More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1013 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1013  major facilitator transporter  100 
 
 		 437 aa  868    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00471133 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0328  major facilitator transporter  40.39 
 
 		 410 aa  296  3e-79  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2423  major facilitator superfamily MFS_1  30.43 
 
 		 434 aa  186  6e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.193293  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0759  major facilitator transporter  28.77 
 
 		 403 aa  171  2e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1199  major facilitator transporter  30.18 
 
 		 449 aa  164  3e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.329766  hitchhiker  0.000717058 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0254  major facilitator transporter  26.62 
 
 		 439 aa  144  3e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.180707 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0348  major facilitator transporter  27.5 
 
 		 423 aa  125  1e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2550  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 481 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.325766 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2195  major facilitator transporter  25 
 
 		 419 aa  90.1  7e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.373934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  27.87 
 
 		 449 aa  87  5e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0195  major facilitator transporter  24.12 
 
 		 465 aa  82.8  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  25.49 
 
 		 446 aa  82.4  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3234  general substrate transporter  26.06 
 
 		 445 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4212  sugar transporter  27.89 
 
 		 477 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0395  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 472 aa  75.9  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.90687 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  26.73 
 
 		 445 aa  75.5  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4043  general substrate transporter  25.67 
 
 		 452 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0049  major facilitator family transporter  29.29 
 
 		 443 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0049  major facilitator family transporter  28.87 
 
 		 443 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00049  predicted transporter  28.87 
 
 		 443 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0051  major facilitator family transporter  28.87 
 
 		 443 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3554  major facilitator superfamily MFS_1  28.87 
 
 		 443 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3610  major facilitator transporter  28.87 
 
 		 443 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0100231 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  25.69 
 
 		 473 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00048  hypothetical protein  28.87 
 
 		 443 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0047  major facilitator family transporter  28.87 
 
 		 443 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.454742 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1772  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 489 aa  73.9  0.000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0605301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  26.98 
 
 		 455 aa  73.6  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0730  General substrate transporter  26.27 
 
 		 464 aa  73.2  0.000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2255  general substrate transporter  24.94 
 
 		 446 aa  73.2  0.000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000684239  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  25.32 
 
 		 435 aa  72.8  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0270  major facilitator transporter  24.47 
 
 		 477 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0250869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  24.94 
 
 		 468 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3353  major facilitator superfamily transporter  27.17 
 
 		 483 aa  70.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.379633  decreased coverage  0.00165452 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1829  General substrate transporter  26.61 
 
 		 480 aa  70.5  0.00000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.392144  normal  0.18053 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  31.13 
 
 		 451 aa  70.1  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  25.31 
 
 		 474 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973666  normal  0.0403058 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0974  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  25.16 
 
 		 462 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000109951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0325  major facilitator superfamily MFS_1  25.06 
 
 		 477 aa  70.1  0.00000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.184754  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1075  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 417 aa  69.7  0.00000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.691056  normal  0.0656775 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2681  general substrate transporter  25.06 
 
 		 438 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.31051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9266  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 479 aa  69.7  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.248133 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  25.73 
 
 		 472 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  25.23 
 
 		 447 aa  69.3  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1759  major facilitator superfamily MFS_1  25.53 
 
 		 472 aa  69.7  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0313  major facilitator superfamily MFS_1  27.37 
 
 		 489 aa  68.6  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0861  major facilitator superfamily MFS_1  28.38 
 
 		 483 aa  68.9  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2500  major facilitator family transporter  27.82 
 
 		 483 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.589471  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  25.24 
 
 		 472 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3624  major facilitator superfamily MFS_1  27.12 
 
 		 597 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1973  major facilitator transporter  25.75 
 
 		 417 aa  68.2  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.696762  hitchhiker  0.00000123368 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  22.39 
 
 		 460 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0576  major facilitator transporter  27.2 
 
 		 504 aa  67.8  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.474079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  26.7 
 
 		 485 aa  67.8  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  25.79 
 
 		 455 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2715  major facilitator transporter  31.07 
 
 		 491 aa  66.6  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2085  major facilitator superfamily transporter  25.96 
 
 		 501 aa  66.6  0.0000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00714059  normal  0.900579 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  23.76 
 
 		 457 aa  65.9  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  27.43 
 
 		 470 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  22.46 
 
 		 462 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7483  major facilitator transporter  24.06 
 
 		 428 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0856  major facilitator superfamily protein  26.42 
 
 		 483 aa  65.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0609243 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  27.54 
 
 		 459 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3249  major facilitator superfamily MFS_1  25.54 
 
 		 497 aa  65.1  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.468482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0089  putative metabolite transport protein YaaU  26.96 
 
 		 468 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.343682  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1026  major facilitator transporter  24.9 
 
 		 494 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.76492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0088  putative metabolite transport protein YaaU  26.96 
 
 		 468 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  25.11 
 
 		 462 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3608  general substrate transporter  25.43 
 
 		 469 aa  65.5  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0085  putative metabolite transport protein YaaU  26.96 
 
 		 468 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0085  putative metabolite transport protein YaaU  26.96 
 
 		 468 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3321  major facilitator transporter  25.41 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0086  putative metabolite transport protein YaaU  26.96 
 
 		 468 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.509383  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  25.89 
 
 		 446 aa  64.7  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3221  General substrate transporter  27.65 
 
 		 457 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  22.16 
 
 		 462 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0910  major facilitator family transporter  29.41 
 
 		 472 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.367874  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7236  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 484 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.440846  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0323  major facilitator superfamily MFS_1  24.4 
 
 		 488 aa  63.9  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0382  major facilitator transporter  26.38 
 
 		 472 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0993  major facilitator transporter  23.88 
 
 		 497 aa  63.5  0.000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000427964  normal  0.0333525 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3242  major facilitator superfamily MFS_1  26.27 
 
 		 539 aa  63.5  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00325514  normal  0.76951 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2306  major facilitator transporter  26 
 
 		 483 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.957896  normal  0.102132 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3453  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 472 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  26.86 
 
 		 474 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  25.77 
 
 		 474 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  22.51 
 
 		 476 aa  63.5  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0486  major facilitator family transporter  30.07 
 
 		 472 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0312823  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  26.86 
 
 		 474 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  26.86 
 
 		 474 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  24.58 
 
 		 451 aa  63.2  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08810  arabinose efflux permease family protein  27.56 
 
 		 494 aa  62.8  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0788  major facilitator family transporter  30.07 
 
 		 472 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509193  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1804  major facilitator transporter  28.98 
 
 		 470 aa  62.4  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000239079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  27.81 
 
 		 473 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1117  major facilitator transporter  25.61 
 
 		 461 aa  62.8  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.316307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  26.86 
 
 		 473 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0555  major facilitator family transporter  30.07 
 
 		 472 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1973  major facilitator transporter  30.07 
 
 		 472 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4627  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 475 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>