90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2094 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_2094  sodium/sulphate symporter  100 
 
 
466 aa  931    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0362  sodium/sulphate symporter  32.39 
 
 
470 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2672  sodium/sulphate symporter  28.54 
 
 
486 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1204  di- and tricarboxylate transporters-like  28.5 
 
 
461 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.183982  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0456  sodium/sulphate symporter  25.99 
 
 
433 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156875  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0787  sodium/sulphate symporter  24.57 
 
 
491 aa  90.5  6e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2049  sodium/sulphate symporter  24.08 
 
 
485 aa  90.1  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000525782  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1559  sodium/sulphate symporter  26.52 
 
 
502 aa  89.7  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1909  sodium/sulphate symporter  23.16 
 
 
463 aa  88.2  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2456  sodium/sulphate symporter  22.11 
 
 
463 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.240991  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2351  sodium/sulphate symporter  21.75 
 
 
463 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.9001  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2340  sodium/sulphate symporter  21.75 
 
 
463 aa  80.1  0.00000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2007  sodium/sulphate symporter  21.75 
 
 
463 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000568868 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1482  sodium/sulphate symporter  23.75 
 
 
478 aa  78.2  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0963428 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2055  sodium/solute symporter family protein  20.9 
 
 
476 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0229525  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2211  sodium/solute symporter family protein  20.9 
 
 
476 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2239  sodium/solute symporter family protein  20.34 
 
 
473 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.93542e-30 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1867  sodium/sulphate symporter  22.18 
 
 
462 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.970119  normal  0.269593 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2111  sodium/sulphate symporter  22.18 
 
 
462 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0268819 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0341  DASS family Na(+)/divalent anion symporter  23.56 
 
 
514 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0364285  hitchhiker  0.00160481 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0383  anion transporter  24.01 
 
 
470 aa  69.7  0.00000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1564  anion transporter  23.8 
 
 
493 aa  69.3  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.43197  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0730  anion transporter  22.31 
 
 
517 aa  68.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.597447  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0714  anion transporter  22.31 
 
 
517 aa  68.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1922  sodium/sulphate symporter  21.77 
 
 
462 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0348  anion transporter family protein  21.96 
 
 
518 aa  67.4  0.0000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2193  sodium/solute symporter family protein  19.33 
 
 
476 aa  67  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00348194  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5269  sodium/sulphate symporter  22.79 
 
 
530 aa  63.2  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.438877 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0560  anion transporter  24.76 
 
 
507 aa  62  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1435  sodium/sulphate symporter  23.95 
 
 
568 aa  61.2  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.674057  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2238  anion transporter  27.52 
 
 
510 aa  61.6  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.864259  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5900  sodium/sulphate symporter  23.64 
 
 
465 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  normal  0.020602 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07320  anion transporter  25.68 
 
 
526 aa  58.9  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.039375  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5677  sodium/sulphate symporter  23.64 
 
 
465 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0143035  normal  0.0333919 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3599  sodium/sulphate symporter  25.09 
 
 
441 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.914538  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1953  anion transporter  21.19 
 
 
489 aa  57.8  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312845  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49439  DASS family transporter: 2-oxoglutarate/malate  26.06 
 
 
414 aa  56.6  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.315345  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4275  sodium/sulphate symporter  24.01 
 
 
441 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.684538 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2748  anion transporter  25.57 
 
 
478 aa  55.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43990  sodium/solute symporter protein  23.29 
 
 
432 aa  54.7  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0686  anion transporter  21.71 
 
 
478 aa  52.4  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0326  transmembrane transport proteins-like  18.46 
 
 
491 aa  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.677741  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2659  sodium/sulphate symporter  22.7 
 
 
463 aa  51.6  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35420  Sodium/sulphate symporter-like protein  22.65 
 
 
451 aa  51.6  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3891  sodium/sulphate symporter  24.37 
 
 
441 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.351593  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3949  anion transporter  28.27 
 
 
484 aa  51.6  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0733465  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1482  anion transporter  28.65 
 
 
473 aa  50.8  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.168166  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0281  anion transporter  25.7 
 
 
505 aa  50.8  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3771  anion transporter  27.17 
 
 
484 aa  50.8  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2725  anion transporter  23.94 
 
 
469 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0162733 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0370  anion transporter  28.1 
 
 
484 aa  48.9  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0700  sodium:sulfate symporter family protein  22.28 
 
 
476 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3032  anion transporter  22.28 
 
 
487 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0634  citrate transporter  22.28 
 
 
487 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0663  sodium:sulfate symporter family protein  22.28 
 
 
487 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00569  hypothetical protein  22.28 
 
 
487 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3013  anion transporter  22.28 
 
 
487 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0421609  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00580  citrate:succinate antiporter  22.28 
 
 
487 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0069  anion transporter  25.93 
 
 
572 aa  47.8  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0938  anion transporter  24.83 
 
 
492 aa  47.4  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.842448 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6317  sodium/sulphate symporter  23.23 
 
 
433 aa  47  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.190287  hitchhiker  0.00328538 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2328  anion transporter family protein  25.54 
 
 
472 aa  47  0.0008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2872  anion transporter  21.59 
 
 
477 aa  46.2  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.675436  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0015  anion transporter  25 
 
 
475 aa  46.2  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00186698  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0631  sodium:sulfate symporter family protein  22.83 
 
 
476 aa  46.6  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2892  anion transporter  21.59 
 
 
477 aa  46.2  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.151263 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0824  anion transporter  21.59 
 
 
477 aa  46.2  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.595752  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0797  anion transporter  21.59 
 
 
477 aa  45.8  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0516558  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0658  sodium:sulfate symporter family protein  23.17 
 
 
487 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0777  sodium:sulfate symporter family protein  23.17 
 
 
487 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.406229  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0793  anion transporter  21.59 
 
 
477 aa  45.8  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575691  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2561  anion transporter  24.12 
 
 
466 aa  45.1  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.890492  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0874  anion transporter  21.21 
 
 
477 aa  45.1  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3967  anion transporter  24.03 
 
 
475 aa  45.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0037  anion transporter  24.77 
 
 
470 aa  45.1  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0672  sodium:sulfate symporter family protein  22.92 
 
 
487 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2006  anion transporter  23.05 
 
 
520 aa  44.7  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.740344  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1972  anion transporter  23.05 
 
 
520 aa  44.7  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3879  sodium/sulphate symporter  19.87 
 
 
533 aa  44.7  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1123  anion transporter  22.68 
 
 
660 aa  44.7  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8313  anion transporter  23.78 
 
 
491 aa  44.3  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572418  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0483  DASS family Na(+)/divalent anion symporter  24.09 
 
 
486 aa  44.3  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3165  anion transporter  26.52 
 
 
487 aa  43.9  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0731  sodium:sulfate symporter family protein  22.92 
 
 
487 aa  43.9  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0104  anion transporter  21.95 
 
 
476 aa  43.5  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4122  anion transporter  19.77 
 
 
475 aa  43.9  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0043  anion transporter  24.32 
 
 
470 aa  43.5  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1802  anion transporter  26.46 
 
 
487 aa  43.1  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.466043  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4103  anion transporter  24.55 
 
 
470 aa  43.1  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1510  hypothetical protein  27.45 
 
 
522 aa  43.1  0.01  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.807629 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>