95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0255 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0483  DASS family Na(+)/divalent anion symporter  88.68 
 
 
486 aa  790    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0255  sodium/sulphate symporter  100 
 
 
486 aa  951    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5269  sodium/sulphate symporter  57.2 
 
 
530 aa  519  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.438877 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1867  sodium/sulphate symporter  39.17 
 
 
462 aa  319  7e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.970119  normal  0.269593 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2111  sodium/sulphate symporter  38.94 
 
 
462 aa  316  5e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0268819 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0456  sodium/sulphate symporter  45.04 
 
 
433 aa  311  1e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156875  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2351  sodium/sulphate symporter  38.89 
 
 
463 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.9001  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1922  sodium/sulphate symporter  39.86 
 
 
462 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2456  sodium/sulphate symporter  38.43 
 
 
463 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.240991  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1909  sodium/sulphate symporter  38.05 
 
 
463 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4275  sodium/sulphate symporter  44.23 
 
 
441 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.684538 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2340  sodium/sulphate symporter  38.43 
 
 
463 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4053  sodium/sulphate symporter  41.55 
 
 
434 aa  308  2.0000000000000002e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3599  sodium/sulphate symporter  43.61 
 
 
441 aa  306  6e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.914538  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2007  sodium/sulphate symporter  38.43 
 
 
463 aa  306  7e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000568868 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1559  sodium/sulphate symporter  44.36 
 
 
502 aa  301  3e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3891  sodium/sulphate symporter  43.61 
 
 
441 aa  299  6e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.351593  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43990  sodium/solute symporter protein  44.18 
 
 
432 aa  288  1e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1482  sodium/sulphate symporter  35.6 
 
 
478 aa  273  6e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0963428 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7176  sodium/sulphate symporter  42.89 
 
 
433 aa  272  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.692361  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6317  sodium/sulphate symporter  41.57 
 
 
433 aa  265  2e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.190287  hitchhiker  0.00328538 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5677  sodium/sulphate symporter  32.47 
 
 
465 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0143035  normal  0.0333919 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5900  sodium/sulphate symporter  32.71 
 
 
465 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  normal  0.020602 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2659  sodium/sulphate symporter  27.27 
 
 
463 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1564  anion transporter  24.68 
 
 
493 aa  74.3  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.43197  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2239  sodium/solute symporter family protein  24.71 
 
 
473 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.93542e-30 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2055  sodium/solute symporter family protein  25.45 
 
 
476 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0229525  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2211  sodium/solute symporter family protein  25.45 
 
 
476 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8313  anion transporter  26.51 
 
 
491 aa  70.5  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572418  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2672  sodium/sulphate symporter  22.22 
 
 
486 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0731  sodium:sulfate symporter family protein  27.43 
 
 
487 aa  69.7  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2193  sodium/solute symporter family protein  24.73 
 
 
476 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00348194  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2049  sodium/sulphate symporter  20 
 
 
485 aa  68.2  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000525782  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0672  sodium:sulfate symporter family protein  27.18 
 
 
487 aa  66.6  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0658  sodium:sulfate symporter family protein  26.93 
 
 
487 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0787  sodium/sulphate symporter  22.99 
 
 
491 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0777  sodium:sulfate symporter family protein  26.93 
 
 
487 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.406229  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3879  sodium/sulphate symporter  21.88 
 
 
533 aa  65.9  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0700  sodium:sulfate symporter family protein  26.68 
 
 
476 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3032  anion transporter  26.68 
 
 
487 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0634  citrate transporter  26.68 
 
 
487 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0663  sodium:sulfate symporter family protein  26.68 
 
 
487 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00569  hypothetical protein  26.68 
 
 
487 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3013  anion transporter  26.68 
 
 
487 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0421609  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00580  citrate:succinate antiporter  26.68 
 
 
487 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2238  anion transporter  23.4 
 
 
510 aa  61.6  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.864259  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0341  DASS family Na(+)/divalent anion symporter  22.76 
 
 
514 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0364285  hitchhiker  0.00160481 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2094  sodium/sulphate symporter  23.72 
 
 
466 aa  60.1  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0631  sodium:sulfate symporter family protein  26.18 
 
 
476 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2748  anion transporter  23.81 
 
 
478 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1252  cation transporter  23.24 
 
 
448 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1435  sodium/sulphate symporter  23.03 
 
 
568 aa  58.5  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.674057  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1560  anion transporter  21.78 
 
 
465 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251545  hitchhiker  0.000139905 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2663  anion transporter  21.25 
 
 
464 aa  56.6  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.392129  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1663  permease  22.85 
 
 
489 aa  56.6  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0363  sodium/sulphate symporter  22.35 
 
 
532 aa  56.2  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288684  hitchhiker  0.00000731788 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2490  anion transporter  21.47 
 
 
463 aa  55.8  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0173335 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0455  anion transporter  22.13 
 
 
467 aa  55.1  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3574  anion transporter  22.13 
 
 
467 aa  54.3  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0730  anion transporter  20.86 
 
 
517 aa  53.9  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.597447  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0714  anion transporter  20.86 
 
 
517 aa  53.9  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1953  anion transporter  20.73 
 
 
489 aa  53.1  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312845  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0348  anion transporter family protein  21.55 
 
 
518 aa  52.4  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3393  anion transporter  22.56 
 
 
466 aa  52.8  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1204  di- and tricarboxylate transporters-like  21.86 
 
 
461 aa  52  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.183982  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1490  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  21.01 
 
 
466 aa  50.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2559  anion transporter  24.76 
 
 
502 aa  50.1  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.133462  normal  0.0525533 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0362  sodium/sulphate symporter  23.59 
 
 
470 aa  50.1  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0786  anion transporter  20.86 
 
 
456 aa  49.7  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0451  anion transporter  21.71 
 
 
466 aa  50.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.865628  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  29.44 
 
 
613 aa  49.3  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  21.3 
 
 
459 aa  49.3  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0235  anion transporter  24.06 
 
 
446 aa  48.9  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000069628  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3834  anion transporter  21.04 
 
 
466 aa  47.8  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1734  anion transporter  22.94 
 
 
483 aa  47.8  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0427  anion transporter  21.04 
 
 
466 aa  47.8  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3907  anion transporter  20.83 
 
 
466 aa  47.4  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0221  anion transporter  23.26 
 
 
460 aa  47.4  0.0006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4030  anion transporter  20.83 
 
 
466 aa  47.4  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3094  anion transporter  21.48 
 
 
464 aa  47  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.962564  hitchhiker  0.00000460999 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2485  anion transporter  22.94 
 
 
483 aa  46.2  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0884  anion transporter  21.41 
 
 
456 aa  45.8  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195972  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0219  NadC family transporter  20.83 
 
 
462 aa  45.4  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000102508  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3165  anion transporter  24.75 
 
 
487 aa  45.8  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2073  Na/dicarboxylate cotransporter-like protein  23.99 
 
 
531 aa  45.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0015  anion transporter  21.97 
 
 
475 aa  45.8  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00186698  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1527  anion transporter  23.91 
 
 
449 aa  45.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.244841  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4103  anion transporter  25 
 
 
470 aa  45.4  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0706  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  23.53 
 
 
459 aa  45.1  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2561  anion transporter  24.62 
 
 
466 aa  45.1  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.890492  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0383  anion transporter  19.05 
 
 
470 aa  44.7  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2267  Sodium/sulphate symporter  23.66 
 
 
516 aa  44.3  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0413087 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3936  anion transporter  21.97 
 
 
482 aa  43.9  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603046  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1826  arsenical pump membrane protein  25.33 
 
 
430 aa  43.1  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1861  arsenical pump membrane protein  25.33 
 
 
430 aa  43.1  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>