More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_04800 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_04800  di-/tricarboxylate transporter  100 
 
 		 512 aa  969    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.166557  normal  0.382609 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3469  hypothetical protein  53.42 
 
 		 600 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.098173 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5235  citrate transporter  58.47 
 
 		 612 aa  291  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  31.86 
 
 		 588 aa  268  2e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1537  Citrate transporter  48.97 
 
 		 604 aa  266  8.999999999999999e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.853419  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0490  Citrate transporter  50.17 
 
 		 605 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  30.12 
 
 		 588 aa  223  7e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0219  Citrate transporter  49.83 
 
 		 600 aa  204  3e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000273503 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  38.87 
 
 		 609 aa  199  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  29.49 
 
 		 589 aa  192  9e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  39.1 
 
 		 612 aa  192  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  37.38 
 
 		 630 aa  189  9e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  37.38 
 
 		 610 aa  189  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  37.05 
 
 		 610 aa  187  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  37.63 
 
 		 613 aa  186  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  38.41 
 
 		 610 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  40.51 
 
 		 609 aa  185  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3860  transporter  31.05 
 
 		 586 aa  181  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102256  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  37.92 
 
 		 609 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  27.26 
 
 		 599 aa  179  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  37.17 
 
 		 616 aa  177  5e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  27.97 
 
 		 593 aa  177  6e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  27.6 
 
 		 592 aa  176  8e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2555  Citrate transporter  33.44 
 
 		 611 aa  176  9e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3312  citrate transporter  37.02 
 
 		 610 aa  176  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00101097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2441  putative transporter  35.79 
 
 		 610 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2776  Citrate transporter  38.28 
 
 		 619 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1168  transporter, Divalent Anion:Sodium Symporter family  27.63 
 
 		 593 aa  175  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2836  citrate transporter  38.13 
 
 		 610 aa  172  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.523534  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1509  Citrate transporter  34.63 
 
 		 620 aa  172  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.355628  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  28.62 
 
 		 596 aa  172  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1903  citrate transporter  38.89 
 
 		 609 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0146908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2447  putative transporter  36.12 
 
 		 610 aa  168  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.392855  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3931  sodium/sulfate symporter family protein  38.89 
 
 		 609 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0534753  normal  0.0578867 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14360  putative sodium:sulfate symporter  37.54 
 
 		 610 aa  167  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1274  putative sodium:sulfate symporter  37.87 
 
 		 610 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02217  predicted transporter  35.79 
 
 		 610 aa  164  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1364  Citrate transporter  35.79 
 
 		 610 aa  164  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.020399  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2585  putative transporter  35.79 
 
 		 610 aa  164  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02177  hypothetical protein  35.79 
 
 		 610 aa  164  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2668  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  35.79 
 
 		 610 aa  164  3e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238092  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1360  citrate transporter  35.79 
 
 		 610 aa  164  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.611944 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3431  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  35.79 
 
 		 610 aa  164  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.346504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  37.25 
 
 		 609 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  31.97 
 
 		 619 aa  163  7e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1389  Citrate transporter  36.11 
 
 		 611 aa  163  8.000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150325  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  36.75 
 
 		 592 aa  162  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1598  TrkA-C domain protein  30.92 
 
 		 593 aa  162  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.332959  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  33.55 
 
 		 594 aa  160  5e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2656  anion transporter  36 
 
 		 414 aa  158  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000561885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2573  citrate transporter  34.9 
 
 		 608 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2518  citrate transporter  34.9 
 
 		 608 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.465317  normal  0.346459 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1349  Citrate transporter  26.46 
 
 		 609 aa  157  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000776771  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2561  citrate transporter  34.9 
 
 		 608 aa  157  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.469603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2681  citrate transporter  34.56 
 
 		 608 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.146948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2473  citrate transporter  34.56 
 
 		 608 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  35.27 
 
 		 588 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  35.31 
 
 		 593 aa  153  8e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2690  citrate transporter  35.86 
 
 		 627 aa  153  8e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.390772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3534  citrate transporter  36.59 
 
 		 609 aa  152  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.433375 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  34.95 
 
 		 614 aa  152  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1945  Citrate transporter  34.44 
 
 		 778 aa  150  7e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.162435  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1157  citrate transporter  39.69 
 
 		 447 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  31.6 
 
 		 607 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1527  anion transporter  40 
 
 		 449 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.244841  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  36.21 
 
 		 623 aa  147  3e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2959  TrkA domain-containing protein  26.52 
 
 		 575 aa  147  6e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1238  hypothetical protein  31.25 
 
 		 590 aa  147  6e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0766  Citrate transporter  33.65 
 
 		 621 aa  146  1e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1238  hypothetical protein  31.25 
 
 		 590 aa  146  1e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3490  TrkA-C domain protein  32.98 
 
 		 608 aa  145  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1252  cation transporter  40.66 
 
 		 448 aa  145  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  31.7 
 
 		 598 aa  145  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0475  citrate transporter  34.12 
 
 		 632 aa  145  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  33.33 
 
 		 596 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  34.94 
 
 		 588 aa  144  5e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  32.99 
 
 		 596 aa  144  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  34.51 
 
 		 627 aa  143  6e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3899  TrkA domain-containing protein  37.84 
 
 		 592 aa  143  7e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.345566  normal  0.118663 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3458  TrkA domain-containing protein  34.89 
 
 		 605 aa  143  7e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0502  TrkA domain-containing protein  33.03 
 
 		 593 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.42475  hitchhiker  0.00110922 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2986  TrkA domain-containing protein  25.99 
 
 		 575 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2162  TrkA-C  33.23 
 
 		 590 aa  141  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2351  TrkA domain-containing protein  35.79 
 
 		 588 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119552  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3475  citrate transporter  36.05 
 
 		 591 aa  140  7.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0424744  hitchhiker  0.000014271 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1803  TrkA domain-containing protein  32.94 
 
 		 591 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129836 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2347  TrkA domain-containing protein  36.7 
 
 		 588 aa  137  4e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4381  TrkA domain-containing protein  34.74 
 
 		 591 aa  137  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.558265  normal  0.124287 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3330  DASS family sodium/sulfate transporter  26.07 
 
 		 592 aa  137  5e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  29.68 
 
 		 596 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0798  citrate transporter  40.66 
 
 		 446 aa  137  5e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4056  TrkA domain-containing protein  26.07 
 
 		 592 aa  137  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1887  Citrate transporter  33.22 
 
 		 641 aa  137  6.0000000000000005e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.554815  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  30.23 
 
 		 602 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1645  Citrate transporter  32.78 
 
 		 606 aa  136  9e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.607353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  34.86 
 
 		 618 aa  136  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1106  TrkA-like protein  32.18 
 
 		 589 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3381  TrkA-like  34.92 
 
 		 591 aa  134  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0381  DASS family sodium/sulfate transporter  34.02 
 
 		 601 aa  133  6e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1895  TrkA-C  42.11 
 
 		 591 aa  133  6e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.716075  normal  0.940085 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>