More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4392 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_4773  major facilitator transporter  99.77 
 
 		 439 aa  861    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4392  major facilitator transporter  100 
 
 		 439 aa  862    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4479  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 		 439 aa  862    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3282  major facilitator superfamily MFS_1  41.51 
 
 		 424 aa  258  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.395947 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1619  major facilitator transporter  32.96 
 
 		 454 aa  218  1e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.366552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28350  arabinose efflux permease family protein  27.45 
 
 		 465 aa  122  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0694  General substrate transporter  25.87 
 
 		 459 aa  94  4e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1094  major facilitator transporter  26.77 
 
 		 427 aa  94  5e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2102  sugar transporter  25.82 
 
 		 457 aa  89.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4061  sugar transporter  28.2 
 
 		 490 aa  89  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1829  General substrate transporter  26.85 
 
 		 480 aa  87.8  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.392144  normal  0.18053 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0821  major facilitator transporter  25.4 
 
 		 403 aa  87.4  4e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0426  major facilitator transporter  25.49 
 
 		 452 aa  86.7  8e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3608  general substrate transporter  23.84 
 
 		 469 aa  85.9  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0199  cis,cis-muconate transport protein MucK  25.06 
 
 		 427 aa  84.3  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217293  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0712  general substrate transporter  24.2 
 
 		 463 aa  83.2  0.000000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0221085  hitchhiker  0.00000000000000199551 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 		 423 aa  83.2  0.000000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0219  cis,cis-muconate transport protein MucK  24.81 
 
 		 427 aa  82.8  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  27.05 
 
 		 472 aa  81.6  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4647  major facilitator superfamily MFS_1  27.45 
 
 		 488 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866665  normal  0.46173 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  25 
 
 		 446 aa  79.7  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01138  Quinate permease (Quinate transporter) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P15325]  24.3 
 
 		 533 aa  79  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.526877 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  25.61 
 
 		 477 aa  78.6  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3321  major facilitator transporter  25.62 
 
 		 439 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9947  predicted protein  23.71 
 
 		 439 aa  78.2  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  28.29 
 
 		 455 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  25.5 
 
 		 480 aa  77.4  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  28.13 
 
 		 485 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3453  major facilitator transporter  28.04 
 
 		 472 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2754  sugar transporter  27.05 
 
 		 497 aa  76.6  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6205  major facilitator superfamily MFS_1  24.45 
 
 		 471 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  27.36 
 
 		 459 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  28.29 
 
 		 455 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0827  sugar transporter  25.4 
 
 		 450 aa  76.3  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0808  major facilitator superfamily MFS_1  25.34 
 
 		 494 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  25.87 
 
 		 474 aa  75.5  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3530  major facilitator transporter  25.12 
 
 		 469 aa  73.6  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0920  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  26.92 
 
 		 487 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.697574 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  24.53 
 
 		 466 aa  73.6  0.000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5007  major facilitator transporter  27.97 
 
 		 472 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3101  major facilitator transporter  27.97 
 
 		 472 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0710  sugar transporter  24.24 
 
 		 476 aa  73.2  0.000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.148606 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5266  major facilitator transporter  27.97 
 
 		 472 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5153  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 475 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507557  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1265  General substrate transporter  23.79 
 
 		 451 aa  72.8  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  27.41 
 
 		 492 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7518  sugar transporter  25.72 
 
 		 507 aa  72.8  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2255  general substrate transporter  24.6 
 
 		 446 aa  72.8  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000684239  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  23.48 
 
 		 448 aa  72  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  29.08 
 
 		 476 aa  72  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3221  General substrate transporter  25.24 
 
 		 457 aa  72.4  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1269  major facilitator transporter  26.68 
 
 		 466 aa  71.6  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0382  major facilitator transporter  27.72 
 
 		 472 aa  72  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4090  major facilitator superfamily metabolite(sugar)/H(+) symporter  24.01 
 
 		 471 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3296  major facilitator family transporter  24.08 
 
 		 458 aa  70.9  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4340  general substrate transporter  26.45 
 
 		 477 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2894  General substrate transporter  24.08 
 
 		 458 aa  70.9  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1618  major facilitator transporter  25.27 
 
 		 458 aa  70.9  0.00000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4627  major facilitator transporter  28.18 
 
 		 475 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  29.73 
 
 		 474 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  25.94 
 
 		 458 aa  70.5  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2304  major facilitator transporter  26.39 
 
 		 472 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.759044  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  24.43 
 
 		 441 aa  70.1  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0478  D-xylose proton-symporter  24.63 
 
 		 480 aa  70.1  0.00000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  25.78 
 
 		 468 aa  70.1  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 473 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0295  metabolite transport protein  25.12 
 
 		 482 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  29.19 
 
 		 474 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  23.31 
 
 		 457 aa  69.3  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  29.73 
 
 		 474 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  26.39 
 
 		 458 aa  69.3  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000961132  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1412  major facilitator transporter  26.84 
 
 		 465 aa  68.6  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4015  major facilitator superfamily MFS_1  27.29 
 
 		 477 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4230  sugar transporter  26.88 
 
 		 467 aa  68.6  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  26.59 
 
 		 487 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  25.19 
 
 		 461 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  23.39 
 
 		 451 aa  68.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0920  General substrate transporter  23.28 
 
 		 471 aa  68.2  0.0000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0730  General substrate transporter  24.37 
 
 		 464 aa  68.2  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6853  major facilitator transporter  25.37 
 
 		 430 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.854567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1512  general substrate transporter  24.5 
 
 		 467 aa  67.8  0.0000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.925564  normal  0.774713 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2070  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 472 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  27.02 
 
 		 442 aa  67.4  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  0.00000823269 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3822  sugar transporter  24.37 
 
 		 443 aa  67.4  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.103912  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51150  cis,cis-muconate transporter MucK  23.5 
 
 		 451 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000851184 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3347  sugar transporter  25.83 
 
 		 465 aa  67  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0767559  decreased coverage  0.00268397 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1599  sugar transporter  24.56 
 
 		 444 aa  66.6  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.846588  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  28.37 
 
 		 474 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973666  normal  0.0403058 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0270  major facilitator transporter  32.7 
 
 		 477 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0250869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 474 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  23.38 
 
 		 492 aa  66.6  0.0000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  26.22 
 
 		 456 aa  66.2  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2496  major facilitator family transporter  25.67 
 
 		 472 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206768  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0486  major facilitator family transporter  26.85 
 
 		 472 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0312823  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0668  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 474 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00169534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1898  major facilitator superfamily MFS_1  23.26 
 
 		 448 aa  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 485 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0788  major facilitator family transporter  26.6 
 
 		 472 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509193  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3013  major facilitator transporter  27.99 
 
 		 408 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4863  sugar transporter  26.43 
 
 		 464 aa  65.1  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.83447 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>