More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1973 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_1973  major facilitator transporter  100 
 
 		 417 aa  791    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.696762  hitchhiker  0.00000123368 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1075  major facilitator transporter  95.2 
 
 		 417 aa  615  1e-175  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.691056  normal  0.0656775 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2195  major facilitator transporter  73.08 
 
 		 419 aa  545  1e-154  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.373934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0348  major facilitator transporter  64.07 
 
 		 423 aa  488  1e-137  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1199  major facilitator transporter  32.12 
 
 		 449 aa  177  2e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.329766  hitchhiker  0.000717058 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2423  major facilitator superfamily MFS_1  25.44 
 
 		 434 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.193293  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0254  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 439 aa  106  8e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.180707 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0759  major facilitator transporter  29.06 
 
 		 403 aa  106  9e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0195  major facilitator transporter  33.48 
 
 		 465 aa  103  5e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2828  major facilitator transporter  32.15 
 
 		 457 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1652  general substrate transporter  27.13 
 
 		 452 aa  94.4  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1543  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 452 aa  94.4  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1720  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 452 aa  93.6  5e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0929915  hitchhiker  0.00114848 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04490  sugar phosphate permease  31.93 
 
 		 469 aa  92.8  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  25.31 
 
 		 446 aa  91.7  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  31.58 
 
 		 480 aa  92  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1013  major facilitator transporter  27.03 
 
 		 437 aa  88.2  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00471133 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  30.64 
 
 		 477 aa  88.2  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1094  major facilitator transporter  28.77 
 
 		 427 aa  87.4  4e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  28.49 
 
 		 438 aa  86.7  7e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6930  major facilitator superfamily MFS_1  29.2 
 
 		 460 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4043  general substrate transporter  27.58 
 
 		 452 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2255  general substrate transporter  28.39 
 
 		 446 aa  84.3  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000684239  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1576  major facilitator superfamily MFS_1  33.18 
 
 		 483 aa  83.6  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1543  major facilitator transporter  31.17 
 
 		 382 aa  83.6  0.000000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0259552 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1326  major facilitator transporter  29.24 
 
 		 464 aa  82  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.367254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3234  general substrate transporter  26.17 
 
 		 445 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2467  major facilitator transporter  28.57 
 
 		 453 aa  81.6  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2681  general substrate transporter  27.25 
 
 		 438 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.31051 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2911  major facilitator family transporter  25.64 
 
 		 445 aa  80.1  0.00000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2900  major facilitator family transporter  25.9 
 
 		 445 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  31.06 
 
 		 451 aa  79.7  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02616  predicted transporter  25.64 
 
 		 445 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0917  major facilitator superfamily MFS_1  26.6 
 
 		 469 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0941  major facilitator transporter  25.64 
 
 		 445 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02579  hypothetical protein  25.64 
 
 		 445 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3102  major facilitator family transporter  25.64 
 
 		 445 aa  79  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000189575  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3624  major facilitator superfamily MFS_1  33.94 
 
 		 597 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3073  major facilitator family transporter  25.64 
 
 		 445 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.392352  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  24.78 
 
 		 457 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  25.82 
 
 		 462 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1166  major facilitator superfamily MFS_1  29.74 
 
 		 450 aa  78.2  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000374507 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  31 
 
 		 460 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  26.95 
 
 		 461 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  29.74 
 
 		 526 aa  76.3  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  27.62 
 
 		 438 aa  75.9  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  25.51 
 
 		 456 aa  75.5  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2028  major facilitator superfamily permease  27.05 
 
 		 428 aa  75.9  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2549  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 		 495 aa  75.5  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2518  major facilitator transporter  27.39 
 
 		 437 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2085  major facilitator superfamily transporter  28.7 
 
 		 501 aa  74.7  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00714059  normal  0.900579 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1992  major facilitator transporter  36.42 
 
 		 436 aa  74.7  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.35 
 
 		 474 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973666  normal  0.0403058 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1671  major facilitator transporter  30.4 
 
 		 381 aa  73.9  0.000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000914056 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3612  major facilitator transporter  31.63 
 
 		 476 aa  73.6  0.000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.384434  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  25.17 
 
 		 462 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0856  major facilitator superfamily protein  28.42 
 
 		 483 aa  73.6  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0609243 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  31.28 
 
 		 462 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0129  putative permease  26.62 
 
 		 459 aa  73.2  0.000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.549779  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  27.45 
 
 		 487 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0839463 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  23.08 
 
 		 423 aa  72.4  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3027  major facilitator transporter  32.77 
 
 		 481 aa  72.4  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  27.21 
 
 		 455 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2550  major facilitator transporter  26.84 
 
 		 481 aa  72  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.325766 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  25.19 
 
 		 476 aa  72  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1458  major facilitator transporter  26.88 
 
 		 474 aa  71.6  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.201779  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  27.8 
 
 		 455 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0730  General substrate transporter  26.32 
 
 		 464 aa  71.2  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1683  major facilitator transporter  31.85 
 
 		 415 aa  71.6  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.249309  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  27.59 
 
 		 466 aa  70.9  0.00000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1089  major facilitator transporter  27.4 
 
 		 450 aa  70.9  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.10347  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09740  putative MFS transporter  30.53 
 
 		 442 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00809883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0974  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  32.38 
 
 		 462 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000109951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  24.49 
 
 		 451 aa  69.7  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4845  major facilitator transporter  28.67 
 
 		 457 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 485 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1668  major facilitator transporter  27.59 
 
 		 487 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.339414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1026  major facilitator transporter  34.46 
 
 		 494 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.76492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  26.6 
 
 		 468 aa  68.9  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9266  major facilitator transporter  27.12 
 
 		 479 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.248133 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  26.3 
 
 		 492 aa  68.6  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1408  major facilitator transporter  34.38 
 
 		 484 aa  68.6  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0000966462  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0049  major facilitator family transporter  24.31 
 
 		 443 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  28.45 
 
 		 468 aa  68.2  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1785  major facilitator transporter  24.02 
 
 		 493 aa  68.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00049  predicted transporter  24.31 
 
 		 443 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  29.19 
 
 		 459 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3554  major facilitator superfamily MFS_1  24.31 
 
 		 443 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0051  major facilitator family transporter  24.31 
 
 		 443 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08810  arabinose efflux permease family protein  28.32 
 
 		 494 aa  68.2  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00048  hypothetical protein  24.31 
 
 		 443 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0049  major facilitator family transporter  24.31 
 
 		 443 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3610  major facilitator transporter  24.31 
 
 		 443 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0100231 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  27.37 
 
 		 450 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0047  major facilitator family transporter  24.31 
 
 		 443 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.454742 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0532  major facilitator family transporter  34.91 
 
 		 436 aa  67.8  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0462  major facilitator family transporter  34.91 
 
 		 436 aa  67.8  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0270  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 477 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0250869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2238  glucose transport protein  26.86 
 
 		 471 aa  67.4  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  27.5 
 
 		 485 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>