146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1559 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1559  sodium/sulphate symporter  100 
 
 		 502 aa  966    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5269  sodium/sulphate symporter  45.56 
 
 		 530 aa  355  1e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.438877 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1482  sodium/sulphate symporter  40.95 
 
 		 478 aa  348  1e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0963428 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1909  sodium/sulphate symporter  38.86 
 
 		 463 aa  317  2e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4275  sodium/sulphate symporter  43.67 
 
 		 441 aa  316  8e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.684538 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2456  sodium/sulphate symporter  38.9 
 
 		 463 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.240991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1922  sodium/sulphate symporter  37.21 
 
 		 462 aa  311  1e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2351  sodium/sulphate symporter  38.11 
 
 		 463 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.9001  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2340  sodium/sulphate symporter  38.55 
 
 		 463 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1867  sodium/sulphate symporter  36.79 
 
 		 462 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.970119  normal  0.269593 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2111  sodium/sulphate symporter  36.58 
 
 		 462 aa  310  4e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0268819 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2007  sodium/sulphate symporter  38.68 
 
 		 463 aa  309  9e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000568868 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0456  sodium/sulphate symporter  43.28 
 
 		 433 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3599  sodium/sulphate symporter  42.31 
 
 		 441 aa  299  8e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.914538  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43990  sodium/solute symporter protein  43.32 
 
 		 432 aa  291  2e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0483  DASS family Na(+)/divalent anion symporter  43.98 
 
 		 486 aa  290  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3891  sodium/sulphate symporter  42.08 
 
 		 441 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.351593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0255  sodium/sulphate symporter  44.44 
 
 		 486 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6317  sodium/sulphate symporter  42.31 
 
 		 433 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.190287  hitchhiker  0.00328538 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4053  sodium/sulphate symporter  38.71 
 
 		 434 aa  273  6e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7176  sodium/sulphate symporter  42.63 
 
 		 433 aa  267  4e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.692361  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5900  sodium/sulphate symporter  33.19 
 
 		 465 aa  216  8e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  normal  0.020602 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5677  sodium/sulphate symporter  33.41 
 
 		 465 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0143035  normal  0.0333919 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2659  sodium/sulphate symporter  26.93 
 
 		 463 aa  134  5e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2049  sodium/sulphate symporter  23.97 
 
 		 485 aa  118  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000525782  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2672  sodium/sulphate symporter  23.91 
 
 		 486 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2238  anion transporter  27.63 
 
 		 510 aa  95.5  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.864259  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8313  anion transporter  24.46 
 
 		 491 aa  94.4  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.572418  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3879  sodium/sulphate symporter  22.02 
 
 		 533 aa  91.3  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2748  anion transporter  26.89 
 
 		 478 aa  90.9  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0787  sodium/sulphate symporter  25.29 
 
 		 491 aa  90.1  9e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2094  sodium/sulphate symporter  26.52 
 
 		 466 aa  89.7  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0341  DASS family Na(+)/divalent anion symporter  24.94 
 
 		 514 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0364285  hitchhiker  0.00160481 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1564  anion transporter  24.84 
 
 		 493 aa  85.5  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.43197  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1953  anion transporter  25.31 
 
 		 489 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0312845  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1663  permease  23 
 
 		 489 aa  76.6  0.0000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0560  anion transporter  24.38 
 
 		 507 aa  76.6  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0363  sodium/sulphate symporter  21.04 
 
 		 532 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.288684  hitchhiker  0.00000731788 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2239  sodium/solute symporter family protein  22.46 
 
 		 473 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.93542e-30 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0348  anion transporter family protein  20.58 
 
 		 518 aa  72.8  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1435  sodium/sulphate symporter  22.95 
 
 		 568 aa  73.2  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.674057  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0362  sodium/sulphate symporter  22.4 
 
 		 470 aa  72.4  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1851  sodium/sulphate symporter  23.56 
 
 		 521 aa  72.8  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2055  sodium/solute symporter family protein  21.82 
 
 		 476 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0229525  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2211  sodium/solute symporter family protein  21.82 
 
 		 476 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0427  anion transporter  25.05 
 
 		 466 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3907  anion transporter  25.05 
 
 		 466 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4030  anion transporter  25.05 
 
 		 466 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3834  anion transporter  25.05 
 
 		 466 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2078  anion transporter  26.67 
 
 		 486 aa  68.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0281  anion transporter  24.06 
 
 		 505 aa  68.2  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3393  anion transporter  25.53 
 
 		 466 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2485  anion transporter  30.94 
 
 		 483 aa  67.4  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1734  anion transporter  30.39 
 
 		 483 aa  67  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2193  sodium/solute symporter family protein  22.46 
 
 		 476 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00348194  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  22.15 
 
 		 459 aa  65.9  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2561  anion transporter  31.43 
 
 		 466 aa  64.3  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.890492  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0714  anion transporter  19.51 
 
 		 517 aa  63.9  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0730  anion transporter  19.51 
 
 		 517 aa  63.9  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.597447  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0383  anion transporter  22.53 
 
 		 470 aa  63.5  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0221  anion transporter  23.72 
 
 		 460 aa  63.5  0.000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1204  di- and tricarboxylate transporters-like  23.62 
 
 		 461 aa  63.2  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.183982  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3936  anion transporter  34.32 
 
 		 482 aa  63.2  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603046  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4560  sodium/sulphate symporter  31.89 
 
 		 555 aa  60.1  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.760965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07320  anion transporter  25 
 
 		 526 aa  59.7  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.039375  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2490  anion transporter  23.11 
 
 		 463 aa  58.5  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0173335 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0786  anion transporter  22.86 
 
 		 456 aa  57.8  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0451  anion transporter  24.73 
 
 		 466 aa  57.4  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.865628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2613  anion transporter  26.96 
 
 		 534 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0828231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1542  anion transporter  23.12 
 
 		 482 aa  57.8  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2574  anion transporter  26.96 
 
 		 534 aa  57.4  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2619  anion transporter  26.96 
 
 		 534 aa  57.4  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.243228  normal  0.988073 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0193  anion transporter  33.57 
 
 		 498 aa  56.6  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00876839  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3967  anion transporter  21.59 
 
 		 475 aa  56.6  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1123  anion transporter  27.03 
 
 		 660 aa  55.5  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0442  anion transporter  27.54 
 
 		 486 aa  55.1  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2718  anion transporter  23.67 
 
 		 472 aa  54.7  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2775  anion transporter  23.67 
 
 		 472 aa  54.7  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1560  anion transporter  22.71 
 
 		 465 aa  53.9  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251545  hitchhiker  0.000139905 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3574  anion transporter  24.26 
 
 		 467 aa  53.5  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0455  anion transporter  24.26 
 
 		 467 aa  53.5  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1936  anion transporter  25.1 
 
 		 493 aa  53.5  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0197224  normal  0.483122 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2857  Sodium/sulphate symporter  29.88 
 
 		 482 aa  53.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00834763  hitchhiker  0.0000150124 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35420  Sodium/sulphate symporter-like protein  25.5 
 
 		 451 aa  52.8  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1868  sodium/sulphate symporter  22.83 
 
 		 461 aa  51.6  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1145  conserved hypothetical protein, putative sodium/sulfate transporter  23.15 
 
 		 453 aa  51.2  0.00004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00119531  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4103  anion transporter  28.24 
 
 		 470 aa  50.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2446  Sodium/sulphate symporter  27.92 
 
 		 491 aa  50.8  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2267  Sodium/sulphate symporter  21.89 
 
 		 516 aa  50.8  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0413087 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1972  anion transporter  23.7 
 
 		 520 aa  50.8  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2006  anion transporter  23.7 
 
 		 520 aa  50.8  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.740344  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0045  CitT protein  20.17 
 
 		 455 aa  50.4  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296324  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2663  anion transporter  31.06 
 
 		 464 aa  50.8  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.392129  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0884  anion transporter  20.05 
 
 		 456 aa  50.4  0.00007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195972  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2328  anion transporter family protein  22.86 
 
 		 472 aa  50.1  0.00008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2627  anion transporter  25.34 
 
 		 607 aa  50.1  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1145  Sodium/sulphate symporter  19.78 
 
 		 482 aa  49.7  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0349  anion transporter  23.85 
 
 		 490 aa  49.7  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000240953  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1529  anion transporter  23.83 
 
 		 473 aa  50.1  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00336443  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3094  anion transporter  29.52 
 
 		 464 aa  49.3  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.962564  hitchhiker  0.00000460999 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>