More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_28350 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_28350  arabinose efflux permease family protein  100 
 
 		 465 aa  910    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3282  major facilitator superfamily MFS_1  31.97 
 
 		 424 aa  167  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.395947 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1619  major facilitator transporter  28.35 
 
 		 454 aa  130  6e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.366552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4392  major facilitator transporter  27.95 
 
 		 439 aa  124  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4479  major facilitator superfamily transporter  27.95 
 
 		 439 aa  124  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4773  major facilitator transporter  27.95 
 
 		 439 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6930  major facilitator superfamily MFS_1  25.94 
 
 		 460 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  31.84 
 
 		 451 aa  83.2  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  34.12 
 
 		 476 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  30.97 
 
 		 473 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  29.65 
 
 		 476 aa  81.3  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  30.53 
 
 		 474 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  31.22 
 
 		 472 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  33.53 
 
 		 474 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  34.71 
 
 		 474 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  33.99 
 
 		 472 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  34.71 
 
 		 474 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  35.82 
 
 		 485 aa  75.9  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0821  major facilitator transporter  40.23 
 
 		 403 aa  75.5  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2238  glucose transport protein  27.92 
 
 		 471 aa  75.5  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  34.84 
 
 		 473 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3608  general substrate transporter  27.23 
 
 		 469 aa  75.1  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3321  major facilitator transporter  31.69 
 
 		 439 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  30.97 
 
 		 455 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1829  General substrate transporter  25.79 
 
 		 480 aa  73.6  0.000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.392144  normal  0.18053 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2277  major facilitator family transporter  32.82 
 
 		 465 aa  73.2  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1924  major facilitator superfamily MFS_1  32.82 
 
 		 465 aa  73.2  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3242  major facilitator superfamily MFS_1  37.32 
 
 		 539 aa  73.2  0.000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00325514  normal  0.76951 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2255  general substrate transporter  24.36 
 
 		 446 aa  73.2  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000684239  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  27.69 
 
 		 455 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  31.16 
 
 		 477 aa  72.4  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  30.72 
 
 		 459 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  36.69 
 
 		 447 aa  72.4  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  25.37 
 
 		 485 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3296  major facilitator family transporter  25.56 
 
 		 458 aa  71.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2894  General substrate transporter  25.56 
 
 		 458 aa  71.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2828  major facilitator transporter  30.37 
 
 		 457 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  29.85 
 
 		 462 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  31.82 
 
 		 459 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1094  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 427 aa  71.2  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4061  sugar transporter  25.45 
 
 		 490 aa  70.9  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  25.67 
 
 		 485 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  27.8 
 
 		 457 aa  70.1  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3612  sugar transporter  32.5 
 
 		 475 aa  69.7  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1543  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 382 aa  69.3  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0259552 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3234  general substrate transporter  27.17 
 
 		 445 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  33.12 
 
 		 445 aa  68.6  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  29.61 
 
 		 447 aa  68.9  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  34.12 
 
 		 467 aa  68.6  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4043  general substrate transporter  22.84 
 
 		 452 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  31.95 
 
 		 435 aa  67.8  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0712  general substrate transporter  25.66 
 
 		 463 aa  67.8  0.0000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0221085  hitchhiker  0.00000000000000199551 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  30.32 
 
 		 451 aa  67.8  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  34.42 
 
 		 473 aa  67.8  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 487 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2085  major facilitator superfamily transporter  30.05 
 
 		 501 aa  67.4  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00714059  normal  0.900579 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  30.26 
 
 		 468 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  30.95 
 
 		 526 aa  67  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  31.03 
 
 		 446 aa  66.6  0.0000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  33.33 
 
 		 478 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  33.33 
 
 		 478 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  33.33 
 
 		 478 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  33.33 
 
 		 478 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  33.33 
 
 		 478 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  27.7 
 
 		 480 aa  65.9  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  23.22 
 
 		 479 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  33.33 
 
 		 478 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1092  major facilitator transporter  33.54 
 
 		 558 aa  65.9  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  30.77 
 
 		 473 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  24.71 
 
 		 477 aa  65.9  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1217  major facilitator transporter  24.78 
 
 		 487 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.207678  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1696  major facilitator transporter  24.78 
 
 		 487 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  33.33 
 
 		 478 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0730  General substrate transporter  25.37 
 
 		 464 aa  65.5  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 398 aa  65.5  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  23.33 
 
 		 479 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02466  MFS glucose transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14170)  36.43 
 
 		 536 aa  65.1  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1668  major facilitator transporter  24.78 
 
 		 487 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.339414  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  22.54 
 
 		 446 aa  65.1  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  24.93 
 
 		 485 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0325  major facilitator superfamily MFS_1  30.05 
 
 		 477 aa  64.7  0.000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.184754  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  22.64 
 
 		 479 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2681  general substrate transporter  26.01 
 
 		 438 aa  64.3  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.31051 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2467  major facilitator transporter  26.88 
 
 		 453 aa  64.3  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1512  general substrate transporter  23.5 
 
 		 467 aa  64.3  0.000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.925564  normal  0.774713 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  23.58 
 
 		 479 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1269  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 466 aa  63.9  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1671  major facilitator transporter  30.83 
 
 		 381 aa  63.9  0.000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000914056 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1641  major facilitator transporter  23.7 
 
 		 434 aa  63.5  0.000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0119358  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0856  major facilitator superfamily protein  24.37 
 
 		 483 aa  63.5  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0609243 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1576  major facilitator superfamily MFS_1  31.1 
 
 		 483 aa  63.5  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0049  major facilitator family transporter  28.98 
 
 		 443 aa  63.2  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1412  major facilitator transporter  32.03 
 
 		 465 aa  63.2  0.000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00049  predicted transporter  28.98 
 
 		 443 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3221  General substrate transporter  28.12 
 
 		 457 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1408  major facilitator transporter  29.13 
 
 		 484 aa  62.8  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0000966462  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0051  major facilitator family transporter  28.98 
 
 		 443 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00048  hypothetical protein  28.98 
 
 		 443 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2715  major facilitator transporter  29.07 
 
 		 491 aa  62.8  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4639  sugar transporter  35.51 
 
 		 471 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>