134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_2456 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1867  sodium/sulphate symporter  78.43 
 
 
462 aa  716    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.970119  normal  0.269593 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2111  sodium/sulphate symporter  79.3 
 
 
462 aa  723    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0268819 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1922  sodium/sulphate symporter  79.08 
 
 
462 aa  709    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2351  sodium/sulphate symporter  98.49 
 
 
463 aa  890    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.9001  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1909  sodium/sulphate symporter  82.9 
 
 
463 aa  760    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2340  sodium/sulphate symporter  98.27 
 
 
463 aa  885    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2456  sodium/sulphate symporter  100 
 
 
463 aa  899    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.240991  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2007  sodium/sulphate symporter  97.41 
 
 
463 aa  860    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000568868 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5269  sodium/sulphate symporter  40.97 
 
 
530 aa  338  1.9999999999999998e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.438877 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0456  sodium/sulphate symporter  41.69 
 
 
433 aa  329  6e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156875  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43990  sodium/solute symporter protein  42.29 
 
 
432 aa  324  3e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4275  sodium/sulphate symporter  40.47 
 
 
441 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.684538 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4053  sodium/sulphate symporter  38.24 
 
 
434 aa  310  2.9999999999999997e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1482  sodium/sulphate symporter  38.26 
 
 
478 aa  309  8e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0963428 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3599  sodium/sulphate symporter  40 
 
 
441 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.914538  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1559  sodium/sulphate symporter  39.43 
 
 
502 aa  299  8e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3891  sodium/sulphate symporter  39.53 
 
 
441 aa  294  2e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.351593  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6317  sodium/sulphate symporter  39.48 
 
 
433 aa  293  5e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.190287  hitchhiker  0.00328538 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7176  sodium/sulphate symporter  39.43 
 
 
433 aa  288  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.692361  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0483  DASS family Na(+)/divalent anion symporter  38.39 
 
 
486 aa  278  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0255  sodium/sulphate symporter  38.43 
 
 
486 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5900  sodium/sulphate symporter  30.57 
 
 
465 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  normal  0.020602 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5677  sodium/sulphate symporter  31 
 
 
465 aa  192  1e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0143035  normal  0.0333919 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2659  sodium/sulphate symporter  26.81 
 
 
463 aa  139  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2193  sodium/solute symporter family protein  25.98 
 
 
476 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00348194  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2055  sodium/solute symporter family protein  26.42 
 
 
476 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0229525  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2211  sodium/solute symporter family protein  26.42 
 
 
476 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2239  sodium/solute symporter family protein  26.42 
 
 
473 aa  111  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.93542e-30 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2049  sodium/sulphate symporter  25.73 
 
 
485 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000525782  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0560  anion transporter  24.32 
 
 
507 aa  92  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1564  anion transporter  26.37 
 
 
493 aa  85.5  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.43197  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3879  sodium/sulphate symporter  22.53 
 
 
533 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4560  sodium/sulphate symporter  28.19 
 
 
555 aa  81.6  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.760965  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2094  sodium/sulphate symporter  22.11 
 
 
466 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0363  sodium/sulphate symporter  23.23 
 
 
532 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288684  hitchhiker  0.00000731788 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1663  permease  26.32 
 
 
489 aa  75.9  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8313  anion transporter  22.58 
 
 
491 aa  73.9  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572418  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3967  anion transporter  24.93 
 
 
475 aa  71.6  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2238  anion transporter  23.37 
 
 
510 aa  70.1  0.00000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.864259  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2748  anion transporter  23.37 
 
 
478 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1435  sodium/sulphate symporter  24.85 
 
 
568 aa  68.6  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.674057  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0362  sodium/sulphate symporter  20.54 
 
 
470 aa  67.8  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0442  anion transporter  25.47 
 
 
486 aa  67.4  0.0000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0235  anion transporter  24.48 
 
 
446 aa  67  0.0000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000069628  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1953  anion transporter  21.68 
 
 
489 aa  67  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312845  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0043  anion transporter  25.5 
 
 
470 aa  65.9  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0037  anion transporter  25.6 
 
 
470 aa  64.3  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0935  anion transporter  24 
 
 
533 aa  63.5  0.000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4511  anion transporter  24.9 
 
 
516 aa  63.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0348  anion transporter family protein  22.41 
 
 
518 aa  61.2  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0787  sodium/sulphate symporter  19.54 
 
 
491 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0341  DASS family Na(+)/divalent anion symporter  23.91 
 
 
514 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0364285  hitchhiker  0.00160481 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2672  sodium/sulphate symporter  21.83 
 
 
486 aa  60.8  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0714  anion transporter  21.72 
 
 
517 aa  60.8  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0730  anion transporter  21.72 
 
 
517 aa  60.8  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.597447  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35420  Sodium/sulphate symporter-like protein  25.32 
 
 
451 aa  59.3  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4103  anion transporter  25.18 
 
 
470 aa  59.7  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2073  Na/dicarboxylate cotransporter-like protein  24.06 
 
 
531 aa  58.9  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1560  anion transporter  21.79 
 
 
465 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251545  hitchhiker  0.000139905 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1851  sodium/sulphate symporter  20.67 
 
 
521 aa  59.3  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0281  anion transporter  24.26 
 
 
505 aa  57.8  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2490  anion transporter  21.48 
 
 
463 aa  57.4  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0173335 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3654  anion transporter  24.12 
 
 
422 aa  56.6  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3548  anion transporter  24.12 
 
 
422 aa  56.6  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6918  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3716  anion transporter  24.12 
 
 
422 aa  56.6  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.672339 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0889  anion transporter  24.53 
 
 
495 aa  55.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.517689  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2078  anion transporter  24.67 
 
 
486 aa  55.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  22.53 
 
 
459 aa  55.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3619  anion transporter  23.63 
 
 
422 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.254252  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26980  anion transporter  25.11 
 
 
499 aa  54.3  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2009  anion transporter  21.91 
 
 
483 aa  54.3  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3547  anion transporter  22.92 
 
 
422 aa  54.3  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1697  anion transporter  24.19 
 
 
452 aa  53.9  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000215877  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22550  anion transporter  24.61 
 
 
517 aa  53.1  0.000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1204  di- and tricarboxylate transporters-like  20.84 
 
 
461 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.183982  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1936  anion transporter  25.84 
 
 
493 aa  53.1  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0197224  normal  0.483122 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1490  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  24.79 
 
 
466 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2446  Sodium/sulphate symporter  23.11 
 
 
491 aa  52  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4931  sodium/sulphate symporter  25.55 
 
 
486 aa  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0383  anion transporter  19.79 
 
 
470 aa  52  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2459  anion transporter  21.18 
 
 
483 aa  51.6  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0370  anion transporter  25.09 
 
 
484 aa  51.2  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1717  anion transporter  21.72 
 
 
458 aa  51.2  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0893  anion transporter  23.37 
 
 
536 aa  50.8  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1123  anion transporter  25.81 
 
 
660 aa  50.4  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2328  anion transporter family protein  24.36 
 
 
472 aa  49.3  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0346  sodium-dependent transporter  22.37 
 
 
552 aa  49.7  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000913851  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  25.12 
 
 
619 aa  49.7  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0092  divalent anion:Na+ symporter (DASS) family protein  23.13 
 
 
475 aa  49.7  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0091  divalent anion:Na+ symporter family protein  23.13 
 
 
475 aa  49.7  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24780  anion transporter  29.53 
 
 
502 aa  49.7  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2485  anion transporter  24.49 
 
 
483 aa  49.7  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2627  anion transporter  24.19 
 
 
607 aa  48.9  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2766  anion transporter  30.69 
 
 
490 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.133589 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2718  anion transporter  22.65 
 
 
472 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2775  anion transporter  22.65 
 
 
472 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4122  anion transporter  22.48 
 
 
475 aa  49.3  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1802  anion transporter  23.27 
 
 
487 aa  48.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.466043  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1734  anion transporter  23.77 
 
 
483 aa  47.8  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2459  anion transporter  27.03 
 
 
513 aa  47.4  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.983995  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>