154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7176 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7176  sodium/sulphate symporter  100 
 
 		 433 aa  822    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.692361  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6317  sodium/sulphate symporter  86.34 
 
 		 433 aa  676    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.190287  hitchhiker  0.00328538 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43990  sodium/solute symporter protein  73.56 
 
 		 432 aa  553  1e-156  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4053  sodium/sulphate symporter  58.12 
 
 		 434 aa  497  1e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4275  sodium/sulphate symporter  50.23 
 
 		 441 aa  379  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.684538 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0456  sodium/sulphate symporter  52.42 
 
 		 433 aa  377  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3599  sodium/sulphate symporter  49.19 
 
 		 441 aa  364  2e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.914538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3891  sodium/sulphate symporter  49.19 
 
 		 441 aa  350  4e-95  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.351593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2340  sodium/sulphate symporter  40.86 
 
 		 463 aa  323  3e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2351  sodium/sulphate symporter  40.38 
 
 		 463 aa  322  6e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.9001  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2111  sodium/sulphate symporter  40.24 
 
 		 462 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0268819 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5269  sodium/sulphate symporter  45.83 
 
 		 530 aa  320  3e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.438877 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1867  sodium/sulphate symporter  40 
 
 		 462 aa  318  1e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.970119  normal  0.269593 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2007  sodium/sulphate symporter  40.14 
 
 		 463 aa  317  2e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000568868 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2456  sodium/sulphate symporter  39.9 
 
 		 463 aa  318  2e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.240991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1909  sodium/sulphate symporter  38.19 
 
 		 463 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1922  sodium/sulphate symporter  40.95 
 
 		 462 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1559  sodium/sulphate symporter  42.63 
 
 		 502 aa  276  7e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0255  sodium/sulphate symporter  43.13 
 
 		 486 aa  272  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1482  sodium/sulphate symporter  37.5 
 
 		 478 aa  267  2e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0963428 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0483  DASS family Na(+)/divalent anion symporter  42.41 
 
 		 486 aa  266  7e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5677  sodium/sulphate symporter  35.95 
 
 		 465 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0143035  normal  0.0333919 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5900  sodium/sulphate symporter  36.45 
 
 		 465 aa  213  7e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  normal  0.020602 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2659  sodium/sulphate symporter  30.17 
 
 		 463 aa  162  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2049  sodium/sulphate symporter  24.67 
 
 		 485 aa  88.2  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000525782  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4560  sodium/sulphate symporter  32.45 
 
 		 555 aa  86.7  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.760965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1564  anion transporter  25.4 
 
 		 493 aa  83.2  0.000000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.43197  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8313  anion transporter  26.34 
 
 		 491 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572418  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2672  sodium/sulphate symporter  25.29 
 
 		 486 aa  82  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0787  sodium/sulphate symporter  25.5 
 
 		 491 aa  81.6  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3879  sodium/sulphate symporter  20.99 
 
 		 533 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0560  anion transporter  25.37 
 
 		 507 aa  78.6  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1663  permease  23.71 
 
 		 489 aa  79  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2193  sodium/solute symporter family protein  24.07 
 
 		 476 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00348194  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2055  sodium/solute symporter family protein  24.75 
 
 		 476 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0229525  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2211  sodium/solute symporter family protein  24.75 
 
 		 476 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2239  sodium/solute symporter family protein  23.26 
 
 		 473 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.93542e-30 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0362  sodium/sulphate symporter  23.1 
 
 		 470 aa  73.9  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3547  anion transporter  23.73 
 
 		 422 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  22.52 
 
 		 459 aa  70.5  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3654  anion transporter  24.27 
 
 		 422 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3619  anion transporter  24.27 
 
 		 422 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.254252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3548  anion transporter  24.27 
 
 		 422 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0092  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  24.94 
 
 		 475 aa  69.7  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3716  anion transporter  24.27 
 
 		 422 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.672339 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0091  divalent anion:Na+ symporter family protein  24.94 
 
 		 475 aa  69.7  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4122  anion transporter  24.7 
 
 		 475 aa  69.3  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0341  DASS family Na(+)/divalent anion symporter  25.93 
 
 		 514 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0364285  hitchhiker  0.00160481 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0363  sodium/sulphate symporter  22.15 
 
 		 532 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288684  hitchhiker  0.00000731788 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3967  anion transporter  25.22 
 
 		 475 aa  65.1  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1490  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  25 
 
 		 466 aa  65.1  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1435  sodium/sulphate symporter  22.97 
 
 		 568 aa  64.7  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.674057  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1953  anion transporter  22.34 
 
 		 489 aa  62  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312845  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0235  anion transporter  23.86 
 
 		 446 aa  61.6  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000069628  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1252  cation transporter  24.3 
 
 		 448 aa  61.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1157  citrate transporter  22.34 
 
 		 447 aa  60.5  0.00000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2094  sodium/sulphate symporter  22.58 
 
 		 466 aa  60.5  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2490  anion transporter  24.52 
 
 		 463 aa  60.1  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0173335 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1868  sodium/sulphate symporter  23.78 
 
 		 461 aa  58.9  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1872  sodium/sulphate symporter  24.52 
 
 		 461 aa  58.9  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1560  anion transporter  22.88 
 
 		 465 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251545  hitchhiker  0.000139905 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2663  anion transporter  22.72 
 
 		 464 aa  58.2  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.392129  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3039  TrkA domain-containing protein  28.49 
 
 		 594 aa  57  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.170851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2857  Sodium/sulphate symporter  24.94 
 
 		 482 aa  57  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00834763  hitchhiker  0.0000150124 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35420  Sodium/sulphate symporter-like protein  25 
 
 		 451 aa  57  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2748  anion transporter  27.05 
 
 		 478 aa  55.8  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02933  predicted tartrate:succinate antiporter  25.69 
 
 		 487 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00145949  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26970  anion transporter  25.18 
 
 		 517 aa  55.8  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1040  nadc family protein  25 
 
 		 467 aa  55.5  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0249058  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02883  hypothetical protein  25.69 
 
 		 487 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00124392  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0637  anion transporter  25.69 
 
 		 487 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000275084  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2238  anion transporter  24.91 
 
 		 510 aa  54.7  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.864259  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3936  anion transporter  25.06 
 
 		 482 aa  54.7  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603046  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0636  anion transporter  25.69 
 
 		 487 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000570216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4375  anion transporter  25.69 
 
 		 487 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00267264  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0370  anion transporter  23.67 
 
 		 484 aa  54.3  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3527  anion transporter  25.69 
 
 		 487 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412852  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2485  anion transporter  22.78 
 
 		 483 aa  54.3  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5342  TrkA-C domain protein  27.85 
 
 		 588 aa  53.9  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.270023 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0442  anion transporter  28.05 
 
 		 486 aa  54.3  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3356  anion transporter  25.69 
 
 		 487 aa  53.9  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000525621  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2872  anion transporter  23.95 
 
 		 477 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.675436  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0824  anion transporter  23.95 
 
 		 477 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.595752  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2892  anion transporter  23.95 
 
 		 477 aa  53.5  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.151263 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0874  anion transporter  23.95 
 
 		 477 aa  53.5  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0797  anion transporter  23.95 
 
 		 477 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0516558  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1851  sodium/sulphate symporter  22.34 
 
 		 521 aa  53.1  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3243  anion transporter  25.44 
 
 		 487 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0793  anion transporter  23.72 
 
 		 477 aa  52.8  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.575691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1204  di- and tricarboxylate transporters-like  25 
 
 		 461 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.183982  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0349  anion transporter  25.23 
 
 		 490 aa  51.6  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000240953  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1734  anion transporter  22.14 
 
 		 483 aa  52.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3393  anion transporter  21.41 
 
 		 466 aa  52  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0348  anion transporter family protein  21.57 
 
 		 518 aa  51.6  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0860  anion transporter  24.48 
 
 		 422 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.918843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0892  anion transporter  24.48 
 
 		 422 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0221  anion transporter  22.8 
 
 		 460 aa  50.8  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1542  anion transporter  22.41 
 
 		 482 aa  50.8  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0801  anion transporter  24.48 
 
 		 422 aa  50.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2078  anion transporter  28.41 
 
 		 486 aa  50.1  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>