235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0158 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0158  putative transporter  100 
 
 		 533 aa  1053    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0784692  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1558  TrkA domain-containing protein  25.79 
 
 		 613 aa  165  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.256635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0631  TrkA-C domain protein  25.16 
 
 		 599 aa  150  6e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1175  TrkA-C, di- and tricarboxylate transporters  25.05 
 
 		 589 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1530  TrkA-C domain protein  25.77 
 
 		 591 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0290  TrkA domain-containing protein  24.77 
 
 		 618 aa  140  7e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1899  TrkA-C  25.79 
 
 		 592 aa  137  5e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2317  TrkA domain-containing protein  23.26 
 
 		 588 aa  134  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.12678  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4947  TrkA-C domain protein  23.57 
 
 		 597 aa  134  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.816628 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3428  citrate transporter  26.68 
 
 		 436 aa  134  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.253129  normal  0.494299 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0660  TrkA-C  24.69 
 
 		 596 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.178336  normal  0.122015 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0040  TrkA-C domain protein  24.02 
 
 		 602 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0038  TrkA-C domain protein  24.22 
 
 		 596 aa  128  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1499  TrkA-C domain protein  26.71 
 
 		 579 aa  126  8.000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0961  TrkA-C  25.16 
 
 		 574 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0576  TrkA domain-containing protein  34.12 
 
 		 592 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.60388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1106  TrkA-like protein  23.09 
 
 		 589 aa  121  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3185  TrkA domain-containing protein  25.38 
 
 		 574 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2312  DASS family sodium/sulfate transporter  24.65 
 
 		 605 aa  120  4.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.160189 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3041  TrkA domain-containing protein  24.74 
 
 		 574 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0665  TrkA domain-containing protein  24.57 
 
 		 574 aa  118  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2309  TrkA domain-containing protein  33.53 
 
 		 592 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.887231  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1861  citrate transporter  23.63 
 
 		 587 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0656  sodium/sulphate symporter  33.53 
 
 		 592 aa  117  5e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0381  DASS family sodium/sulfate transporter  25.26 
 
 		 601 aa  117  5e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.223448  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2621  TrkA domain-containing protein  23.22 
 
 		 588 aa  116  7.999999999999999e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0998803  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2347  TrkA domain-containing protein  22.78 
 
 		 588 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1857  TrkA-C domain protein  27.41 
 
 		 591 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0964  TrkA domain-containing protein  24.95 
 
 		 574 aa  114  5e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1498  di- and tricarboxylate transporters-like  31.18 
 
 		 444 aa  114  6e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5235  citrate transporter  33.53 
 
 		 435 aa  113  9e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.498628  normal  0.524079 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1647  TrkA-C  26.38 
 
 		 575 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001705  sulfate permease Trk-type  23.57 
 
 		 574 aa  111  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5704  TrkA-C domain protein  21.41 
 
 		 588 aa  110  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.859269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0422  ion transporter superfamily protein  24.58 
 
 		 575 aa  109  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0930  TrkA domain-containing protein  25.16 
 
 		 574 aa  106  9e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0799  potasium uptake protein  24.79 
 
 		 575 aa  106  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00652417 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3406  TrkA domain-containing protein  25.16 
 
 		 574 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0956  TrkA-C domain protein  25.27 
 
 		 574 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4989  Citrate transporter  20.65 
 
 		 592 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.516998  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2144  putative transporter  23.32 
 
 		 575 aa  103  9e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3330  DASS family sodium/sulfate transporter  24.75 
 
 		 592 aa  103  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4056  TrkA domain-containing protein  24.75 
 
 		 592 aa  103  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0104  Citrate transporter  27.02 
 
 		 618 aa  101  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0405  di- and tricarboxylate transporters-like  33 
 
 		 439 aa  101  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4508  TrkA domain-containing protein  32.56 
 
 		 592 aa  101  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.951327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2889  putative sodium/sulfate symporter  23.35 
 
 		 583 aa  101  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4471  TrkA-C domain protein  22.45 
 
 		 596 aa  101  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0865  TrkA domain-containing protein  24.95 
 
 		 574 aa  100  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4408  TrkA-C domain protein  22.25 
 
 		 596 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0902  TrkA domain-containing protein  24.4 
 
 		 574 aa  99.8  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3512  TrkA domain-containing protein  25 
 
 		 608 aa  98.6  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0606  putative membrane transport protein  21.27 
 
 		 588 aa  98.6  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.252017  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00768  hypothetical protein  22.65 
 
 		 574 aa  97.8  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0557  citrate transporter  26.15 
 
 		 596 aa  97.4  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000015136 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04800  di-/tricarboxylate transporter  22.52 
 
 		 512 aa  97.1  7e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.166557  normal  0.382609 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3383  TrkA-like  30.17 
 
 		 593 aa  97.1  8e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02717  putative transporter  26.01 
 
 		 574 aa  96.7  8e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3070  TrkA domain-containing protein  25.48 
 
 		 574 aa  97.1  8e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.748598 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1094  TrkA domain-containing protein  32.47 
 
 		 593 aa  95.5  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00281936  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3372  putative transporter  23.47 
 
 		 609 aa  95.1  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3754  TrkA domain-containing protein  19.47 
 
 		 590 aa  94.4  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.694568  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2959  TrkA domain-containing protein  24.89 
 
 		 575 aa  94.4  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1688  TrkA domain-containing protein  25.32 
 
 		 575 aa  94  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1240  citrate transporter  28.87 
 
 		 610 aa  94  6e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0417903 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3565  citrate transporter  21.48 
 
 		 609 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0137837  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2081  TrkA-C  19.92 
 
 		 593 aa  92.8  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1168  transporter, Divalent Anion:Sodium Symporter family  20.27 
 
 		 593 aa  92.8  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0693  TrkA domain-containing protein  22.46 
 
 		 607 aa  92  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00166729  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2986  TrkA domain-containing protein  24.35 
 
 		 575 aa  91.7  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1684  TrkA-like protein  30.99 
 
 		 588 aa  90.5  6e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1895  TrkA-C  25.44 
 
 		 591 aa  89.7  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.716075  normal  0.940085 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3033  citrate transporter  23.99 
 
 		 612 aa  89.4  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3381  TrkA-like  22.46 
 
 		 591 aa  88.6  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1726  citrate transporter  25.58 
 
 		 588 aa  88.6  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1409  citrate transporter  27.54 
 
 		 613 aa  88.2  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000118186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2793  TrkA domain-containing protein  31.54 
 
 		 588 aa  87.4  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1424  TrkA domain-containing protein  24.62 
 
 		 575 aa  87.4  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0976124  normal  0.0212336 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2884  TrkA domain-containing protein  24.48 
 
 		 619 aa  87  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123208 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1395  TrkA-C domain protein  24.06 
 
 		 578 aa  85.5  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.096414  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2066  TrkA domain-containing protein  24.06 
 
 		 598 aa  85.9  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233721 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3221  citrate transporter  21.85 
 
 		 609 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405525  normal  0.45192 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3469  hypothetical protein  23.29 
 
 		 600 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.098173 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2766  uncharacterized transporter  27.46 
 
 		 599 aa  84.3  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.14891 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3547  anion transporter  29.73 
 
 		 422 aa  84.3  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5342  TrkA-C domain protein  26.55 
 
 		 588 aa  84  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.270023 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3619  anion transporter  29.86 
 
 		 422 aa  84  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.254252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3716  anion transporter  31 
 
 		 422 aa  83.6  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.672339 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2058  citrate transporter  23.05 
 
 		 609 aa  83.6  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0153049 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1941  TrkA-C domain protein  24.68 
 
 		 623 aa  83.6  0.000000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3654  anion transporter  31 
 
 		 422 aa  83.2  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3548  anion transporter  31 
 
 		 422 aa  83.2  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1036  TrkA-C domain protein  24.24 
 
 		 627 aa  83.2  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.131112 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1645  Citrate transporter  29.01 
 
 		 606 aa  82.8  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.607353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1945  Citrate transporter  30.41 
 
 		 778 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.162435  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0633  TrkA-C  24.74 
 
 		 594 aa  81.6  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0927115  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0635  Citrate transporter  29.31 
 
 		 622 aa  80.9  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1509  Citrate transporter  24.37 
 
 		 620 aa  80.5  0.00000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.355628  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0867  TrkA-C domain protein  20.61 
 
 		 614 aa  80.1  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18544  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01481  DASS family sodium/sulfate transporter  25.69 
 
 		 605 aa  78.6  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>