More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1199 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1199  major facilitator transporter  100 
 
 		 449 aa  884    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.329766  hitchhiker  0.000717058 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2423  major facilitator superfamily MFS_1  37.44 
 
 		 434 aa  233  6e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.193293  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0254  major facilitator transporter  35.1 
 
 		 439 aa  207  2e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.180707 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0348  major facilitator transporter  35.36 
 
 		 423 aa  171  3e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0759  major facilitator transporter  32.22 
 
 		 403 aa  169  1e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2195  major facilitator transporter  32.42 
 
 		 419 aa  167  4e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.373934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1013  major facilitator transporter  30.41 
 
 		 437 aa  163  5.0000000000000005e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00471133 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1973  major facilitator transporter  33 
 
 		 417 aa  140  3e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.696762  hitchhiker  0.00000123368 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1075  major facilitator transporter  32 
 
 		 417 aa  134  5e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.691056  normal  0.0656775 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0328  major facilitator transporter  29.25 
 
 		 410 aa  119  9e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  29.48 
 
 		 446 aa  99.8  9e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  29.05 
 
 		 472 aa  94  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 474 aa  93.6  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  28.85 
 
 		 472 aa  93.6  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  27.99 
 
 		 451 aa  87.4  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1543  major facilitator transporter  30.4 
 
 		 382 aa  83.6  0.000000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0259552 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  26.86 
 
 		 456 aa  79  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2238  glucose transport protein  25.91 
 
 		 471 aa  77.8  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.154375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  26.17 
 
 		 459 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  32.54 
 
 		 449 aa  76.6  0.0000000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1671  major facilitator transporter  29 
 
 		 381 aa  75.9  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000914056 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2255  general substrate transporter  23.65 
 
 		 446 aa  76.3  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000684239  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4863  sugar transporter  26.86 
 
 		 464 aa  76.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.83447 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2073  major facilitator superfamily transporter  26.73 
 
 		 467 aa  75.9  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0013865 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6930  major facilitator superfamily MFS_1  25.59 
 
 		 460 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  28.06 
 
 		 451 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  24.21 
 
 		 476 aa  74.3  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1576  major facilitator superfamily MFS_1  34.3 
 
 		 483 aa  74.3  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  26.24 
 
 		 455 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  25.41 
 
 		 480 aa  73.6  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2550  major facilitator transporter  27.06 
 
 		 481 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.325766 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  31.1 
 
 		 459 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1377  major facilitator superfamily MFS_1  28.99 
 
 		 445 aa  73.6  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2518  major facilitator transporter  26.42 
 
 		 437 aa  72  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  25.65 
 
 		 474 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0313  major facilitator superfamily MFS_1  34.88 
 
 		 489 aa  71.2  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2486  sugar transporter  22.81 
 
 		 509 aa  71.2  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.625827 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1898  major facilitator superfamily MFS_1  25.44 
 
 		 448 aa  71.2  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  25.98 
 
 		 455 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  24.35 
 
 		 477 aa  71.6  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  27.04 
 
 		 476 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  26.39 
 
 		 457 aa  71.2  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08810  arabinose efflux permease family protein  24.2 
 
 		 494 aa  71.2  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  25.78 
 
 		 474 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0539  major facilitator transporter  25.72 
 
 		 473 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3259  major facilitator transporter  25.65 
 
 		 474 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.331503  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3234  general substrate transporter  24.69 
 
 		 445 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2681  general substrate transporter  23.48 
 
 		 438 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.31051 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4043  general substrate transporter  25.45 
 
 		 452 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 487 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  25.78 
 
 		 478 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3624  major facilitator superfamily MFS_1  34.91 
 
 		 597 aa  67  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3374  major facilitator superfamily MFS_1  26.85 
 
 		 398 aa  67  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000527195  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  27.2 
 
 		 463 aa  67  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0195  major facilitator transporter  26 
 
 		 465 aa  66.6  0.0000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 398 aa  66.6  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1166  major facilitator superfamily MFS_1  26.72 
 
 		 450 aa  66.6  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000374507 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4572  General substrate transporter  26 
 
 		 477 aa  66.6  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1326  major facilitator transporter  29.23 
 
 		 464 aa  66.6  0.0000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.367254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  28.81 
 
 		 447 aa  66.2  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4019  major facilitator superfamily MFS_1  27.41 
 
 		 435 aa  66.2  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000381325  normal  0.201783 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  25.89 
 
 		 478 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  25.89 
 
 		 478 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  27.57 
 
 		 423 aa  65.5  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2126  major facilitator superfamily MFS_1  28.01 
 
 		 444 aa  65.1  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.647931  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9266  major facilitator transporter  26.86 
 
 		 479 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.248133 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.19 
 
 		 474 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973666  normal  0.0403058 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1044  major facilitator superfamily MFS_1  28.48 
 
 		 443 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  25.89 
 
 		 478 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1829  General substrate transporter  27.43 
 
 		 480 aa  65.1  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.392144  normal  0.18053 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.07 
 
 		 468 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  25.89 
 
 		 478 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  25.89 
 
 		 478 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  25.67 
 
 		 460 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0526  sugar transporter  24.06 
 
 		 457 aa  64.7  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.637088  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1253  general substrate transporter  28.48 
 
 		 496 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.425201  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  26.79 
 
 		 447 aa  64.7  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  26.69 
 
 		 462 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4111  major facilitator transporter  30.29 
 
 		 442 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3533  major facilitator transporter  25.47 
 
 		 473 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1785  major facilitator transporter  31.29 
 
 		 493 aa  64.7  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  29.05 
 
 		 462 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5624  proline/glycine betaine transporter  24.85 
 
 		 500 aa  63.9  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03982  proline/glycine betaine transporter  24.85 
 
 		 500 aa  63.9  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3881  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  24.85 
 
 		 500 aa  63.9  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03943  hypothetical protein  24.85 
 
 		 500 aa  63.9  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1509  major facilitator superfamily proline/betaine transporter  28.26 
 
 		 503 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3916  proline/glycine betaine transporter  24.85 
 
 		 500 aa  63.9  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.382911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0368  sugar transporter  26 
 
 		 448 aa  63.9  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.968703  hitchhiker  0.00000305958 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3160  major facilitator superfamily MFS_1  28.88 
 
 		 461 aa  63.9  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0312386 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  25.44 
 
 		 462 aa  63.9  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0315  proline/glycine betaine transporter  25.23 
 
 		 500 aa  63.5  0.000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0135583 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21330  sugar phosphate permease  31.76 
 
 		 477 aa  63.5  0.000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428425  hitchhiker  0.00018034 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4576  proline/glycine betaine transporter  24.85 
 
 		 500 aa  63.5  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0911  major facilitator family transporter  25.65 
 
 		 478 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.577596  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5665  sugar transporter  24.6 
 
 		 471 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.600192 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3221  General substrate transporter  24.86 
 
 		 457 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4351  proline/glycine betaine transporter  24.54 
 
 		 500 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4665  proline/glycine betaine transporter  24.54 
 
 		 500 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2255  major facilitator superfamily MFS_1  33.53 
 
 		 473 aa  63.2  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>