More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0029 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_0029  Sodium/sulphate symporter  100 
 
 
450 aa  878    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2334  anion transporter  64.46 
 
 
454 aa  490  1e-137  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.894834 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1325  Sodium/sulphate symporter  56.85 
 
 
447 aa  472  1e-132  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.171529  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1040  nadc family protein  46.8 
 
 
467 aa  369  1e-101  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0249058  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1717  anion transporter  32.73 
 
 
458 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0349  anion transporter  32.87 
 
 
490 aa  216  9e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000240953  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2459  anion transporter  31.2 
 
 
483 aa  211  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1802  anion transporter  34.56 
 
 
487 aa  211  2e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.466043  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01988  Na+/dicarboxylate symporter  32.31 
 
 
478 aa  206  6e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.619169  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1358  helix-turn-helix, AraC type  34.34 
 
 
467 aa  205  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1510  hypothetical protein  32.29 
 
 
522 aa  205  2e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.807629 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2078  anion transporter  34.21 
 
 
486 aa  203  6e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2009  anion transporter  31.92 
 
 
483 aa  196  6e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2627  anion transporter  31.87 
 
 
607 aa  196  6e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2073  Na/dicarboxylate cotransporter-like protein  31.18 
 
 
531 aa  195  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0069  anion transporter  30.69 
 
 
509 aa  194  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.636349 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0069  anion transporter  29.48 
 
 
572 aa  194  2e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1123  anion transporter  30.25 
 
 
660 aa  192  7e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.7536  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1946  anion transporter  30.24 
 
 
502 aa  192  9e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2561  anion transporter  29.98 
 
 
466 aa  191  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.890492  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2065  NadC family transporter  33.26 
 
 
457 aa  187  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  hitchhiker  0.00141864 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2006  anion transporter  29.6 
 
 
520 aa  185  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.740344  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1972  anion transporter  29.6 
 
 
520 aa  185  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2446  Sodium/sulphate symporter  32.84 
 
 
491 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1795  anion transporter  36.09 
 
 
481 aa  184  3e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2459  anion transporter  30.64 
 
 
513 aa  184  3e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.983995  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2963  anion transporter  33.88 
 
 
540 aa  182  7e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.92043  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0346  sodium-dependent transporter  28.38 
 
 
552 aa  183  7e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000913851  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0484  anion transporter  31.18 
 
 
468 aa  181  2e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.316774  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003739  di-and tricarboxylate transporter  32.89 
 
 
456 aa  180  4.999999999999999e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45173  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02032  hypothetical protein  32.89 
 
 
456 aa  179  8e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3246  anion transporter  31.88 
 
 
506 aa  177  5e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.961342 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5321  anion transporter  29.54 
 
 
596 aa  175  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0108  NadC family protein  32.96 
 
 
462 aa  172  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4649  anion transporter  31.42 
 
 
557 aa  171  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664934  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2663  anion transporter  30.6 
 
 
464 aa  170  6e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.392129  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0150  anion transporter  27.64 
 
 
531 aa  166  8e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4511  anion transporter  29.95 
 
 
516 aa  164  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2781  anion transporter  33.79 
 
 
485 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.790893 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22550  anion transporter  32.13 
 
 
517 aa  163  6e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2574  anion transporter  31.14 
 
 
534 aa  162  9e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2619  anion transporter  31.14 
 
 
534 aa  162  9e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.243228  normal  0.988073 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2613  anion transporter  31.14 
 
 
534 aa  162  9e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0828231  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1936  anion transporter  31.07 
 
 
493 aa  161  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0197224  normal  0.483122 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0935  anion transporter  30.6 
 
 
533 aa  158  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16290  anion transporter  28.27 
 
 
566 aa  157  4e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0427  anion transporter  29.93 
 
 
466 aa  157  4e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4030  anion transporter  29.93 
 
 
466 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3907  anion transporter  29.93 
 
 
466 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3834  anion transporter  29.93 
 
 
466 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0497  anion transporter  29.78 
 
 
487 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0451  anion transporter  29.4 
 
 
466 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.865628  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0455  anion transporter  29.45 
 
 
467 aa  156  9e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3574  anion transporter  29.45 
 
 
467 aa  156  9e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0889  anion transporter  32.06 
 
 
495 aa  155  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.517689  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3393  anion transporter  29.55 
 
 
466 aa  154  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1560  anion transporter  30.13 
 
 
465 aa  154  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251545  hitchhiker  0.000139905 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0786  anion transporter  30 
 
 
456 aa  154  2.9999999999999998e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0442  anion transporter  30.65 
 
 
486 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2490  anion transporter  28.95 
 
 
463 aa  154  4e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0173335 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1542  anion transporter  29.5 
 
 
482 aa  153  5.9999999999999996e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518427  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0219  NadC family transporter  31.04 
 
 
462 aa  153  7e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000102508  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1421  anion transporter  29.28 
 
 
474 aa  150  4e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0194982  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0045  CitT protein  31.22 
 
 
455 aa  150  5e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296324  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0884  anion transporter  28.87 
 
 
456 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195972  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3094  anion transporter  30.71 
 
 
464 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.962564  hitchhiker  0.00000460999 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0893  anion transporter  27.43 
 
 
536 aa  146  6e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0221  anion transporter  28.57 
 
 
460 aa  145  1e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1048  DASS family divalent anion:Na(+) symporter  27.67 
 
 
473 aa  144  2e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.486409 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  27.14 
 
 
459 aa  145  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0948  anion transporter  30.98 
 
 
509 aa  144  3e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289839  normal  0.0846649 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1145  conserved hypothetical protein, putative sodium/sulfate transporter  28.69 
 
 
453 aa  144  3e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00119531  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4829  anion transporter  29.24 
 
 
543 aa  144  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.660519  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24780  anion transporter  31.96 
 
 
502 aa  143  8e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1252  anion transporter  29.4 
 
 
522 aa  133  6e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.865916 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26980  anion transporter  29.14 
 
 
499 aa  131  3e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2341  anion transporter  31.77 
 
 
472 aa  129  8.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0587131 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0235  anion transporter  26.17 
 
 
446 aa  129  8.000000000000001e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000069628  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3207  divalent anion:sodium symporter family protein  30.63 
 
 
474 aa  125  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3967  anion transporter  25.86 
 
 
475 aa  121  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658137  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003586  transporter  30.36 
 
 
472 aa  120  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2343  anion transporter  31.35 
 
 
471 aa  120  4.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0602268 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1924  anion transporter  27.06 
 
 
491 aa  120  7e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.200858  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1145  Sodium/sulphate symporter  27.8 
 
 
482 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1157  citrate transporter  26.75 
 
 
447 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3936  anion transporter  24.7 
 
 
482 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603046  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2485  anion transporter  24.76 
 
 
483 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002249  transporter  29.17 
 
 
471 aa  113  9e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154168  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00118  sodium-dependent transporter  28.65 
 
 
471 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0932  putative transporter  27.16 
 
 
487 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1734  anion transporter  24.7 
 
 
483 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2740  putative transporter  28.53 
 
 
478 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000997908  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0859  anion transporter  29.82 
 
 
579 aa  110  7.000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.878292  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0798  citrate transporter  26.65 
 
 
446 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1152  citrate transporter  26.4 
 
 
446 aa  107  4e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0812794  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0193  anion transporter  25.9 
 
 
498 aa  106  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00876839  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2857  Sodium/sulphate symporter  24.75 
 
 
482 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00834763  hitchhiker  0.0000150124 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0809  NadC family protein  27.25 
 
 
476 aa  101  2e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000168692  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3548  anion transporter  24.01 
 
 
422 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6918  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3619  anion transporter  24.57 
 
 
422 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.254252  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>