More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1117 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1117  major facilitator transporter  100 
 
 		 461 aa  904    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.316307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1512  general substrate transporter  28.03 
 
 		 467 aa  110  6e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.925564  normal  0.774713 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  27.08 
 
 		 446 aa  108  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0846  general substrate transporter  28.28 
 
 		 442 aa  108  2e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0757  sugar transporter  27.51 
 
 		 448 aa  107  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0214435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  26.68 
 
 		 476 aa  105  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2214  D-xylose transporter XylE  24.63 
 
 		 468 aa  103  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4932  major facilitator transporter  25.12 
 
 		 480 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.828486  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3228  major facilitator transporter  25.12 
 
 		 480 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2828  major facilitator transporter  26.81 
 
 		 457 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  26.67 
 
 		 446 aa  100  4e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2467  major facilitator transporter  24.59 
 
 		 453 aa  101  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0368  sugar transporter  26.3 
 
 		 448 aa  100  8e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.968703  hitchhiker  0.00000305958 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0920  General substrate transporter  27.2 
 
 		 471 aa  99  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4699  sugar transporter  23.76 
 
 		 477 aa  98.6  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1829  General substrate transporter  26.74 
 
 		 480 aa  98.2  3e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.392144  normal  0.18053 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50070  myo-inositol transporter  24.56 
 
 		 485 aa  96.7  8e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6930  major facilitator superfamily MFS_1  25.83 
 
 		 460 aa  96.3  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2550  major facilitator transporter  27.44 
 
 		 481 aa  95.9  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.325766 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2255  general substrate transporter  25.59 
 
 		 446 aa  96.3  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000684239  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0730  General substrate transporter  27.87 
 
 		 464 aa  96.3  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1094  major facilitator transporter  28.9 
 
 		 427 aa  95.5  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  24.26 
 
 		 463 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6741  major facilitator transporter  23.72 
 
 		 480 aa  94.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3234  general substrate transporter  25.34 
 
 		 445 aa  94.4  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0917  major facilitator superfamily MFS_1  25.35 
 
 		 469 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  26.69 
 
 		 423 aa  94.4  4e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3493  sugar transporter  25.74 
 
 		 486 aa  94.4  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1543  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 452 aa  94.4  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1652  general substrate transporter  26.67 
 
 		 452 aa  94  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2238  glucose transport protein  26.57 
 
 		 471 aa  93.6  7e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1804  major facilitator transporter  24.29 
 
 		 470 aa  93.6  7e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000239079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  26.35 
 
 		 474 aa  93.2  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1618  major facilitator transporter  24.57 
 
 		 458 aa  93.2  8e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1720  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 452 aa  93.2  8e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0929915  hitchhiker  0.00114848 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4664  sugar transporter  25.69 
 
 		 475 aa  93.2  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1412  major facilitator transporter  23.72 
 
 		 465 aa  92  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3580  hypothetical protein  25.98 
 
 		 478 aa  92.4  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.024372  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2911  major facilitator family transporter  26.14 
 
 		 445 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  24.57 
 
 		 459 aa  91.7  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1565  major facilitator transporter  23.47 
 
 		 480 aa  92.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523471  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3184  sugar transporter  25.44 
 
 		 441 aa  92  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.137091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6265  major facilitator transporter  23.47 
 
 		 480 aa  92.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2900  major facilitator family transporter  26.14 
 
 		 445 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3624  major facilitator superfamily MFS_1  31.84 
 
 		 597 aa  91.7  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02616  predicted transporter  26.14 
 
 		 445 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1924  major facilitator superfamily MFS_1  24.41 
 
 		 465 aa  90.9  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3321  major facilitator transporter  26.79 
 
 		 439 aa  91.3  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02579  hypothetical protein  26.14 
 
 		 445 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3073  major facilitator family transporter  26.14 
 
 		 445 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.392352  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2277  major facilitator family transporter  24.41 
 
 		 465 aa  90.9  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1898  major facilitator superfamily MFS_1  25.11 
 
 		 448 aa  90.9  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0941  major facilitator transporter  26.14 
 
 		 445 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3102  major facilitator family transporter  26.14 
 
 		 445 aa  90.9  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000189575  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0089  putative metabolite transport protein YaaU  25.85 
 
 		 468 aa  90.5  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.343682  normal  0.458255 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  22.64 
 
 		 460 aa  90.5  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0086  putative metabolite transport protein YaaU  25.85 
 
 		 468 aa  90.5  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.509383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0085  putative metabolite transport protein YaaU  25.85 
 
 		 468 aa  90.1  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0085  putative metabolite transport protein YaaU  25.85 
 
 		 468 aa  90.1  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0088  putative metabolite transport protein YaaU  25.85 
 
 		 468 aa  90.1  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  25.57 
 
 		 471 aa  90.1  8e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749242  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1682  D-xylose proton-symporter  24.52 
 
 		 458 aa  89.7  9e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000961132  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0462  major facilitator family transporter  27.7 
 
 		 436 aa  89.4  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0532  major facilitator family transporter  27.7 
 
 		 436 aa  89  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4418  D-xylose transporter XylE  26.73 
 
 		 491 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317086 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4271  D-xylose transporter XylE  24.79 
 
 		 491 aa  89  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4043  general substrate transporter  25.29 
 
 		 452 aa  88.6  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2634  host factor Hfq  27.64 
 
 		 470 aa  88.2  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000323251  normal  0.44262 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0727  phosphate transporter  25.28 
 
 		 442 aa  88.2  3e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0672  sugar transporter  25.68 
 
 		 493 aa  87.8  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2085  major facilitator superfamily transporter  32.99 
 
 		 501 aa  88.2  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00714059  normal  0.900579 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0831  putative iorganic phosphate transporter  25.28 
 
 		 442 aa  87.8  4e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03903  D-xylose transporter  24.79 
 
 		 491 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03863  hypothetical protein  24.79 
 
 		 491 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3965  sugar transporter  24.79 
 
 		 491 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  24.68 
 
 		 492 aa  87.8  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3998  D-xylose transporter XylE  24.79 
 
 		 491 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.688802  normal  0.586255 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5512  D-xylose transporter XylE  24.79 
 
 		 491 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4582  D-xylose transporter XylE  24.79 
 
 		 491 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4483  sugar transporter  24.86 
 
 		 474 aa  87.8  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125142  normal  0.0950882 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7518  sugar transporter  24.88 
 
 		 507 aa  87.4  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1414  major facilitator superfamily MFS_1  25.37 
 
 		 444 aa  87.4  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6226  major facilitator transporter  28.45 
 
 		 460 aa  86.7  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  23.24 
 
 		 479 aa  86.7  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  24.12 
 
 		 466 aa  86.3  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  26.62 
 
 		 477 aa  85.9  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1026  major facilitator transporter  29.63 
 
 		 494 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.76492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3612  major facilitator transporter  31.94 
 
 		 476 aa  86.3  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.384434  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00600  MFS transporter, sugar porter family  22.97 
 
 		 499 aa  86.3  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0853  D-xylose proton-symporter  26.85 
 
 		 459 aa  86.3  0.000000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3530  major facilitator transporter  23.83 
 
 		 469 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229516  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0861  major facilitator superfamily MFS_1  23.94 
 
 		 483 aa  85.1  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0881  major facilitator superfamily MFS_1  26.83 
 
 		 448 aa  85.5  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.202747  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  25.56 
 
 		 480 aa  85.5  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8679  sugar transporter  26.46 
 
 		 533 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.546222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  23.24 
 
 		 479 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0654  major facilitator superfamily sugar transporter  24.5 
 
 		 443 aa  84.7  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.866655  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6395  major facilitator transporter  28.45 
 
 		 460 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2681  general substrate transporter  24.26 
 
 		 438 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.31051 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6628  major facilitator transporter  28.45 
 
 		 460 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.990266 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>