporter  22.12 
 
 		 458 aa  55.1  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3967  anion transporter  23.54 
 
 		 475 aa  53.5  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5677  sodium/sulphate symporter  21.46 
 
 		 465 aa  53.5  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0143035  normal  0.0333919 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1252  cation transporter  21.32 
 
 		 448 aa  53.5  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1358  helix-turn-helix, AraC type  21.6 
 
 		 467 aa  52.8  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1482  anion transporter  25.1 
 
 		 473 aa  53.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.168166  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0686  anion transporter  23.19 
 
 		 478 aa  52.8  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0383  anion transporter  23.51 
 
 		 470 aa  52.4  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2748  anion transporter  23.56 
 
 		 478 aa  52.4  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5900  sodium/sulphate symporter  20.44 
 
 		 465 aa  51.6  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  normal  0.020602 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2238  anion transporter  22.99 
 
 		 510 aa  51.6  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.864259  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003739  di-and tricarboxylate transporter  20.84 
 
 		 456 aa  51.6  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45173  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1123  anion transporter  24.13 
 
 		 660 aa  51.6  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0349  anion transporter  21.08 
 
 		 490 aa  51.2  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000240953  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1991  anion transporter  23.39 
 
 		 483 aa  51.2  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000356301  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0235  anion transporter  24.82 
 
 		 446 aa  50.8  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000069628  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1490  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  24.52 
 
 		 466 aa  50.4  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0923  anion transporter  25.38 
 
 		 489 aa  50.1  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1872  sodium/sulphate symporter  23.82 
 
 		 461 aa  50.1  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1274  anion transporter  24.92 
 
 		 469 aa  49.3  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0015  anion transporter  23.72 
 
 		 475 aa  48.9  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00186698  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1972  anion transporter  28.4 
 
 		 520 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2006  anion transporter  28.4 
 
 		 520 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.740344  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>