More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1523 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0798  citrate transporter  97.53 
 
 		 446 aa  832    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1152  citrate transporter  97.44 
 
 		 446 aa  800    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0812794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1157  citrate transporter  71.46 
 
 		 447 aa  654    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1523  citrate transporter  100 
 
 		 446 aa  872    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1252  cation transporter  57.93 
 
 		 448 aa  479  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1527  anion transporter  55.05 
 
 		 449 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.244841  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2656  anion transporter  54.04 
 
 		 414 aa  385  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000561885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3547  anion transporter  38.33 
 
 		 422 aa  276  7e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3716  anion transporter  38.81 
 
 		 422 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.672339 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3654  anion transporter  38.57 
 
 		 422 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3548  anion transporter  38.57 
 
 		 422 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3619  anion transporter  38.81 
 
 		 422 aa  273  5.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.254252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0829  anion transporter  35.46 
 
 		 422 aa  247  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0892  anion transporter  35.22 
 
 		 422 aa  246  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0860  anion transporter  35.22 
 
 		 422 aa  246  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.918843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0801  anion transporter  35.22 
 
 		 422 aa  246  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  42.42 
 
 		 588 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  40.1 
 
 		 588 aa  161  3e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5235  citrate transporter  28.65 
 
 		 435 aa  159  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.498628  normal  0.524079 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  38.07 
 
 		 613 aa  157  3e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3428  citrate transporter  31.29 
 
 		 436 aa  154  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.253129  normal  0.494299 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1498  di- and tricarboxylate transporters-like  31.87 
 
 		 444 aa  154  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1537  Citrate transporter  43.16 
 
 		 604 aa  152  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.853419  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0405  di- and tricarboxylate transporters-like  30.89 
 
 		 439 aa  151  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  42.68 
 
 		 609 aa  152  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0766  Citrate transporter  40 
 
 		 621 aa  151  3e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5235  citrate transporter  42.71 
 
 		 612 aa  150  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3469  hypothetical protein  40.1 
 
 		 600 aa  149  9e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.098173 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  37.31 
 
 		 612 aa  146  8.000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0844  Trk family potassium uptake protein  32.21 
 
 		 616 aa  144  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0884  anion transporter  27.92 
 
 		 456 aa  143  7e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195972  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  35.48 
 
 		 589 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  38.55 
 
 		 598 aa  142  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04800  di-/tricarboxylate transporter  40.66 
 
 		 512 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.166557  normal  0.382609 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2663  anion transporter  28.63 
 
 		 464 aa  141  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.392129  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2065  NadC family transporter  26.82 
 
 		 457 aa  141  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  hitchhiker  0.00141864 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1145  conserved hypothetical protein, putative sodium/sulfate transporter  28.6 
 
 		 453 aa  139  2e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00119531  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1447  citrate transporter family protein  37.44 
 
 		 610 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1488  Citrate transporter  35.62 
 
 		 610 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3094  anion transporter  29.06 
 
 		 464 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.962564  hitchhiker  0.00000460999 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1555  citrate transporter  37.44 
 
 		 610 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1821  citrate transporter family protein  36.77 
 
 		 630 aa  137  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1542  anion transporter  27.83 
 
 		 482 aa  136  6.0000000000000005e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00518427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0451  anion transporter  28.83 
 
 		 466 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.865628  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2776  Citrate transporter  35.16 
 
 		 619 aa  134  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1945  Citrate transporter  37.5 
 
 		 778 aa  134  3e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.162435  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1560  anion transporter  29.54 
 
 		 465 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251545  hitchhiker  0.000139905 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0170  Citrate transporter  37.19 
 
 		 619 aa  133  6e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003739  di-and tricarboxylate transporter  28.02 
 
 		 456 aa  133  6e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45173  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  38.17 
 
 		 594 aa  133  6.999999999999999e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  37.06 
 
 		 593 aa  132  9e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1106  TrkA-like protein  33.18 
 
 		 589 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3312  citrate transporter  34.25 
 
 		 610 aa  132  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00101097  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02217  predicted transporter  34.82 
 
 		 610 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1364  Citrate transporter  34.82 
 
 		 610 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.020399  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1360  citrate transporter  34.82 
 
 		 610 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.611944 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3431  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  34.82 
 
 		 610 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.346504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02177  hypothetical protein  34.82 
 
 		 610 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2441  putative transporter  35.14 
 
 		 610 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2668  TRAP transporter, DctM-like membrane protein  34.68 
 
 		 610 aa  131  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.238092  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  33.33 
 
 		 588 aa  131  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2447  putative transporter  35.14 
 
 		 610 aa  131  3e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.392855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2490  anion transporter  27.51 
 
 		 463 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0173335 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01988  Na+/dicarboxylate symporter  30.07 
 
 		 478 aa  130  4.0000000000000003e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.619169  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1777  citrate transporter  37.89 
 
 		 609 aa  130  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02032  hypothetical protein  28.44 
 
 		 456 aa  130  5.0000000000000004e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0455  anion transporter  28.12 
 
 		 467 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0221  anion transporter  28.41 
 
 		 460 aa  130  6e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3381  TrkA-like  37.44 
 
 		 591 aa  130  7.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3393  anion transporter  28.07 
 
 		 466 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3574  anion transporter  28.12 
 
 		 467 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2585  putative transporter  34.68 
 
 		 610 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1717  anion transporter  29.23 
 
 		 458 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  35.5 
 
 		 623 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2836  citrate transporter  36.23 
 
 		 610 aa  128  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.523534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2690  citrate transporter  37.29 
 
 		 627 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.390772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2573  citrate transporter  34.68 
 
 		 608 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3834  anion transporter  28.05 
 
 		 466 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1421  anion transporter  26.89 
 
 		 474 aa  127  3e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0194982  normal  0.259783 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2518  citrate transporter  34.68 
 
 		 608 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.465317  normal  0.346459 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0427  anion transporter  28.05 
 
 		 466 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2473  citrate transporter  35 
 
 		 608 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2681  citrate transporter  35 
 
 		 608 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.146948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2459  anion transporter  28.8 
 
 		 513 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.983995  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1389  Citrate transporter  36.27 
 
 		 611 aa  127  5e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0150325  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2561  citrate transporter  34.23 
 
 		 608 aa  127  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.469603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1510  hypothetical protein  28.22 
 
 		 522 aa  127  5e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.807629 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3907  anion transporter  28.36 
 
 		 466 aa  126  6e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4030  anion transporter  28.36 
 
 		 466 aa  126  6e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0786  anion transporter  28.64 
 
 		 456 aa  126  8.000000000000001e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0219  NadC family transporter  28.83 
 
 		 462 aa  126  9e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000102508  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  33.33 
 
 		 597 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3936  anion transporter  26 
 
 		 482 aa  125  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.603046  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  31.91 
 
 		 609 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22320  anion transporter  25.18 
 
 		 459 aa  125  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  35.35 
 
 		 592 aa  125  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1325  Sodium/sulphate symporter  29.01 
 
 		 447 aa  124  3e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.171529  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2627  anion transporter  28.92 
 
 		 607 aa  124  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1048  DASS family divalent anion:Na(+) symporter  26.57 
 
 		 473 aa  124  4e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.486409 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  36.54 
 
 		 622 aa  124  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>