135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1909 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1867  sodium/sulphate symporter  76.2 
 
 		 462 aa  703    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.970119  normal  0.269593 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2111  sodium/sulphate symporter  76.64 
 
 		 462 aa  705    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0268819 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1922  sodium/sulphate symporter  75.55 
 
 		 462 aa  687    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2351  sodium/sulphate symporter  82.9 
 
 		 463 aa  745    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.9001  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1909  sodium/sulphate symporter  100 
 
 		 463 aa  910    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2340  sodium/sulphate symporter  82.9 
 
 		 463 aa  745    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2456  sodium/sulphate symporter  82.9 
 
 		 463 aa  746    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.240991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2007  sodium/sulphate symporter  83.33 
 
 		 463 aa  748    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000568868 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5269  sodium/sulphate symporter  40.23 
 
 		 530 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.438877 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4053  sodium/sulphate symporter  38.24 
 
 		 434 aa  314  2.9999999999999996e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0456  sodium/sulphate symporter  38.14 
 
 		 433 aa  310  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1482  sodium/sulphate symporter  37.56 
 
 		 478 aa  310  5e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0963428 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43990  sodium/solute symporter protein  39.67 
 
 		 432 aa  309  5.9999999999999995e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3599  sodium/sulphate symporter  38.41 
 
 		 441 aa  301  2e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.914538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4275  sodium/sulphate symporter  38.41 
 
 		 441 aa  301  2e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.684538 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1559  sodium/sulphate symporter  39.32 
 
 		 502 aa  298  1e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3891  sodium/sulphate symporter  37.94 
 
 		 441 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.351593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7176  sodium/sulphate symporter  37.95 
 
 		 433 aa  278  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.692361  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6317  sodium/sulphate symporter  37.35 
 
 		 433 aa  278  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.190287  hitchhiker  0.00328538 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0255  sodium/sulphate symporter  38.05 
 
 		 486 aa  270  5e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0483  DASS family Na(+)/divalent anion symporter  36.64 
 
 		 486 aa  261  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5900  sodium/sulphate symporter  31.15 
 
 		 465 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  normal  0.020602 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5677  sodium/sulphate symporter  30.94 
 
 		 465 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0143035  normal  0.0333919 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2659  sodium/sulphate symporter  25.53 
 
 		 463 aa  135  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2055  sodium/solute symporter family protein  27.08 
 
 		 476 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0229525  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2211  sodium/solute symporter family protein  27.08 
 
 		 476 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2049  sodium/sulphate symporter  25.55 
 
 		 485 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000525782  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2239  sodium/solute symporter family protein  27.38 
 
 		 473 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.93542e-30 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2193  sodium/solute symporter family protein  25.89 
 
 		 476 aa  106  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00348194  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0560  anion transporter  26.4 
 
 		 507 aa  97.1  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2094  sodium/sulphate symporter  23.16 
 
 		 466 aa  88.2  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1564  anion transporter  25.28 
 
 		 493 aa  84.7  0.000000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.43197  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4560  sodium/sulphate symporter  29.48 
 
 		 555 aa  82.8  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.760965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3879  sodium/sulphate symporter  21.32 
 
 		 533 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3654  anion transporter  24.18 
 
 		 422 aa  70.9  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3548  anion transporter  24.18 
 
 		 422 aa  70.9  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0363  sodium/sulphate symporter  22.15 
 
 		 532 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288684  hitchhiker  0.00000731788 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3716  anion transporter  24.18 
 
 		 422 aa  70.5  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.672339 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0235  anion transporter  26.61 
 
 		 446 aa  70.1  0.00000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000069628  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8313  anion transporter  21.39 
 
 		 491 aa  70.1  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572418  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3547  anion transporter  23.88 
 
 		 422 aa  70.1  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1663  permease  24.29 
 
 		 489 aa  68.9  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2238  anion transporter  22.44 
 
 		 510 aa  68.9  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.864259  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3619  anion transporter  23.88 
 
 		 422 aa  67  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.254252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2748  anion transporter  22.11 
 
 		 478 aa  67  0.0000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4103  anion transporter  26.45 
 
 		 470 aa  67  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0442  anion transporter  25.12 
 
 		 486 aa  66.2  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0787  sodium/sulphate symporter  20.51 
 
 		 491 aa  65.1  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0348  anion transporter family protein  23.43 
 
 		 518 aa  64.3  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2672  sodium/sulphate symporter  21.73 
 
 		 486 aa  64.3  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0714  anion transporter  21.87 
 
 		 517 aa  64.7  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0730  anion transporter  21.87 
 
 		 517 aa  64.7  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.597447  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0043  anion transporter  25.78 
 
 		 470 aa  64.3  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1953  anion transporter  21.68 
 
 		 489 aa  63.5  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312845  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3967  anion transporter  21.51 
 
 		 475 aa  62.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0037  anion transporter  25.83 
 
 		 470 aa  62.8  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0362  sodium/sulphate symporter  20.96 
 
 		 470 aa  61.6  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1435  sodium/sulphate symporter  23.38 
 
 		 568 aa  61.2  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.674057  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35420  Sodium/sulphate symporter-like protein  23.19 
 
 		 451 aa  60.5  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0341  DASS family Na(+)/divalent anion symporter  22.22 
 
 		 514 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0364285  hitchhiker  0.00160481 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3393  anion transporter  20.5 
 
 		 466 aa  57.4  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  21.15 
 
 		 459 aa  57  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0281  anion transporter  25.36 
 
 		 505 aa  56.6  0.0000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0935  anion transporter  23.11 
 
 		 533 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0889  anion transporter  24 
 
 		 495 aa  55.1  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.517689  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2490  anion transporter  20.59 
 
 		 463 aa  54.3  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0173335 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2078  anion transporter  22.61 
 
 		 486 aa  54.3  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2766  anion transporter  24.09 
 
 		 490 aa  53.9  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.133589 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1560  anion transporter  20.24 
 
 		 465 aa  53.9  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251545  hitchhiker  0.000139905 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4931  sodium/sulphate symporter  27.76 
 
 		 486 aa  53.9  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1204  di- and tricarboxylate transporters-like  18.96 
 
 		 461 aa  53.5  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.183982  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2328  anion transporter family protein  22.22 
 
 		 472 aa  52.8  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0150  anion transporter  22.77 
 
 		 531 aa  53.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1490  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  23.46 
 
 		 466 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4511  anion transporter  24.56 
 
 		 516 aa  52  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2446  Sodium/sulphate symporter  24.41 
 
 		 491 aa  52.4  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2459  anion transporter  20.83 
 
 		 483 aa  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0884  anion transporter  20.49 
 
 		 456 aa  52  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195972  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2073  Na/dicarboxylate cotransporter-like protein  25.16 
 
 		 531 aa  51.6  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3936  anion transporter  22.16 
 
 		 482 aa  51.6  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603046  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24780  anion transporter  25.12 
 
 		 502 aa  51.6  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0221  anion transporter  20.73 
 
 		 460 aa  51.2  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2485  anion transporter  23.87 
 
 		 483 aa  51.2  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2009  anion transporter  24.04 
 
 		 483 aa  50.8  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22550  anion transporter  24.14 
 
 		 517 aa  50.4  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1529  anion transporter  22.45 
 
 		 473 aa  50.4  0.00007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00336443  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0347  anion transporter  31.37 
 
 		 467 aa  49.7  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26970  anion transporter  25.28 
 
 		 517 aa  50.1  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2627  anion transporter  26.43 
 
 		 607 aa  49.3  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1717  anion transporter  21.83 
 
 		 458 aa  48.5  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0349  anion transporter  23.35 
 
 		 490 aa  48.9  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000240953  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0893  anion transporter  20.5 
 
 		 536 aa  48.5  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2412  anion transporter  29.7 
 
 		 481 aa  48.5  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.570521  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1936  anion transporter  24.41 
 
 		 493 aa  48.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0197224  normal  0.483122 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28272  DASS family transporter: 2-oxoglutarate/malate  34.78 
 
 		 527 aa  48.1  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.133761  normal  0.927166 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  23.53 
 
 		 619 aa  48.5  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1851  sodium/sulphate symporter  21.81 
 
 		 521 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1123  anion transporter  25.42 
 
 		 660 aa  48.5  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1734  anion transporter  23.14 
 
 		 483 aa  47.8  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0506  di- and tricarboxylate transporter  23.97 
 
 		 479 aa  47.4  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>