More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0759 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0759  major facilitator transporter  100 
 
 		 403 aa  786    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2423  major facilitator superfamily MFS_1  34.61 
 
 		 434 aa  208  1e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.193293  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0254  major facilitator transporter  33.64 
 
 		 439 aa  202  9.999999999999999e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.180707 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1013  major facilitator transporter  29.01 
 
 		 437 aa  176  5e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00471133 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1199  major facilitator transporter  33.48 
 
 		 449 aa  176  8e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.329766  hitchhiker  0.000717058 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0348  major facilitator transporter  31.62 
 
 		 423 aa  137  4e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0328  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 410 aa  122  9.999999999999999e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2195  major facilitator transporter  30.84 
 
 		 419 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.373934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1973  major facilitator transporter  28.54 
 
 		 417 aa  88.2  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.696762  hitchhiker  0.00000123368 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  23.91 
 
 		 446 aa  73.6  0.000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1543  major facilitator transporter  25.16 
 
 		 382 aa  72.8  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0259552 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  27.06 
 
 		 423 aa  72  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1671  major facilitator transporter  28.06 
 
 		 381 aa  68.9  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000914056 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  30.05 
 
 		 476 aa  67  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1094  major facilitator transporter  26.85 
 
 		 427 aa  67  0.0000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1576  major facilitator superfamily MFS_1  33.57 
 
 		 483 aa  65.1  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_52000  MFS family transporter: hexose  25.39 
 
 		 462 aa  64.3  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.128216  normal  0.0380146 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2085  major facilitator superfamily transporter  31.65 
 
 		 501 aa  63.5  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00714059  normal  0.900579 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2816  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  26.71 
 
 		 422 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28350  arabinose efflux permease family protein  28.78 
 
 		 465 aa  62.8  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1785  major facilitator transporter  33.81 
 
 		 493 aa  60.8  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  24.62 
 
 		 472 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  25.06 
 
 		 455 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0195  major facilitator transporter  34.64 
 
 		 465 aa  60.1  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  25.37 
 
 		 472 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  29.63 
 
 		 451 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3608  general substrate transporter  24.62 
 
 		 469 aa  58.2  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0821  major facilitator transporter  27.36 
 
 		 403 aa  58.2  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2550  major facilitator transporter  24.8 
 
 		 481 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.325766 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3708  major facilitator superfamily transporter  28.88 
 
 		 441 aa  57  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0245193 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  24.81 
 
 		 455 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9266  major facilitator transporter  31.94 
 
 		 479 aa  57  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.248133 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1484  major facilitator superfamily MFS_1  32.85 
 
 		 474 aa  57  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.074526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1076  major facilitator transporter  32.99 
 
 		 382 aa  57  0.0000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.197988  normal  0.0589295 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1809  major facilitator family protein  32.85 
 
 		 499 aa  57  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1117  major facilitator transporter  27.32 
 
 		 461 aa  56.6  0.0000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.316307  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 		 456 aa  55.8  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  32.37 
 
 		 457 aa  56.2  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5758  major facilitator protein family permease  27.03 
 
 		 443 aa  56.2  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2715  major facilitator transporter  31.16 
 
 		 491 aa  56.2  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  29.85 
 
 		 460 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0395  major facilitator superfamily MFS_1  30.5 
 
 		 472 aa  55.1  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.90687 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1093  4-hydroxybenzoate transporter  31.52 
 
 		 454 aa  55.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.818104 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2754  sugar transporter  28.76 
 
 		 497 aa  55.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3592  sugar transporter  28.71 
 
 		 442 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369851  hitchhiker  0.00000823269 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  25.19 
 
 		 459 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2828  major facilitator transporter  25.55 
 
 		 457 aa  55.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3353  major facilitator superfamily transporter  31.16 
 
 		 483 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.379633  decreased coverage  0.00165452 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1326  major facilitator transporter  25.98 
 
 		 464 aa  55.1  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.367254  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03084  sialic acid transporter  25.53 
 
 		 496 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0482  sialic acid transporter  25.53 
 
 		 496 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3552  putative sialic acid transporter  25.53 
 
 		 496 aa  54.7  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03035  hypothetical protein  25.53 
 
 		 496 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3698  putative sialic acid transporter  27.41 
 
 		 496 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0856  major facilitator superfamily protein  30.22 
 
 		 483 aa  54.7  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0609243 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3624  major facilitator superfamily MFS_1  31.25 
 
 		 597 aa  54.7  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3531  putative sialic acid transporter  27.41 
 
 		 496 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0482  putative sialic acid transporter  25.53 
 
 		 496 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.624928 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4541  putative sialic acid transporter  25.53 
 
 		 496 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.315393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3601  putative sialic acid transporter  27.41 
 
 		 496 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3636  putative sialic acid transporter  27.41 
 
 		 496 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0712  general substrate transporter  27.67 
 
 		 463 aa  54.7  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0221085  hitchhiker  0.00000000000000199551 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3412  putative sialic acid transporter  25.53 
 
 		 496 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.510281  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3706  putative sialic acid transporter  28.19 
 
 		 496 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.322469  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  25.12 
 
 		 447 aa  54.3  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3519  putative sialic acid transporter  28.19 
 
 		 496 aa  54.3  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4643  major facilitator superfamily MFS_1  28.86 
 
 		 492 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4276  major facilitator transporter  28.86 
 
 		 492 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3660  putative sialic acid transporter  27.98 
 
 		 495 aa  53.5  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.723795  normal  0.17962 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2238  glucose transport protein  24.14 
 
 		 471 aa  53.1  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  24.55 
 
 		 398 aa  53.1  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5543  major facilitator family transporter  25.57 
 
 		 399 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000723204  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1972  major facilitator transporter  30.93 
 
 		 372 aa  53.1  0.000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.106436  hitchhiker  0.000000141049 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1089  major facilitator transporter  23.38 
 
 		 450 aa  53.1  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.10347  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6930  major facilitator superfamily MFS_1  24.52 
 
 		 460 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1407  putative sialic acid transporter  28.38 
 
 		 510 aa  52.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  29.1 
 
 		 476 aa  52.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3529  putative sialic acid transporter  25 
 
 		 496 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4676  major facilitator transporter  23.6 
 
 		 420 aa  52.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.573448  normal  0.215223 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  25.15 
 
 		 485 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2632  major facilitator transporter  26.17 
 
 		 402 aa  52.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1056  major facilitator transporter  23.22 
 
 		 406 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  25.15 
 
 		 485 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1536  major facilitator transporter  23.22 
 
 		 406 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1512  major facilitator transporter  23.22 
 
 		 406 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075206 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1561  major facilitator transporter  31.58 
 
 		 509 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.141298  normal  0.174962 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2770  putative sialic acid transporter  28.38 
 
 		 510 aa  52  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00045382 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1298  putative sialic acid transporter  28.38 
 
 		 510 aa  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1718  major facilitator transporter  23.99 
 
 		 406 aa  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.658229  hitchhiker  0.000872615 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0974  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  28.36 
 
 		 462 aa  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000109951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5409  major facilitator family transporter  25.57 
 
 		 399 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000725853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1985  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  24.27 
 
 		 410 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.884683 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  23.72 
 
 		 474 aa  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3282  major facilitator superfamily MFS_1  28.17 
 
 		 424 aa  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.395947 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1458  major facilitator transporter  23.6 
 
 		 406 aa  51.6  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34861  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5115  major facilitator family transporter  25.16 
 
 		 399 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000159613  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4040  major facilitator transporter  28.97 
 
 		 435 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248694  decreased coverage  0.0016848 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  22.66 
 
 		 464 aa  51.6  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2219  major facilitator superfamily MFS_1  30.25 
 
 		 441 aa  51.2  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.200056 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1512  general substrate transporter  23.28 
 
 		 467 aa  51.2  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.925564  normal  0.774713 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>