197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2423 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_2423  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
434 aa  855    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.193293  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0254  major facilitator transporter  53.5 
 
 
439 aa  421  1e-116  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.180707 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1199  major facilitator transporter  36.98 
 
 
449 aa  223  4.9999999999999996e-57  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.329766  hitchhiker  0.000717058 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0759  major facilitator transporter  34.61 
 
 
403 aa  190  2.9999999999999997e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1013  major facilitator transporter  30.43 
 
 
437 aa  181  2e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  decreased coverage  0.00471133 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0348  major facilitator transporter  28.67 
 
 
423 aa  135  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2195  major facilitator transporter  25.11 
 
 
419 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.373934  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1973  major facilitator transporter  25.77 
 
 
417 aa  79.7  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.696762  hitchhiker  0.00000123368 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1075  major facilitator transporter  24.8 
 
 
417 aa  79  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.691056  normal  0.0656775 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  23.86 
 
 
446 aa  76.6  0.0000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0328  major facilitator transporter  21.66 
 
 
410 aa  76.6  0.0000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 
447 aa  70.1  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1543  major facilitator transporter  26.97 
 
 
382 aa  68.6  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0259552 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  31.1 
 
 
445 aa  64.3  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1829  General substrate transporter  29.67 
 
 
480 aa  64.3  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.392144  normal  0.18053 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0395  major facilitator superfamily MFS_1  27.1 
 
 
472 aa  63.9  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.90687 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  26.74 
 
 
451 aa  61.2  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  31 
 
 
447 aa  61.2  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  32.95 
 
 
473 aa  59.7  0.00000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3027  major facilitator transporter  27.78 
 
 
481 aa  58.9  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  31.58 
 
 
485 aa  58.2  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  30.92 
 
 
398 aa  57.8  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0576  major facilitator transporter  25.68 
 
 
504 aa  57.8  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474079  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3242  major facilitator superfamily MFS_1  29.26 
 
 
539 aa  57.4  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00325514  normal  0.76951 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0881  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 
448 aa  57  0.0000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.202747  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3612  major facilitator transporter  27.23 
 
 
476 aa  57  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.384434  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  24.88 
 
 
459 aa  57  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1026  major facilitator transporter  28.19 
 
 
494 aa  57  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.76492  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  31.11 
 
 
459 aa  56.2  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2715  major facilitator transporter  26.89 
 
 
491 aa  56.2  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  26.02 
 
 
456 aa  55.8  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0730  General substrate transporter  27.8 
 
 
464 aa  55.8  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  33.12 
 
 
399 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  33.12 
 
 
399 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  26.32 
 
 
449 aa  55.1  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  26.29 
 
 
476 aa  55.1  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0808  major facilitator superfamily MFS_1  25.78 
 
 
494 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2711  major facilitator transporter  25.28 
 
 
480 aa  55.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0257064  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  33.12 
 
 
399 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  33.76 
 
 
399 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  24.36 
 
 
474 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1512  general substrate transporter  25.52 
 
 
467 aa  55.5  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.925564  normal  0.774713 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  33.12 
 
 
399 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  32.47 
 
 
399 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  32.47 
 
 
399 aa  54.7  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  32.47 
 
 
399 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  32.47 
 
 
399 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5143  major facilitator superfamily MFS_1  26.52 
 
 
495 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1408  major facilitator transporter  24.76 
 
 
484 aa  55.1  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0000966462  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  30.59 
 
 
435 aa  54.7  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3624  major facilitator superfamily MFS_1  30.94 
 
 
597 aa  54.3  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0463  major facilitator transporter  27.31 
 
 
448 aa  54.3  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0213055  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 
451 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3353  major facilitator superfamily transporter  25.95 
 
 
483 aa  53.9  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.379633  decreased coverage  0.00165452 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  23.47 
 
 
457 aa  53.9  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  24.45 
 
 
487 aa  53.5  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6930  major facilitator superfamily MFS_1  24.17 
 
 
460 aa  53.5  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11506  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  33.13 
 
 
411 aa  53.5  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  30.3 
 
 
477 aa  53.1  0.000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  24.88 
 
 
485 aa  53.1  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  32.69 
 
 
399 aa  53.1  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2550  major facilitator transporter  22.7 
 
 
481 aa  52.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.325766 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  28.83 
 
 
470 aa  53.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1217  major facilitator transporter  23.9 
 
 
487 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.207678  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 
472 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09740  putative MFS transporter  25.14 
 
 
442 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00809883  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1668  major facilitator transporter  23.12 
 
 
487 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.339414  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1696  major facilitator transporter  23.9 
 
 
487 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4496  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  33.64 
 
 
398 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  28.04 
 
 
472 aa  52.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1257  major facilitator transporter  27.95 
 
 
454 aa  52  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.281321  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  22.71 
 
 
485 aa  52.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  25 
 
 
455 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  27.11 
 
 
455 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0313  major facilitator superfamily MFS_1  28.05 
 
 
489 aa  51.2  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2078  major facilitator superfamily MFS_1  26.55 
 
 
404 aa  51.2  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 
456 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0856  major facilitator superfamily protein  25.1 
 
 
483 aa  51.2  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0609243 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1898  major facilitator superfamily MFS_1  25.52 
 
 
448 aa  50.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0050  major facilitator transporter  26.23 
 
 
484 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1117  major facilitator transporter  30.91 
 
 
461 aa  50.4  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.316307  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  28.26 
 
 
474 aa  50.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  28.26 
 
 
474 aa  50.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  28.26 
 
 
473 aa  50.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3351  major facilitator transporter  32.32 
 
 
423 aa  50.4  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  28.26 
 
 
474 aa  50.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  25.64 
 
 
464 aa  49.7  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  27.93 
 
 
473 aa  49.7  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0915  major facilitator transporter  29.32 
 
 
493 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.86159  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4525  major facilitator transporter  27.66 
 
 
493 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.432658 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  23.83 
 
 
479 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0712  general substrate transporter  27.06 
 
 
463 aa  49.3  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0221085  hitchhiker  0.00000000000000199551 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06669  Putative sugar transporterPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AYG1]  27.51 
 
 
534 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000679135  normal  0.108203 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02570  receptor, putative  25.75 
 
 
529 aa  48.5  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.76404  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  24.39 
 
 
485 aa  48.9  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04490  sugar phosphate permease  26.15 
 
 
469 aa  48.5  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1373  major facilitator transporter  23.85 
 
 
443 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1785  major facilitator transporter  27.75 
 
 
493 aa  48.9  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  26.44 
 
 
456 aa  49.3  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  25.39 
 
 
479 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>