More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1075 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_1973  major facilitator transporter  95.2 
 
 		 417 aa  648    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.696762  hitchhiker  0.00000123368 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1075  major facilitator transporter  100 
 
 		 417 aa  784    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.691056  normal  0.0656775 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2195  major facilitator transporter  73.32 
 
 		 419 aa  548  1e-155  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.373934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0348  major facilitator transporter  64.07 
 
 		 423 aa  484  1e-136  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1199  major facilitator transporter  33.79 
 
 		 449 aa  178  1e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.329766  hitchhiker  0.000717058 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2423  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 434 aa  119  9e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.193293  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0759  major facilitator transporter  29.11 
 
 		 403 aa  106  6e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0254  major facilitator transporter  27.38 
 
 		 439 aa  105  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.180707 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2828  major facilitator transporter  29.85 
 
 		 457 aa  100  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0195  major facilitator transporter  31.47 
 
 		 465 aa  94.4  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1652  general substrate transporter  27.39 
 
 		 452 aa  93.6  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1543  major facilitator transporter  27.39 
 
 		 452 aa  93.6  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1720  major facilitator transporter  27.39 
 
 		 452 aa  93.6  6e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0929915  hitchhiker  0.00114848 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  25.7 
 
 		 446 aa  93.2  7e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1013  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 437 aa  91.3  3e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00471133 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1576  major facilitator superfamily MFS_1  35 
 
 		 483 aa  89  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  31.05 
 
 		 480 aa  88.6  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2255  general substrate transporter  30.55 
 
 		 446 aa  88.2  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000684239  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  28.15 
 
 		 438 aa  87.4  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3234  general substrate transporter  26.68 
 
 		 445 aa  87.4  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4043  general substrate transporter  27.25 
 
 		 452 aa  86.7  7e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2681  general substrate transporter  27.25 
 
 		 438 aa  86.3  9e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.31051 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04490  sugar phosphate permease  30.69 
 
 		 469 aa  84.7  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6930  major facilitator superfamily MFS_1  28.73 
 
 		 460 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  32.29 
 
 		 477 aa  84  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2467  major facilitator transporter  29.18 
 
 		 453 aa  84  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1094  major facilitator transporter  26.27 
 
 		 427 aa  83.2  0.000000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3624  major facilitator superfamily MFS_1  33.18 
 
 		 597 aa  83.2  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  27.62 
 
 		 462 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  32.77 
 
 		 451 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2085  major facilitator superfamily transporter  30.23 
 
 		 501 aa  81.3  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00714059  normal  0.900579 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1326  major facilitator transporter  28.16 
 
 		 464 aa  80.9  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.367254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2900  major facilitator family transporter  27.11 
 
 		 445 aa  79.7  0.00000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3073  major facilitator family transporter  26.53 
 
 		 445 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.392352  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02616  predicted transporter  26.53 
 
 		 445 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3102  major facilitator family transporter  26.53 
 
 		 445 aa  79  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000189575  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0941  major facilitator transporter  26.53 
 
 		 445 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02579  hypothetical protein  26.53 
 
 		 445 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0917  major facilitator superfamily MFS_1  26.53 
 
 		 469 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2911  major facilitator family transporter  26.53 
 
 		 445 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  27.66 
 
 		 462 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2028  major facilitator superfamily permease  26.68 
 
 		 428 aa  79  0.0000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2549  major facilitator superfamily MFS_1  29.86 
 
 		 495 aa  77.4  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  28.09 
 
 		 487 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  36.32 
 
 		 474 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973666  normal  0.0403058 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  31.3 
 
 		 460 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1458  major facilitator transporter  28.64 
 
 		 474 aa  76.6  0.0000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.201779  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1543  major facilitator transporter  30.06 
 
 		 382 aa  76.6  0.0000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0259552 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  33.18 
 
 		 462 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 438 aa  76.6  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  27.59 
 
 		 455 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1166  major facilitator superfamily MFS_1  30.41 
 
 		 450 aa  75.9  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000374507 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2550  major facilitator transporter  26.82 
 
 		 481 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.325766 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 451 aa  76.3  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  30.24 
 
 		 526 aa  76.3  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  27.96 
 
 		 455 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 457 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3220  sugar transporter  30.86 
 
 		 468 aa  74.3  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3612  major facilitator transporter  28.85 
 
 		 476 aa  74.7  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.384434  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1217  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 487 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.207678  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1668  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 487 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.339414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1785  major facilitator transporter  24.75 
 
 		 493 aa  74.7  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1408  major facilitator transporter  34.12 
 
 		 484 aa  74.7  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0000966462  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1696  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 487 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4496  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0462  major facilitator family transporter  34.32 
 
 		 436 aa  73.9  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  28.5 
 
 		 485 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0395  major facilitator superfamily MFS_1  35.44 
 
 		 472 aa  74.3  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.90687 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0532  major facilitator family transporter  34.32 
 
 		 436 aa  73.9  0.000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0959  sugar transporter  26.8 
 
 		 472 aa  73.9  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2715  major facilitator transporter  27.44 
 
 		 491 aa  73.9  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1683  major facilitator transporter  33.04 
 
 		 415 aa  73.2  0.000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.249309  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1633  general substrate transporter  24.79 
 
 		 476 aa  73.2  0.000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.904084  normal  0.408822 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0974  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  32.43 
 
 		 462 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000109951  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0856  major facilitator superfamily protein  28.35 
 
 		 483 aa  73.2  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0609243 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  24.63 
 
 		 456 aa  72.8  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2863  major facilitator superfamily MFS_1  23.5 
 
 		 423 aa  72.4  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.82901  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  29.01 
 
 		 459 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00049  predicted transporter  24.17 
 
 		 443 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3554  major facilitator superfamily MFS_1  24.17 
 
 		 443 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00048  hypothetical protein  24.17 
 
 		 443 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  29.57 
 
 		 485 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3610  major facilitator transporter  24.17 
 
 		 443 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0100231 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1992  major facilitator transporter  36.81 
 
 		 436 aa  71.6  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.252047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0049  major facilitator family transporter  24.17 
 
 		 443 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0051  major facilitator family transporter  24.17 
 
 		 443 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  26.01 
 
 		 461 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0049  major facilitator family transporter  23.89 
 
 		 443 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0730  General substrate transporter  26.18 
 
 		 464 aa  72.4  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0047  major facilitator family transporter  24.17 
 
 		 443 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.454742 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 485 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2754  sugar transporter  28.47 
 
 		 497 aa  72  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1671  major facilitator transporter  30.4 
 
 		 381 aa  71.2  0.00000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000914056 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1363  sugar transporter family protein  29.46 
 
 		 473 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498359  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2518  major facilitator transporter  27.6 
 
 		 437 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3027  major facilitator transporter  31.9 
 
 		 481 aa  70.9  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2277  major facilitator family transporter  25.32 
 
 		 465 aa  70.5  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1924  major facilitator superfamily MFS_1  25.32 
 
 		 465 aa  70.5  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0129  putative permease  25.86 
 
 		 459 aa  70.1  0.00000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.549779  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1174  sugar transporter  28.45 
 
 		 473 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08810  arabinose efflux permease family protein  26.75 
 
 		 494 aa  69.3  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>