More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0328 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0328  major facilitator transporter  100 
 
 		 410 aa  793    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1013  major facilitator transporter  40.39 
 
 		 437 aa  298  8e-80  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00471133 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1199  major facilitator transporter  29.53 
 
 		 449 aa  116  7.999999999999999e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.329766  hitchhiker  0.000717058 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0759  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 403 aa  108  2e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0254  major facilitator transporter  26.82 
 
 		 439 aa  89  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.180707 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2550  major facilitator transporter  29.77 
 
 		 481 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.325766 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2423  major facilitator superfamily MFS_1  22.92 
 
 		 434 aa  82  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.193293  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  35.03 
 
 		 447 aa  77  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2711  major facilitator transporter  27.88 
 
 		 480 aa  76.3  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0257064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  25.31 
 
 		 446 aa  73.6  0.000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0195  major facilitator transporter  30.09 
 
 		 465 aa  72.4  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1576  major facilitator superfamily MFS_1  31.11 
 
 		 483 aa  71.6  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2085  major facilitator superfamily transporter  31.25 
 
 		 501 aa  71.2  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00714059  normal  0.900579 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0395  major facilitator superfamily MFS_1  27.82 
 
 		 472 aa  70.5  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.90687 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 445 aa  70.1  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3353  major facilitator superfamily transporter  32.53 
 
 		 483 aa  70.1  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.379633  decreased coverage  0.00165452 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  35.44 
 
 		 435 aa  68.9  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29790  sugar phosphate permease  34.34 
 
 		 485 aa  68.2  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  30.32 
 
 		 474 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  30.32 
 
 		 474 aa  67  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  30.32 
 
 		 473 aa  67  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  32.69 
 
 		 473 aa  67.4  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9266  major facilitator transporter  26.06 
 
 		 479 aa  67  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.248133 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  30.32 
 
 		 474 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.3 
 
 		 472 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  37.09 
 
 		 477 aa  66.6  0.0000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1458  major facilitator transporter  27.44 
 
 		 474 aa  65.9  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.201779  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  28.66 
 
 		 472 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4845  major facilitator transporter  29.6 
 
 		 457 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3612  major facilitator transporter  26.97 
 
 		 476 aa  65.5  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.384434  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  28.19 
 
 		 474 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1785  major facilitator transporter  25.98 
 
 		 493 aa  65.1  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  31.29 
 
 		 476 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1823  major facilitator transporter  31.03 
 
 		 442 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.112408  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7483  major facilitator transporter  30.1 
 
 		 428 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0313  major facilitator superfamily MFS_1  31.65 
 
 		 489 aa  63.2  0.000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3653  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 446 aa  63.2  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  29.25 
 
 		 473 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08810  arabinose efflux permease family protein  25.93 
 
 		 494 aa  62.8  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  27.67 
 
 		 451 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  32.45 
 
 		 449 aa  62.8  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  28.04 
 
 		 451 aa  62  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1543  major facilitator transporter  30.77 
 
 		 382 aa  61.6  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0259552 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3242  major facilitator superfamily MFS_1  34.9 
 
 		 539 aa  61.6  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00325514  normal  0.76951 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  29.15 
 
 		 456 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6100  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 482 aa  60.8  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  27.78 
 
 		 456 aa  60.8  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1026  major facilitator transporter  26.72 
 
 		 494 aa  60.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.76492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0348  major facilitator transporter  29.25 
 
 		 423 aa  60.5  0.00000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2754  major facilitator superfamily MFS_1  31.76 
 
 		 465 aa  60.5  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3027  major facilitator transporter  25.77 
 
 		 481 aa  59.7  0.00000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1075  major facilitator transporter  27.14 
 
 		 417 aa  59.3  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.691056  normal  0.0656775 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3160  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 		 461 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0312386 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2715  major facilitator transporter  30.34 
 
 		 491 aa  59.3  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0323  major facilitator superfamily MFS_1  32.5 
 
 		 488 aa  58.9  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  30.64 
 
 		 450 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1973  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 417 aa  58.9  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.696762  hitchhiker  0.00000123368 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3624  major facilitator superfamily MFS_1  27.81 
 
 		 597 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  25.43 
 
 		 463 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  24.04 
 
 		 460 aa  57.8  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1619  major facilitator transporter  31.79 
 
 		 454 aa  57.4  0.0000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.366552  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  33.52 
 
 		 447 aa  57.4  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  28.99 
 
 		 470 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  26.71 
 
 		 459 aa  57  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7236  major facilitator superfamily MFS_1  30.13 
 
 		 484 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.440846  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  27.34 
 
 		 459 aa  56.6  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3249  major facilitator superfamily MFS_1  30.14 
 
 		 497 aa  56.6  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.468482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1407  putative sialic acid transporter  24.24 
 
 		 510 aa  56.6  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  33.33 
 
 		 457 aa  56.6  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4572  General substrate transporter  26.24 
 
 		 477 aa  56.6  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  27.52 
 
 		 476 aa  56.6  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3221  General substrate transporter  28.9 
 
 		 457 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1298  putative sialic acid transporter  26.8 
 
 		 510 aa  55.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6486  major facilitator transporter  26.39 
 
 		 488 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.158233  normal  0.579657 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3519  putative sialic acid transporter  28.77 
 
 		 496 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0325  major facilitator superfamily MFS_1  34.69 
 
 		 477 aa  55.8  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.184754  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0856  major facilitator superfamily protein  28.21 
 
 		 483 aa  55.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0609243 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1671  major facilitator transporter  35.51 
 
 		 381 aa  56.2  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000914056 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3706  putative sialic acid transporter  28.77 
 
 		 496 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.322469  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2770  putative sialic acid transporter  26.8 
 
 		 510 aa  55.8  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00045382 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  23.64 
 
 		 451 aa  55.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  29.03 
 
 		 478 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  29.03 
 
 		 478 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  29.03 
 
 		 478 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  29.03 
 
 		 478 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  29.03 
 
 		 478 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2816  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  26.96 
 
 		 422 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  29.03 
 
 		 478 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5143  major facilitator superfamily MFS_1  23.86 
 
 		 495 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2434  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 452 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  29.03 
 
 		 478 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  32.89 
 
 		 435 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5839  general substrate transporter  37.04 
 
 		 453 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.450465 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3698  putative sialic acid transporter  28.66 
 
 		 496 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0953  general substrate transporter  39.81 
 
 		 458 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.260148 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1094  major facilitator transporter  31.06 
 
 		 427 aa  54.7  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5496  major facilitator transporter  24.82 
 
 		 490 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3601  putative sialic acid transporter  28.66 
 
 		 496 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3636  putative sialic acid transporter  28.66 
 
 		 496 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0983  General substrate transporter  28.95 
 
 		 481 aa  54.3  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.359093  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>