79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5269 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5269  sodium/sulphate symporter  100 
 
 		 530 aa  1038    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.438877 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0255  sodium/sulphate symporter  57.2 
 
 		 486 aa  476  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0483  DASS family Na(+)/divalent anion symporter  56.81 
 
 		 486 aa  476  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1922  sodium/sulphate symporter  42.14 
 
 		 462 aa  349  8e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2111  sodium/sulphate symporter  41.05 
 
 		 462 aa  347  3e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0268819 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1867  sodium/sulphate symporter  40.7 
 
 		 462 aa  344  2e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.970119  normal  0.269593 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2340  sodium/sulphate symporter  42.07 
 
 		 463 aa  342  1e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1559  sodium/sulphate symporter  45.56 
 
 		 502 aa  339  5.9999999999999996e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2351  sodium/sulphate symporter  41.38 
 
 		 463 aa  339  8e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.9001  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2456  sodium/sulphate symporter  41.61 
 
 		 463 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.240991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2007  sodium/sulphate symporter  41.15 
 
 		 463 aa  335  1e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000568868 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4053  sodium/sulphate symporter  44.84 
 
 		 434 aa  329  7e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1909  sodium/sulphate symporter  40.23 
 
 		 463 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43990  sodium/solute symporter protein  45.67 
 
 		 432 aa  316  8e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6317  sodium/sulphate symporter  45.5 
 
 		 433 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.190287  hitchhiker  0.00328538 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3599  sodium/sulphate symporter  41.55 
 
 		 441 aa  297  3e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.914538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0456  sodium/sulphate symporter  41.23 
 
 		 433 aa  297  4e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7176  sodium/sulphate symporter  45.83 
 
 		 433 aa  295  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.692361  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1482  sodium/sulphate symporter  36.38 
 
 		 478 aa  295  2e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0963428 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4275  sodium/sulphate symporter  41.15 
 
 		 441 aa  295  2e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.684538 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3891  sodium/sulphate symporter  41.55 
 
 		 441 aa  288  1e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.351593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5900  sodium/sulphate symporter  31.43 
 
 		 465 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  normal  0.020602 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5677  sodium/sulphate symporter  30.8 
 
 		 465 aa  188  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0143035  normal  0.0333919 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2659  sodium/sulphate symporter  26.99 
 
 		 463 aa  124  5e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2049  sodium/sulphate symporter  24.7 
 
 		 485 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000525782  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0362  sodium/sulphate symporter  23.64 
 
 		 470 aa  80.9  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8313  anion transporter  26.89 
 
 		 491 aa  77  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572418  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1663  permease  25.82 
 
 		 489 aa  74.7  0.000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1564  anion transporter  25.5 
 
 		 493 aa  73.9  0.000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.43197  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3879  sodium/sulphate symporter  23.88 
 
 		 533 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2211  sodium/solute symporter family protein  24.49 
 
 		 476 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2055  sodium/solute symporter family protein  24.49 
 
 		 476 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0229525  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0341  DASS family Na(+)/divalent anion symporter  25.12 
 
 		 514 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0364285  hitchhiker  0.00160481 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2239  sodium/solute symporter family protein  24.49 
 
 		 473 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.93542e-30 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2193  sodium/solute symporter family protein  24.15 
 
 		 476 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00348194  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2672  sodium/sulphate symporter  22.6 
 
 		 486 aa  67.4  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0787  sodium/sulphate symporter  25.26 
 
 		 491 aa  64.7  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2094  sodium/sulphate symporter  22.79 
 
 		 466 aa  63.2  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1490  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  26.75 
 
 		 466 aa  62  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0560  anion transporter  23.23 
 
 		 507 aa  59.3  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0363  sodium/sulphate symporter  22.58 
 
 		 532 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288684  hitchhiker  0.00000731788 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2490  anion transporter  21.36 
 
 		 463 aa  58.9  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0173335 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1560  anion transporter  22.14 
 
 		 465 aa  58.5  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251545  hitchhiker  0.000139905 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1953  anion transporter  23.81 
 
 		 489 aa  57.8  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312845  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0348  anion transporter family protein  23.19 
 
 		 518 aa  56.2  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2238  anion transporter  26.06 
 
 		 510 aa  55.8  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.864259  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2041  sodium/sulphate symporter  22.8 
 
 		 488 aa  53.5  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.341922  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2663  anion transporter  20.08 
 
 		 464 aa  52.4  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.392129  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4560  sodium/sulphate symporter  25.09 
 
 		 555 aa  52  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.760965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1435  sodium/sulphate symporter  23 
 
 		 568 aa  51.6  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.674057  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0730  anion transporter  20.25 
 
 		 517 aa  50.8  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.597447  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0714  anion transporter  20.25 
 
 		 517 aa  50.8  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2748  anion transporter  24.08 
 
 		 478 aa  50.4  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2078  anion transporter  25.51 
 
 		 486 aa  49.7  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3834  anion transporter  21.16 
 
 		 466 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0427  anion transporter  21.16 
 
 		 466 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3393  anion transporter  21.1 
 
 		 466 aa  49.3  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1204  di- and tricarboxylate transporters-like  21.86 
 
 		 461 aa  49.3  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.183982  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3907  anion transporter  21.16 
 
 		 466 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4030  anion transporter  21.16 
 
 		 466 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3094  anion transporter  21.64 
 
 		 464 aa  48.1  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.962564  hitchhiker  0.00000460999 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4511  anion transporter  24.58 
 
 		 516 aa  47  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0015  anion transporter  25.96 
 
 		 475 aa  47  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00186698  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3547  anion transporter  23.12 
 
 		 422 aa  47  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0281  anion transporter  25.75 
 
 		 505 aa  46.2  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0455  anion transporter  21.84 
 
 		 467 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0889  anion transporter  25.65 
 
 		 495 aa  45.8  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.517689  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0442  anion transporter  21.79 
 
 		 486 aa  45.8  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0451  anion transporter  21.45 
 
 		 466 aa  45.1  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.865628  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1482  anion transporter  23.64 
 
 		 473 aa  45.1  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.168166  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3574  anion transporter  21.84 
 
 		 467 aa  44.7  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1465  anion transporter  27.18 
 
 		 490 aa  44.7  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07320  anion transporter  22.19 
 
 		 526 aa  44.7  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.039375  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3716  anion transporter  24.08 
 
 		 422 aa  44.3  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.672339 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3548  anion transporter  24.08 
 
 		 422 aa  44.3  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3654  anion transporter  24.08 
 
 		 422 aa  44.3  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3619  anion transporter  24.08 
 
 		 422 aa  44.3  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.254252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0506  di- and tricarboxylate transporter  24.39 
 
 		 479 aa  43.9  0.008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2627  anion transporter  25.24 
 
 		 607 aa  43.5  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>