More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3282 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3282  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 424 aa  821    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.395947 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1619  major facilitator transporter  35.52 
 
 		 454 aa  246  6e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.366552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4392  major facilitator transporter  41.51 
 
 		 439 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4479  major facilitator superfamily transporter  41.51 
 
 		 439 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4773  major facilitator transporter  41.9 
 
 		 439 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28350  arabinose efflux permease family protein  32.09 
 
 		 465 aa  162  7e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0821  major facilitator transporter  30.68 
 
 		 403 aa  111  3e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3608  general substrate transporter  29.8 
 
 		 469 aa  100  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0694  General substrate transporter  28.29 
 
 		 459 aa  99  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 485 aa  98.6  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0426  major facilitator transporter  25.5 
 
 		 452 aa  98.2  3e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2255  general substrate transporter  26.15 
 
 		 446 aa  93.6  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000684239  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  25.47 
 
 		 458 aa  93.6  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 485 aa  93.2  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 485 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1829  General substrate transporter  25.45 
 
 		 480 aa  92.8  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.392144  normal  0.18053 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0730  General substrate transporter  26.48 
 
 		 464 aa  92  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  26.81 
 
 		 487 aa  89.7  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1618  major facilitator transporter  26.3 
 
 		 458 aa  88.6  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0325  major facilitator superfamily MFS_1  27.68 
 
 		 477 aa  87.8  3e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.184754  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  25.9 
 
 		 423 aa  86.3  8e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6959  major facilitator transporter  25 
 
 		 479 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1882  major facilitator superfamily MFS_1  28.79 
 
 		 439 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0481298  normal  0.608146 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1553  major facilitator superfamily MFS_1  28.79 
 
 		 439 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.262246 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1217  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 487 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.207678  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1696  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 487 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4496  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0712  general substrate transporter  26.92 
 
 		 463 aa  84.7  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0221085  hitchhiker  0.00000000000000199551 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1668  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 487 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.339414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1089  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 450 aa  84  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.10347  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0727  phosphate transporter  25.39 
 
 		 442 aa  83.6  0.000000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3321  major facilitator transporter  25.85 
 
 		 439 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2238  glucose transport protein  26.1 
 
 		 471 aa  82.8  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0831  putative iorganic phosphate transporter  25.17 
 
 		 442 aa  82  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  28.96 
 
 		 447 aa  82  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  25.56 
 
 		 479 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1166  major facilitator superfamily MFS_1  29.81 
 
 		 450 aa  82.4  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000374507 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  26.86 
 
 		 480 aa  80.5  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  24.28 
 
 		 492 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  28.06 
 
 		 477 aa  79.7  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  25.56 
 
 		 479 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4653  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 		 422 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.268151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2481  major facilitator transporter  28.17 
 
 		 496 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2576  major facilitator transporter  24.15 
 
 		 475 aa  77.8  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.634768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0668  major facilitator transporter  26.51 
 
 		 474 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00169534  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04490  sugar phosphate permease  25.85 
 
 		 469 aa  77  0.0000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1512  general substrate transporter  26.39 
 
 		 467 aa  76.6  0.0000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.925564  normal  0.774713 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5547  major facilitator family transporter  27.65 
 
 		 399 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000869498  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  24.79 
 
 		 479 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  27.22 
 
 		 451 aa  76.6  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5271  major facilitator family transporter  27.19 
 
 		 399 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000222558  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5098  major facilitator family transporter  27.19 
 
 		 399 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.20566e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5599  major facilitator family transporter  27.65 
 
 		 399 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  30.05 
 
 		 435 aa  75.5  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5668  major facilitator family transporter  27.19 
 
 		 399 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000480591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5513  major facilitator family transporter  27.19 
 
 		 399 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2879  General substrate transporter  25.11 
 
 		 465 aa  75.9  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0920  General substrate transporter  25.65 
 
 		 471 aa  75.1  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1265  General substrate transporter  25.11 
 
 		 451 aa  75.1  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0025  major facilitator family transporter  25 
 
 		 454 aa  75.1  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  26.73 
 
 		 399 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3134  major facilitator transporter  22.51 
 
 		 428 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.352378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  25.23 
 
 		 445 aa  75.1  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  30.06 
 
 		 459 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  28.8 
 
 		 455 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  24.2 
 
 		 476 aa  75.1  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  26.97 
 
 		 479 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  26.73 
 
 		 399 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  24.35 
 
 		 456 aa  74.3  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3221  General substrate transporter  25.91 
 
 		 457 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  26.73 
 
 		 399 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1443  major facilitator transporter  25.42 
 
 		 493 aa  73.6  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0672  sugar transporter  31.33 
 
 		 493 aa  73.6  0.000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5212  major facilitator transporter  29.73 
 
 		 399 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000114177  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  30.39 
 
 		 450 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  29.05 
 
 		 398 aa  73.2  0.000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 462 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 		 473 aa  72.8  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3242  major facilitator superfamily MFS_1  32.84 
 
 		 539 aa  72.8  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00325514  normal  0.76951 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  29.38 
 
 		 462 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  30.99 
 
 		 451 aa  71.6  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  25.81 
 
 		 446 aa  72  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3234  general substrate transporter  24.04 
 
 		 445 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  28.95 
 
 		 446 aa  72.4  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4043  general substrate transporter  23.5 
 
 		 452 aa  72  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1524  major facilitator transporter  25.36 
 
 		 491 aa  72.4  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400505  normal  0.0396773 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  29.11 
 
 		 476 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 		 447 aa  71.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  29.05 
 
 		 398 aa  71.2  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1698  major facilitator family transporter  22.94 
 
 		 424 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88641  normal  0.154444 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  27.19 
 
 		 415 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  27.45 
 
 		 477 aa  70.9  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  29.11 
 
 		 474 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  28.8 
 
 		 455 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0219  cis,cis-muconate transport protein MucK  23.96 
 
 		 427 aa  70.5  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  29.11 
 
 		 473 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  29.11 
 
 		 474 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1576  major facilitator superfamily MFS_1  29.41 
 
 		 483 aa  70.1  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4090  major facilitator superfamily metabolite(sugar)/H(+) symporter  24.15 
 
 		 471 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  27.45 
 
 		 463 aa  70.1  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1117  major facilitator transporter  25.24 
 
 		 461 aa  70.1  0.00000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.316307  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>