More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2435 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2435  chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 391 aa  781    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003896  methyl-accepting chemotaxis protein  33.44 
 
 		 545 aa  156  7e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000288698  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0713  methyl-accepting chemotaxis protein  34.12 
 
 		 473 aa  155  8e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3200  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.49 
 
 		 554 aa  154  4e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0870  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.48 
 
 		 554 aa  153  4e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0571565  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3617  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.48 
 
 		 554 aa  152  7e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.964358 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4404  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.21 
 
 		 638 aa  152  8e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0156105 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0987  methyl-accepting chemotaxis protein  31.23 
 
 		 554 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3494  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.22 
 
 		 554 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3299  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.99 
 
 		 554 aa  151  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0763  methyl-accepting chemotaxis protein  38.24 
 
 		 661 aa  151  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.96 
 
 		 554 aa  151  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3827  methyl-accepting chemotaxis transducer  31.67 
 
 		 695 aa  151  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221184 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3422  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.22 
 
 		 554 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05136  torS; sensor protein TorS  37.82 
 
 		 558 aa  150  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3052  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.73 
 
 		 554 aa  149  6e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.15 
 
 		 554 aa  149  7e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.927661 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2607  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.69 
 
 		 541 aa  149  8e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00122932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55960  chemotactic transducer PctC  33.68 
 
 		 632 aa  149  8e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.289325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3856  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.48 
 
 		 640 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.825575 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02418  hypothetical protein  31.84 
 
 		 578 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.91 
 
 		 568 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1324  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  33.86 
 
 		 523 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.587106  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0081  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.24 
 
 		 544 aa  148  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.74 
 
 		 554 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3601  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  33.43 
 
 		 554 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001261  methyl-accepting chemotaxis protein  36.65 
 
 		 547 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4057  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.55 
 
 		 537 aa  147  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3666  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.43 
 
 		 554 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0641  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.43 
 
 		 568 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1023  methyl-accepting chemotaxis protein  30.56 
 
 		 578 aa  147  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0824  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.73 
 
 		 554 aa  147  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00067966 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001073  N-acetylglucosamine regulated methyl-accepting chemotaxis protein  33.44 
 
 		 628 aa  147  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0099  chemotaxis sensory transducer  29.64 
 
 		 639 aa  146  5e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000152719  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1701  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.32 
 
 		 650 aa  146  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.076135 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2783  methyl-accepting chemotaxisprotein  34.74 
 
 		 690 aa  146  6e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.468562 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.68 
 
 		 499 aa  146  7.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0811848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2822  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.97 
 
 		 673 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.428629 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1798  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  32.66 
 
 		 681 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0712  chemotaxis sensory transducer  36.92 
 
 		 541 aa  145  9e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000566108  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1713  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.46 
 
 		 666 aa  145  9e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000425798  normal  0.0665929 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4022  chemotaxis sensory transducer  33.13 
 
 		 493 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.92 
 
 		 554 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0630  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.92 
 
 		 554 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3491  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.92 
 
 		 554 aa  145  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2880  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.74 
 
 		 558 aa  145  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3925  methyl-accepting chemotaxis protein  29.69 
 
 		 674 aa  145  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.903723  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2174  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.95 
 
 		 544 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00506259 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2952  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.86 
 
 		 541 aa  144  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000751538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  32.04 
 
 		 713 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0712  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.88 
 
 		 624 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0908  methyl-accepting chemotaxis protein  31.55 
 
 		 633 aa  144  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000172893  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.76 
 
 		 564 aa  144  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3098  methyl-accepting chemotaxis protein  31.42 
 
 		 642 aa  144  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398555  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3605  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.65 
 
 		 666 aa  144  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.644417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05936  hypothetical protein  32.18 
 
 		 480 aa  144  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56000  chemotactic transducer PctA  32.86 
 
 		 629 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0512673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3576  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.09 
 
 		 772 aa  144  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0207298 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.37 
 
 		 631 aa  143  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4876  chemotactic transducer PctA  32.86 
 
 		 629 aa  144  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.647167  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56010  chemotactic transducer PctB  30.75 
 
 		 629 aa  143  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.02 
 
 		 541 aa  143  6e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4877  chemotactic transducer PctB  30.75 
 
 		 629 aa  143  6e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164155  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.3 
 
 		 572 aa  143  7e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000202  methyl-accepting chemotaxis protein  35.93 
 
 		 476 aa  142  8e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3680  methyl-accepting chemotaxis protein  32.32 
 
 		 676 aa  142  8e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1439  methyl-accepting chemotaxis protein  30.11 
 
 		 641 aa  142  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.336763  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.64 
 
 		 570 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443347 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1022  methyl-accepting chemotaxis protein  31.86 
 
 		 628 aa  142  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.771007  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4874  chemotactic transducer PctC  32.65 
 
 		 632 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.153332  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2826  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.49 
 
 		 579 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0277282 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2601  chemotaxis sensory transducer  33.82 
 
 		 569 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.441915  normal  0.36116 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0671  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.67 
 
 		 531 aa  141  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.178659  hitchhiker  0.000000219808 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04784  histidine kinase  33.01 
 
 		 628 aa  141  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3169  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.89 
 
 		 620 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1626  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.49 
 
 		 579 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.154062  normal  0.0682347 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2733  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.96 
 
 		 579 aa  141  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2750  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.49 
 
 		 579 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.23 
 
 		 548 aa  140  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0767  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.44 
 
 		 546 aa  140  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5811  putative chemotaxis transducer  35.87 
 
 		 647 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.9 
 
 		 636 aa  140  3e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.98 
 
 		 638 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.884167  hitchhiker  0.000462611 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0837  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.66 
 
 		 554 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0085  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.39 
 
 		 638 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0647334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4196  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.85 
 
 		 552 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.14959  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.37 
 
 		 630 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.174985 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1752  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.58 
 
 		 492 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000224536 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.89 
 
 		 495 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000865197  normal  0.384283 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3116  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.06 
 
 		 495 aa  139  6e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00299178  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3052  methyl-accepting chemotaxis protein  36.96 
 
 		 579 aa  139  7e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4403  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.94 
 
 		 670 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.604884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2412  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.28 
 
 		 545 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.516535  hitchhiker  0.00000653474 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  30.94 
 
 		 712 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1776  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  33.43 
 
 		 543 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.363817 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2140  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.5 
 
 		 479 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01753  hypothetical protein  34.35 
 
 		 545 aa  138  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0265  methyl-accepting chemotaxis protein  35.21 
 
 		 561 aa  139  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0861  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.22 
 
 		 542 aa  138  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3044  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.58 
 
 		 688 aa  138  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>