More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3795 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009620  Smed_3795  histidine kinase  100 
 
 
610 aa  1229    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5634  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 
624 aa  335  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.469623 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6903  histidine kinase  34.75 
 
 
631 aa  310  5e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.308816 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6679  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 
658 aa  298  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3388  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 
648 aa  280  7e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0884  histidine kinase  31.11 
 
 
635 aa  260  6e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0515  histidine kinase  46.82 
 
 
299 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.80747 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0942  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.5 
 
 
845 aa  187  7e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5692  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.57 
 
 
733 aa  177  5e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.358627 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5089  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 
632 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.997163  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3180  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 
632 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0860119  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5187  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 
632 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0102074 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1464  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.68 
 
 
745 aa  172  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0516  putative two-component sensor kinase  36.04 
 
 
328 aa  171  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.6 
 
 
666 aa  165  3e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4619  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.83 
 
 
729 aa  157  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7458  putative sensor histidine kinase with ATP-binding region  35.04 
 
 
406 aa  156  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  36.07 
 
 
1845 aa  154  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1947  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 
369 aa  153  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  36.6 
 
 
1833 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0581  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 
748 aa  149  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.401859  normal  0.981088 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3840  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.43 
 
 
759 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385478  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2886  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 
640 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  38.14 
 
 
1822 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3869  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.3 
 
 
616 aa  148  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0644  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41 
 
 
487 aa  145  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5549  sensor histidine kinase  33.07 
 
 
355 aa  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5309  sensor histidine kinase  36.48 
 
 
1744 aa  145  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0910571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3712  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.71 
 
 
851 aa  145  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.327076  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1205  histidine kinase  36.1 
 
 
548 aa  145  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1700  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 
553 aa  145  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.012241  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2458  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 
484 aa  145  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3892  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.1 
 
 
512 aa  145  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2316  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.8 
 
 
471 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5151  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 
636 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.605559 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1744  histidine kinase  38.39 
 
 
630 aa  142  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.267344 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1697  histidine kinase  40.74 
 
 
317 aa  142  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000828952  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  36 
 
 
1837 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6856  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 
1000 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0843  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
713 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1552  histidine kinase  36.36 
 
 
382 aa  141  3.9999999999999997e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1544  ATP-binding region ATPase domain protein  32.8 
 
 
1710 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1084  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 
495 aa  140  4.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5550  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.39 
 
 
803 aa  140  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0835247 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3813  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.15 
 
 
963 aa  140  7.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000539796  normal  0.0501343 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2379  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 
538 aa  139  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2251  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 
657 aa  140  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0631  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 
501 aa  139  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.22133  normal  0.283314 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5089  sensor histidine kinase  34.19 
 
 
355 aa  138  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5501  two component sensor kinase  33.61 
 
 
356 aa  137  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.927814  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.03 
 
 
975 aa  137  5e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.817585  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2138  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.72 
 
 
351 aa  137  8e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00708  nodulation protein  34.69 
 
 
358 aa  136  9e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.011676  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1124  histidine kinase  33.93 
 
 
483 aa  136  9e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.7316  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5294  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 
500 aa  136  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.814589  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 
739 aa  136  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.500892  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2042  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 
379 aa  136  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.419009  hitchhiker  0.00181161 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2398  ATP-binding region ATPase domain protein  32.2 
 
 
1712 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.623096  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0230  ATPase domain-containing protein  34.65 
 
 
1685 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.59916  normal  0.455487 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1269  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 
839 aa  135  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.834147 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6110  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 
513 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5152  ATPase domain-containing protein  37.02 
 
 
1682 aa  134  5e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198047  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4100  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 
484 aa  134  5e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3512  histidine kinase  32.41 
 
 
357 aa  134  6e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5242  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  37.02 
 
 
1682 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59114  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1907  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
494 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3399  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 
680 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0399  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 
519 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0922  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 
727 aa  131  5.0000000000000004e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4281  histidine kinase  36.4 
 
 
514 aa  130  5.0000000000000004e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6496  ATPase domain-containing protein  33.6 
 
 
1685 aa  130  6e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53789  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1557  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.31 
 
 
773 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.468664  hitchhiker  0.00480077 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1577  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 
515 aa  130  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.441834  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5524  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 
796 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.536522  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2490  sensor histidine kinase  33.46 
 
 
600 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159667  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5710  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 
515 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  33.2 
 
 
1685 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2969  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 
634 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.163827 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2355  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 
902 aa  128  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.415333  normal  0.408426 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2116  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 
524 aa  128  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3152  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 
473 aa  128  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285761  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2535  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.9 
 
 
472 aa  127  5e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.816658  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2789  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 
503 aa  127  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.237879  normal  0.0648346 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2976  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.17 
 
 
692 aa  127  8.000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.4081 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3814  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 
515 aa  127  8.000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4627  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 
461 aa  126  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3507  PAS sensor protein  32.65 
 
 
512 aa  126  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 
398 aa  126  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.827775  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0041  sensor histidine kinase  32.19 
 
 
356 aa  125  2e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.708956  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0267  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 
631 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.172451  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6170  multi-sensor signal transduction multi-kinase  32.67 
 
 
1748 aa  125  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1343  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 
510 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2223  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 
457 aa  125  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.450879  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2790  histidine kinase  37.29 
 
 
499 aa  125  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.12989  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0213  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.72 
 
 
635 aa  125  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5190  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 
1211 aa  125  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.8862  normal  0.202649 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2347  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.8 
 
 
471 aa  124  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.265676  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3274  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 
526 aa  124  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  31.85 
 
 
1836 aa  124  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6501  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 
470 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.442786  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>