67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0254 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0254  major facilitator transporter  100 
 
 		 439 aa  863    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.180707 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2423  major facilitator superfamily MFS_1  53.5 
 
 		 434 aa  436  1e-121  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.193293  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1199  major facilitator transporter  35.1 
 
 		 449 aa  204  3e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.329766  hitchhiker  0.000717058 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0759  major facilitator transporter  34.33 
 
 		 403 aa  188  2e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1013  major facilitator transporter  26.85 
 
 		 437 aa  144  4e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00471133 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0348  major facilitator transporter  29.64 
 
 		 423 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2195  major facilitator transporter  27.83 
 
 		 419 aa  105  2e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.373934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0328  major facilitator transporter  26.82 
 
 		 410 aa  92.4  2e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1973  major facilitator transporter  26.53 
 
 		 417 aa  75.9  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.696762  hitchhiker  0.00000123368 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1075  major facilitator transporter  27.06 
 
 		 417 aa  68.6  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.691056  normal  0.0656775 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1543  major facilitator transporter  27.52 
 
 		 382 aa  67  0.0000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0259552 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1671  major facilitator transporter  27.52 
 
 		 381 aa  59.3  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000914056 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1512  general substrate transporter  22.88 
 
 		 467 aa  57.4  0.0000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.925564  normal  0.774713 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  23.73 
 
 		 455 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1026  major facilitator transporter  26.92 
 
 		 494 aa  56.6  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.76492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  23.31 
 
 		 455 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0920  General substrate transporter  23.23 
 
 		 471 aa  54.7  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3580  hypothetical protein  25.18 
 
 		 478 aa  55.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.024372  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  23.4 
 
 		 459 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2518  major facilitator transporter  26.72 
 
 		 437 aa  54.3  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2715  major facilitator transporter  23.69 
 
 		 491 aa  53.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  24.07 
 
 		 476 aa  52.8  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0694  General substrate transporter  25.27 
 
 		 459 aa  52.8  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  27.81 
 
 		 446 aa  52.8  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0050  major facilitator transporter  26.36 
 
 		 484 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  25.34 
 
 		 526 aa  51.6  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5143  major facilitator superfamily MFS_1  26.85 
 
 		 495 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  26.74 
 
 		 451 aa  50.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  24.77 
 
 		 398 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28350  arabinose efflux permease family protein  30.2 
 
 		 465 aa  49.3  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1094  major facilitator transporter  29.08 
 
 		 427 aa  49.7  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  26.67 
 
 		 449 aa  49.3  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  24.39 
 
 		 457 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  26.18 
 
 		 473 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0395  major facilitator superfamily MFS_1  24.31 
 
 		 472 aa  48.9  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.90687 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9266  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 479 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.248133 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  25.82 
 
 		 438 aa  48.5  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  25.82 
 
 		 438 aa  48.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08810  arabinose efflux permease family protein  28.89 
 
 		 494 aa  47.8  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  26.06 
 
 		 468 aa  47.8  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  24.88 
 
 		 451 aa  47  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3608  general substrate transporter  26.38 
 
 		 469 aa  47.4  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1785  major facilitator transporter  22.49 
 
 		 493 aa  47  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1484  major facilitator superfamily MFS_1  25.2 
 
 		 474 aa  47  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.074526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4932  major facilitator transporter  24.8 
 
 		 480 aa  47  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.828486  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3228  major facilitator transporter  24.8 
 
 		 480 aa  47  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1809  major facilitator family protein  25.2 
 
 		 499 aa  46.2  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0856  major facilitator superfamily protein  25.91 
 
 		 483 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0609243 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  25.21 
 
 		 445 aa  45.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3353  major facilitator superfamily transporter  25.31 
 
 		 483 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.379633  decreased coverage  0.00165452 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1772  major facilitator transporter  26.13 
 
 		 489 aa  45.8  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0605301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4111  major facilitator transporter  29.26 
 
 		 442 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0012  major facilitator transporter  29.59 
 
 		 527 aa  45.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6422  major facilitator transporter  26.17 
 
 		 554 aa  45.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.726262 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4043  general substrate transporter  26.02 
 
 		 452 aa  44.7  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6930  major facilitator superfamily MFS_1  23.58 
 
 		 460 aa  44.3  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2711  major facilitator transporter  21.92 
 
 		 480 aa  44.3  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0257064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0672  sugar transporter  25.19 
 
 		 493 aa  43.9  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2681  general substrate transporter  26.9 
 
 		 438 aa  44.3  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.31051 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3624  major facilitator superfamily MFS_1  26.1 
 
 		 597 aa  43.9  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02570  receptor, putative  23.4 
 
 		 529 aa  43.5  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.76404  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  28.75 
 
 		 485 aa  43.5  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3612  major facilitator transporter  24.03 
 
 		 476 aa  43.5  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.384434  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6134  major facilitator transporter  25.7 
 
 		 554 aa  43.1  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4015  major facilitator superfamily MFS_1  25.25 
 
 		 477 aa  43.1  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 		 435 aa  43.1  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1953  general substrate transporter  32.81 
 
 		 544 aa  43.1  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>