More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0884 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0884  histidine kinase  100 
 
 		 635 aa  1297    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5634  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 		 624 aa  316  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.469623 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3388  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.38 
 
 		 648 aa  296  7e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6903  histidine kinase  31.1 
 
 		 631 aa  296  8e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.308816 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6679  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 		 658 aa  289  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3795  histidine kinase  30.65 
 
 		 610 aa  263  6.999999999999999e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0515  histidine kinase  41.32 
 
 		 299 aa  204  3e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.80747 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0942  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.87 
 
 		 845 aa  183  7e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  39.69 
 
 		 1845 aa  182  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5309  sensor histidine kinase  38.1 
 
 		 1744 aa  180  9e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0910571 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1700  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 553 aa  179  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.012241  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  40.17 
 
 		 1833 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7458  putative sensor histidine kinase with ATP-binding region  39.13 
 
 		 406 aa  173  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5692  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.49 
 
 		 733 aa  171  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.358627 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5089  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 632 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.997163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3180  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 632 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0860119  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5187  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 632 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0102074 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2886  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  36 
 
 		 640 aa  168  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5524  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.86 
 
 		 796 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.536522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2251  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 		 657 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.17 
 
 		 975 aa  164  6e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.817585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5151  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 636 aa  163  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.605559 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3050  PAS sensor protein  34.88 
 
 		 653 aa  163  8.000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3712  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 		 851 aa  162  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.327076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3869  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.9 
 
 		 616 aa  161  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3813  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.52 
 
 		 963 aa  161  4e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000539796  normal  0.0501343 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1544  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 		 779 aa  161  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0480666  normal  0.142992 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 		 666 aa  160  5e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5522  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.61 
 
 		 875 aa  160  8e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.982375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0581  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.77 
 
 		 748 aa  160  9e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.401859  normal  0.981088 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5242  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  36.84 
 
 		 1682 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0843  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.69 
 
 		 713 aa  159  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  36.48 
 
 		 1836 aa  158  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1544  ATP-binding region ATPase domain protein  35.47 
 
 		 1710 aa  158  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5152  ATPase domain-containing protein  36.49 
 
 		 1682 aa  158  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6854  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.02 
 
 		 886 aa  157  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  38.96 
 
 		 1822 aa  157  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5550  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.55 
 
 		 803 aa  156  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0835247 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1577  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.58 
 
 		 515 aa  156  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.441834  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0230  ATPase domain-containing protein  34.52 
 
 		 1685 aa  156  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59916  normal  0.455487 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3399  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 		 680 aa  156  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2138  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 		 351 aa  155  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6856  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 		 1000 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 		 739 aa  155  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.500892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5710  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 515 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.29 
 
 		 978 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149383  normal  0.186346 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3840  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.7 
 
 		 759 aa  154  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385478  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1552  histidine kinase  36.11 
 
 		 382 aa  152  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1464  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 		 745 aa  152  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  37.4 
 
 		 1837 aa  151  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  36.36 
 
 		 1712 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2316  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.78 
 
 		 471 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09680  putative two-component sensor  36.55 
 
 		 758 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0280017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4619  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.97 
 
 		 729 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0902  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.35 
 
 		 763 aa  148  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1947  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 		 369 aa  148  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4100  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 		 484 aa  146  9e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1084  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 		 495 aa  146  9e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0399  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 		 519 aa  145  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5089  sensor histidine kinase  33.75 
 
 		 355 aa  144  5e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0644  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.53 
 
 		 487 aa  144  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4771  histidine kinase  38.55 
 
 		 624 aa  144  7e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.15318  normal  0.415438 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1907  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.3 
 
 		 494 aa  144  7e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2789  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 		 503 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.237879  normal  0.0648346 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3512  histidine kinase  36.07 
 
 		 357 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2976  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.46 
 
 		 692 aa  143  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.4081 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5501  two component sensor kinase  33.61 
 
 		 356 aa  141  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.927814  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2458  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36.17 
 
 		 484 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3892  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 		 512 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6170  multi-sensor signal transduction multi-kinase  33.71 
 
 		 1748 aa  141  3.9999999999999997e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00708  nodulation protein  35.42 
 
 		 358 aa  140  7e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.011676  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0179  histidine kinase  24.55 
 
 		 758 aa  140  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2223  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 		 457 aa  139  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.450879  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0183  protein kinase  33.48 
 
 		 1697 aa  139  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1697  histidine kinase  32.63 
 
 		 317 aa  139  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000828952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5294  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 		 500 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.814589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1557  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.45 
 
 		 773 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.468664  hitchhiker  0.00480077 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0922  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 727 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5549  sensor histidine kinase  32.4 
 
 		 355 aa  137  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2042  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 		 379 aa  137  5e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.419009  hitchhiker  0.00181161 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0214  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 427 aa  137  5e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.328681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2355  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 		 902 aa  137  5e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.415333  normal  0.408426 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3235  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 		 498 aa  137  5e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0631  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 		 501 aa  137  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.22133  normal  0.283314 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2812  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 		 495 aa  137  6.0000000000000005e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4627  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 		 461 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4562  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.54 
 
 		 591 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1847  histidine kinase  25.14 
 
 		 785 aa  135  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 		 661 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1343  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.19 
 
 		 510 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1744  histidine kinase  34.57 
 
 		 630 aa  135  3e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.267344 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2684  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 		 790 aa  135  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.181239 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1269  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 839 aa  135  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.834147 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6110  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 		 513 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.89 
 
 		 398 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.827775  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3507  PAS sensor protein  34.5 
 
 		 512 aa  134  5e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3814  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 		 515 aa  134  5e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  32.82 
 
 		 1685 aa  134  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  33.84 
 
 		 1685 aa  134  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2347  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 		 471 aa  134  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.265676  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>