More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2684 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2684  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 790 aa  1612    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.181239 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2752  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  98.73 
 
 		 790 aa  1588    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.296957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3242  phosphoglycerate transport regulator  41.05 
 
 		 787 aa  591  1e-167  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.7219 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0643  putative phosphoglycerate transport regulatory protein PgtB  35.2 
 
 		 789 aa  448  1.0000000000000001e-124  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.787041  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1436  histidine kinase  37.12 
 
 		 617 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0478  histidine kinase  38.06 
 
 		 616 aa  171  6e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.936007 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2755  phosphoglycerate transport system sensor protein PgtB  39.3 
 
 		 668 aa  170  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2626  phosphoglycerate transport system sensor protein PgtB  39.3 
 
 		 668 aa  170  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.339586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2537  phosphoglycerate transport system sensor protein PgtB  39.3 
 
 		 668 aa  169  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2586  phosphoglycerate transport system sensor protein PgtB  38.91 
 
 		 668 aa  168  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0953396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2650  phosphoglycerate transport system sensor protein PgtB  38.91 
 
 		 668 aa  168  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000328963 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0131  histidine kinase  35.69 
 
 		 630 aa  165  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399979  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5668  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 		 623 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1248  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 		 628 aa  164  8.000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5341  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 		 634 aa  161  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4049  histidine kinase  36.26 
 
 		 630 aa  161  4e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431231  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3025  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 		 634 aa  161  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 		 672 aa  161  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.622547  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0193  histidine kinase  35.97 
 
 		 670 aa  160  6e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0541233 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4927  histidine kinase  34.31 
 
 		 627 aa  160  9e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3454  histidine kinase  30.28 
 
 		 623 aa  158  4e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5904  two-component sensor  34.83 
 
 		 599 aa  158  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2682  histidine kinase  34.83 
 
 		 635 aa  157  5.0000000000000005e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.249281 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3170  histidine kinase  36.9 
 
 		 597 aa  156  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111612  normal  0.304086 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0184  histidine kinase  35.07 
 
 		 604 aa  155  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.981711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0307  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.95 
 
 		 627 aa  155  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.876198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1815  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 		 583 aa  155  2.9999999999999998e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.308963 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4049  putative two-component sensor  36.21 
 
 		 618 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5220  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 		 631 aa  154  8e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.747879 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46980  putative two-component sensor  36.21 
 
 		 633 aa  153  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0066179  normal  0.0520947 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2668  histidine kinase  39.85 
 
 		 638 aa  152  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5398  sensor histidine kinase  35.42 
 
 		 602 aa  152  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4691  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 		 638 aa  152  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.203801 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68230  two-component sensor  33.71 
 
 		 612 aa  152  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0604681 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0331  C4-dicarboxylate transport sensor kinase transcription regulator protein  34.3 
 
 		 665 aa  151  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5294  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 500 aa  151  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.814589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1259  ATPase domain-containing protein  34.2 
 
 		 626 aa  151  4e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.27586 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 		 683 aa  150  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0276  sensor histidine kinase  35.21 
 
 		 659 aa  150  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1420  histidine kinase  34.2 
 
 		 621 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.990056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3994  sensor histidine kinase  35.21 
 
 		 585 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0892776 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1515  C4-dicarboxylate transport sensor protein  35.96 
 
 		 597 aa  149  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0225348  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3389  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 		 627 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 		 606 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.381822 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03690  C4-dicarboxylate sensory histidine protein kinase, two component; DctB2  35.13 
 
 		 603 aa  149  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.571137  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6110  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.74 
 
 		 513 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1209  histidine kinase  33.84 
 
 		 621 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1003  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 		 630 aa  148  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.941233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0288  histidine kinase  35.56 
 
 		 604 aa  148  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1775  histidine kinase  34.33 
 
 		 615 aa  148  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.520686  normal  0.0542298 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0368  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.72 
 
 		 620 aa  148  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2979  histidine kinase  31.65 
 
 		 622 aa  147  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0797138 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3461  histidine kinase  36.53 
 
 		 600 aa  147  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4937  sensor histidine kinase  35.19 
 
 		 604 aa  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0519  histidine kinase  35.03 
 
 		 666 aa  145  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.69 
 
 		 635 aa  144  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.119976 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4409  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.69 
 
 		 585 aa  145  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0008  C4-dicarboxylate transport sensor kinase transcription regulator protein  32.57 
 
 		 634 aa  144  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.368078  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3901  histidine kinase  33.69 
 
 		 615 aa  144  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.896437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4321  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.69 
 
 		 585 aa  144  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3060  ATPase domain-containing protein  34.88 
 
 		 625 aa  144  8e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457203  normal  0.839364 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2969  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 		 634 aa  144  8e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.163827 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1731  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 		 621 aa  144  9e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.144225  normal  0.746753 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3259  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 		 622 aa  143  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.157895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6227  two component sensor kinase for C4-dicarboxylate transport  32.03 
 
 		 600 aa  143  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.970393  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1043  histidine kinase  35.89 
 
 		 585 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1402  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.69 
 
 		 585 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1510  C4-dicarboxylate transport sensor protein dctB  31.8 
 
 		 322 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.220294  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4293  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 		 604 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.536405 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0229  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.42 
 
 		 668 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.930854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1230  Signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system  31.8 
 
 		 310 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0439907  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2718  histidine kinase  32.5 
 
 		 623 aa  142  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4539  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 		 637 aa  142  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0810573  normal  0.164353 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4196  histidine kinase  33.1 
 
 		 666 aa  142  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.531315 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 		 602 aa  141  3.9999999999999997e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4562  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 		 591 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4457  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  37.33 
 
 		 586 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3284  histidine kinase  34.5 
 
 		 625 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0289  histidine kinase  34.28 
 
 		 604 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0589  histidine kinase  36.86 
 
 		 590 aa  141  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0101  sensor histidine kinase  31.8 
 
 		 643 aa  141  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000798435  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1572  C4-dicarboxylate transport sensor protein  31.8 
 
 		 643 aa  141  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000397989  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0082  C4-dicarboxylate transport sensor kinase  31.8 
 
 		 643 aa  141  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4946  histidine kinase  34.28 
 
 		 604 aa  140  6e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000919995 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0264  sensor histidine kinase  35.42 
 
 		 604 aa  140  7e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0204811 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 		 604 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2116  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 		 524 aa  140  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4175  sensor histidine kinase  34.08 
 
 		 643 aa  139  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4177  histidine kinase  31.64 
 
 		 620 aa  139  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.661658  normal  0.571454 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6214  histidine kinase  33.45 
 
 		 669 aa  139  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3274  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 		 526 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2258  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 		 669 aa  139  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2872  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 		 669 aa  139  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13678  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1745  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 		 501 aa  138  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216394  normal  0.830414 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2883  histidine kinase  33.45 
 
 		 669 aa  138  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  32.92 
 
 		 1837 aa  138  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18010  C4-dicarboylate transport sensory histidine protein kinase, two-component; DctB  34.71 
 
 		 592 aa  138  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892386  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72740  putative two-component sensor  36.55 
 
 		 588 aa  138  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.658354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6314  putative two-component sensor  36.55 
 
 		 586 aa  138  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2927  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 672 aa  138  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>