More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2195 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_2195  major facilitator transporter  100 
 
 		 419 aa  802    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.373934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1973  major facilitator transporter  73.08 
 
 		 417 aa  503  1e-141  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.696762  hitchhiker  0.00000123368 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1075  major facilitator transporter  73.32 
 
 		 417 aa  486  1e-136  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.691056  normal  0.0656775 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0348  major facilitator transporter  61.76 
 
 		 423 aa  478  1e-134  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1199  major facilitator transporter  31.35 
 
 		 449 aa  182  9.000000000000001e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.329766  hitchhiker  0.000717058 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2423  major facilitator superfamily MFS_1  25.57 
 
 		 434 aa  126  8.000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.193293  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0254  major facilitator transporter  28.05 
 
 		 439 aa  122  9e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.180707 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0759  major facilitator transporter  30.86 
 
 		 403 aa  108  1e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1013  major facilitator transporter  25.34 
 
 		 437 aa  101  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00471133 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6930  major facilitator superfamily MFS_1  30.11 
 
 		 460 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.11506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  26.99 
 
 		 446 aa  98.2  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2828  major facilitator transporter  30.35 
 
 		 457 aa  95.9  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1458  major facilitator transporter  29.22 
 
 		 474 aa  91.3  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.201779  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3624  major facilitator superfamily MFS_1  34.23 
 
 		 597 aa  87.4  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  27.91 
 
 		 450 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1652  general substrate transporter  28.61 
 
 		 452 aa  82.8  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1543  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 452 aa  82.8  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1720  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 452 aa  82.4  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0929915  hitchhiker  0.00114848 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0195  major facilitator transporter  29.91 
 
 		 465 aa  82.8  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0967  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  26.06 
 
 		 462 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1094  major facilitator transporter  27.34 
 
 		 427 aa  80.9  0.00000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4043  general substrate transporter  26.9 
 
 		 452 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  25.77 
 
 		 457 aa  80.5  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2255  general substrate transporter  29.24 
 
 		 446 aa  79  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000684239  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0050  major facilitator transporter  34.86 
 
 		 484 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0049  major facilitator family transporter  24.56 
 
 		 443 aa  77.4  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3234  general substrate transporter  25.07 
 
 		 445 aa  77  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  27.33 
 
 		 455 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1576  major facilitator superfamily MFS_1  34.56 
 
 		 483 aa  77.4  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00049  predicted transporter  24.56 
 
 		 443 aa  76.6  0.0000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3610  major facilitator transporter  24.56 
 
 		 443 aa  76.6  0.0000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0100231 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3554  major facilitator superfamily MFS_1  24.56 
 
 		 443 aa  76.6  0.0000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0047  major facilitator family transporter  24.56 
 
 		 443 aa  76.6  0.0000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.454742 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0051  major facilitator family transporter  24.56 
 
 		 443 aa  76.6  0.0000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00048  hypothetical protein  24.56 
 
 		 443 aa  76.6  0.0000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2681  general substrate transporter  26.2 
 
 		 438 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.31051 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0049  major facilitator family transporter  24.56 
 
 		 443 aa  76.6  0.0000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  27.33 
 
 		 455 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1937  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  32.19 
 
 		 474 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000973666  normal  0.0403058 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0395  major facilitator superfamily MFS_1  35.59 
 
 		 472 aa  75.5  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.90687 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08810  arabinose efflux permease family protein  29.18 
 
 		 494 aa  73.6  0.000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  26.03 
 
 		 480 aa  73.2  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4810  MFS superfamily transporter permease  31.89 
 
 		 514 aa  73.2  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.98055 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02616  predicted transporter  29.6 
 
 		 445 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0917  major facilitator superfamily MFS_1  29.6 
 
 		 469 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0941  major facilitator transporter  29.6 
 
 		 445 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3073  major facilitator family transporter  29.6 
 
 		 445 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.392352  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02579  hypothetical protein  29.6 
 
 		 445 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3102  major facilitator family transporter  29.6 
 
 		 445 aa  72  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000189575  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9266  major facilitator transporter  29.5 
 
 		 479 aa  72  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.248133 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5143  major facilitator superfamily MFS_1  28.93 
 
 		 495 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2911  major facilitator family transporter  29.6 
 
 		 445 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2518  major facilitator transporter  27.21 
 
 		 437 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2900  major facilitator family transporter  27.93 
 
 		 445 aa  70.9  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2467  major facilitator transporter  26.4 
 
 		 453 aa  70.9  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0987  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  27.03 
 
 		 461 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496425 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  28.32 
 
 		 456 aa  70.9  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1326  major facilitator transporter  27.44 
 
 		 464 aa  70.9  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.367254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04490  sugar phosphate permease  29.3 
 
 		 469 aa  70.5  0.00000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2711  major facilitator transporter  29.18 
 
 		 480 aa  70.5  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0257064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2085  major facilitator superfamily transporter  32.73 
 
 		 501 aa  70.5  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00714059  normal  0.900579 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3027  major facilitator transporter  30.21 
 
 		 481 aa  70.9  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  25.49 
 
 		 451 aa  70.5  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  26.1 
 
 		 462 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  25.7 
 
 		 492 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2715  major facilitator transporter  32.59 
 
 		 491 aa  70.1  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4244  major facilitator transporter  27.23 
 
 		 467 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3612  major facilitator transporter  35.68 
 
 		 476 aa  69.7  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.384434  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0313  major facilitator superfamily MFS_1  26.59 
 
 		 489 aa  68.9  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0974  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  31.78 
 
 		 462 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000109951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6268  major facilitator transporter  25.44 
 
 		 462 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.492492 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1408  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 484 aa  68.9  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0000966462  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  29.18 
 
 		 451 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1543  major facilitator transporter  28.62 
 
 		 382 aa  68.6  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0259552 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1829  General substrate transporter  27.97 
 
 		 480 aa  68.6  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.392144  normal  0.18053 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4276  major facilitator transporter  28.75 
 
 		 492 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4643  major facilitator superfamily MFS_1  28.75 
 
 		 492 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0856  major facilitator superfamily protein  27.18 
 
 		 483 aa  68.2  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0609243 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1026  major facilitator transporter  32.4 
 
 		 494 aa  68.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.76492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2028  major facilitator superfamily permease  26.46 
 
 		 428 aa  67.8  0.0000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7236  major facilitator superfamily MFS_1  31.67 
 
 		 484 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.440846  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  31.08 
 
 		 438 aa  67.4  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  27.23 
 
 		 460 aa  67  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0245  putative permease  29.38 
 
 		 449 aa  67  0.0000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0461827  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2549  major facilitator superfamily MFS_1  30.84 
 
 		 495 aa  67  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0190  major facilitator superfamily MFS_1  27.54 
 
 		 460 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000521499 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5172  major facilitator superfamily MFS_1  32.08 
 
 		 466 aa  67  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  26.89 
 
 		 478 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5496  major facilitator transporter  30.33 
 
 		 490 aa  66.6  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0379  major facilitator family transporter  26.89 
 
 		 478 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  26.89 
 
 		 478 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  26.89 
 
 		 478 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4845  major facilitator transporter  28.74 
 
 		 457 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1931  major facilitator superfamily permease  26.89 
 
 		 478 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0979116  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1841  major facilitator family transporter  26.89 
 
 		 478 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  26.65 
 
 		 474 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  31.17 
 
 		 468 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0085  putative metabolite transport protein YaaU  24.92 
 
 		 468 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0088  putative metabolite transport protein YaaU  24.92 
 
 		 468 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0085  putative metabolite transport protein YaaU  24.92 
 
 		 468 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>