More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1619 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1619  major facilitator transporter  100 
 
 
454 aa  902    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.366552  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3282  major facilitator superfamily MFS_1  35.52 
 
 
424 aa  255  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.395947 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4479  major facilitator superfamily transporter  33.03 
 
 
439 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4392  major facilitator transporter  33.03 
 
 
439 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141138  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4773  major facilitator transporter  32.81 
 
 
439 aa  206  8e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28350  arabinose efflux permease family protein  28.88 
 
 
465 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2681  general substrate transporter  26.08 
 
 
438 aa  123  6e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.31051 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0049  major facilitator family transporter  25.17 
 
 
443 aa  123  8e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0047  major facilitator family transporter  25.17 
 
 
443 aa  122  9e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.454742 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00049  predicted transporter  25.17 
 
 
443 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3554  major facilitator superfamily MFS_1  25.17 
 
 
443 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0051  major facilitator family transporter  25.17 
 
 
443 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3610  major facilitator transporter  25.17 
 
 
443 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0100231 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00048  hypothetical protein  25.17 
 
 
443 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0049  major facilitator family transporter  25.17 
 
 
443 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2255  general substrate transporter  25.84 
 
 
446 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000684239  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1924  major facilitator superfamily MFS_1  27.06 
 
 
465 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2277  major facilitator family transporter  27.06 
 
 
465 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3234  general substrate transporter  24.89 
 
 
445 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4043  general substrate transporter  24.26 
 
 
452 aa  117  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  25.11 
 
 
423 aa  114  5e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0672  sugar transporter  29.29 
 
 
493 aa  114  5e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1829  General substrate transporter  24.89 
 
 
480 aa  114  5e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.392144  normal  0.18053 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0727  phosphate transporter  27.63 
 
 
442 aa  113  6e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0831  putative iorganic phosphate transporter  27.63 
 
 
442 aa  113  9e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  24.47 
 
 
476 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3296  major facilitator family transporter  26.19 
 
 
458 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2894  General substrate transporter  26.19 
 
 
458 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1512  general substrate transporter  26.46 
 
 
467 aa  111  2.0000000000000002e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.925564  normal  0.774713 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0730  General substrate transporter  25.34 
 
 
464 aa  110  6e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0382  major facilitator transporter  25.89 
 
 
472 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0088  putative metabolite transport protein YaaU  24.44 
 
 
468 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0086  putative metabolite transport protein YaaU  24.44 
 
 
468 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.509383  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  25.48 
 
 
447 aa  107  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0089  putative metabolite transport protein YaaU  24.44 
 
 
468 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.343682  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3530  major facilitator transporter  27.42 
 
 
469 aa  107  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229516  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6959  major facilitator transporter  25.32 
 
 
479 aa  107  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0085  putative metabolite transport protein YaaU  24.22 
 
 
468 aa  107  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0085  putative metabolite transport protein YaaU  24.22 
 
 
468 aa  107  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0821  major facilitator transporter  27.02 
 
 
403 aa  107  6e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5153  major facilitator transporter  26.25 
 
 
475 aa  107  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507557  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3101  major facilitator transporter  25.68 
 
 
472 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5007  major facilitator transporter  25.68 
 
 
472 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5266  major facilitator transporter  25.68 
 
 
472 aa  106  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  26.39 
 
 
479 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4647  major facilitator superfamily MFS_1  24.11 
 
 
488 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.866665  normal  0.46173 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4627  major facilitator transporter  26.25 
 
 
475 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1094  major facilitator transporter  24.25 
 
 
427 aa  104  3e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0712  general substrate transporter  26.75 
 
 
463 aa  104  3e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0221085  hitchhiker  0.00000000000000199551 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  26.39 
 
 
479 aa  104  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3453  major facilitator transporter  25.97 
 
 
472 aa  103  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499831  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  25.68 
 
 
492 aa  103  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  25.46 
 
 
451 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0920  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  23.62 
 
 
487 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.697574 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0426  major facilitator transporter  26.21 
 
 
452 aa  101  3e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 
458 aa  101  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1412  major facilitator transporter  26.59 
 
 
465 aa  99  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4340  general substrate transporter  24.94 
 
 
477 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  26.85 
 
 
479 aa  99.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0486  major facilitator family transporter  25.81 
 
 
472 aa  98.6  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0312823  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4015  major facilitator superfamily MFS_1  24.32 
 
 
477 aa  99  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0694  General substrate transporter  25.38 
 
 
459 aa  98.2  3e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2496  major facilitator family transporter  26.04 
 
 
472 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.206768  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0788  major facilitator family transporter  25.59 
 
 
472 aa  97.1  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509193  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1718  phosphate transporter  26.91 
 
 
443 aa  97.4  5e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.140032  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0555  major facilitator family transporter  25.59 
 
 
472 aa  97.1  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0471  putative iorganic phosphate transporter  26.91 
 
 
441 aa  97.1  5e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1973  major facilitator transporter  25.59 
 
 
472 aa  97.1  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0910  major facilitator family transporter  26.12 
 
 
472 aa  97.1  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.367874  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2879  General substrate transporter  27.06 
 
 
465 aa  97.1  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0808  major facilitator superfamily MFS_1  23.49 
 
 
494 aa  97.1  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2070  major facilitator transporter  26.49 
 
 
472 aa  97.1  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0920  General substrate transporter  25.21 
 
 
471 aa  96.3  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2828  major facilitator transporter  25.26 
 
 
457 aa  95.9  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0025  major facilitator family transporter  24.4 
 
 
454 aa  95.5  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  24.04 
 
 
455 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4090  major facilitator superfamily metabolite(sugar)/H(+) symporter  24.94 
 
 
471 aa  95.5  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94274  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3221  General substrate transporter  22.56 
 
 
457 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1269  major facilitator transporter  27.18 
 
 
466 aa  94.7  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6930  major facilitator superfamily MFS_1  24.67 
 
 
460 aa  94.4  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11506  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0341  major facilitator superfamily MFS_1  24.26 
 
 
508 aa  93.6  6e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3321  major facilitator transporter  25.12 
 
 
439 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0129  putative permease  30.24 
 
 
459 aa  93.2  9e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.549779  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2304  major facilitator transporter  25 
 
 
472 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.759044  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0528  major facilitator transporter  26.16 
 
 
467 aa  92  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  hitchhiker  0.00770286 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2238  glucose transport protein  25 
 
 
471 aa  92  2e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154375  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1759  major facilitator superfamily MFS_1  23.8 
 
 
472 aa  92  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  25.74 
 
 
446 aa  91.3  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  25.6 
 
 
464 aa  91.7  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6205  major facilitator superfamily MFS_1  24.51 
 
 
471 aa  90.5  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1117  major facilitator transporter  23.39 
 
 
461 aa  90.5  6e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.316307  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3193  major facilitator transporter  23.03 
 
 
472 aa  90.1  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.9008 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0578  general substrate transporter  24.61 
 
 
458 aa  89.7  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  23.82 
 
 
471 aa  89.4  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749242  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  22.22 
 
 
461 aa  89.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  25.85 
 
 
479 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00188  MFS transporter  24.31 
 
 
471 aa  89  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103216  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  22.77 
 
 
455 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1809  major facilitator family protein  23.81 
 
 
499 aa  87.8  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1484  major facilitator superfamily MFS_1  23.94 
 
 
474 aa  87  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.074526  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>