More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6903 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_6903  histidine kinase  100 
 
 
631 aa  1274    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.308816 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5634  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  63.59 
 
 
624 aa  767    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.469623 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3388  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.57 
 
 
648 aa  317  4e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3795  histidine kinase  34.75 
 
 
610 aa  307  4.0000000000000004e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6679  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 
658 aa  302  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0884  histidine kinase  31.1 
 
 
635 aa  287  5e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0942  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.44 
 
 
845 aa  184  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0581  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 
748 aa  182  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.401859  normal  0.981088 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  40.93 
 
 
1845 aa  163  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0515  histidine kinase  38.11 
 
 
299 aa  160  5e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.80747 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3869  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.65 
 
 
616 aa  159  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5309  sensor histidine kinase  35.59 
 
 
1744 aa  158  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0910571 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3399  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.98 
 
 
680 aa  154  5e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1700  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 
553 aa  153  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.012241  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0516  putative two-component sensor kinase  34.66 
 
 
328 aa  153  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2138  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.52 
 
 
351 aa  151  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3193  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 
902 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0583373  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3512  histidine kinase  38.04 
 
 
357 aa  149  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0922  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 
727 aa  148  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1620  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 
842 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.252508  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 
739 aa  146  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.500892  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0179  histidine kinase  24.03 
 
 
758 aa  146  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1552  histidine kinase  37.61 
 
 
382 aa  146  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2251  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  39.02 
 
 
657 aa  145  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1948  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 
858 aa  145  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.355681  normal  0.0222076 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1084  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.89 
 
 
495 aa  144  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.18 
 
 
666 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1544  ATP-binding region ATPase domain protein  33.46 
 
 
1710 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3712  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 
851 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.327076  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1745  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.26 
 
 
501 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216394  normal  0.830414 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1598  two-component transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  33.52 
 
 
857 aa  142  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.701828  normal  0.909939 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4726  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 
508 aa  142  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1847  histidine kinase  26.41 
 
 
785 aa  141  3.9999999999999997e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0631  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 
501 aa  140  7e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.22133  normal  0.283314 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5710  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  39.48 
 
 
515 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5151  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.16 
 
 
636 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.605559 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4619  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
729 aa  139  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1302  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 
871 aa  138  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.465043  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  35.39 
 
 
1833 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5501  two component sensor kinase  39.47 
 
 
356 aa  137  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.927814  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0644  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.65 
 
 
487 aa  137  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5089  sensor histidine kinase  37.78 
 
 
355 aa  137  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1364  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 
510 aa  137  5e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5294  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.15 
 
 
500 aa  137  7.000000000000001e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.814589  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1413  ATPase domain-containing protein  34.72 
 
 
603 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1195  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 
870 aa  137  9e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.98844  normal  0.84656 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3107  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.74 
 
 
799 aa  136  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.765319  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1269  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.77 
 
 
839 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.834147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1425  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 
603 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.524026  normal  0.827969 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5692  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 
733 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.358627 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2316  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 
471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1577  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 
515 aa  135  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.441834  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2459  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 
514 aa  135  3e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.536831 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1360  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 
603 aa  135  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1443  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 
607 aa  135  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0172  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 
565 aa  135  3e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00708  nodulation protein  35.5 
 
 
358 aa  135  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.011676  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  36.69 
 
 
1836 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1343  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.77 
 
 
510 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1907  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 
494 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3840  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.78 
 
 
759 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385478  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4100  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.77 
 
 
484 aa  134  6.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4627  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 
461 aa  133  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2789  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.48 
 
 
503 aa  133  9e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.237879  normal  0.0648346 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2458  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 
484 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  38.04 
 
 
1837 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5550  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 
803 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0835247 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3180  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 
632 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0860119  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5187  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 
632 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0102074 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0714  C4-dicarboxylate transport sensor protein ATPase subunit  33.6 
 
 
594 aa  133  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5089  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 
632 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.997163  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2355  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.4 
 
 
902 aa  132  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.415333  normal  0.408426 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5549  sensor histidine kinase  34.81 
 
 
355 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1029  Signal transduction histidine kinase  37.18 
 
 
511 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2886  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  36.61 
 
 
640 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7458  putative sensor histidine kinase with ATP-binding region  35.06 
 
 
406 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1826  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.6 
 
 
630 aa  131  3e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0888009 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1697  histidine kinase  36.71 
 
 
317 aa  132  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000828952  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
978 aa  132  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149383  normal  0.186346 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2718  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 
598 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09680  putative two-component sensor  35.74 
 
 
758 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0280017  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2503  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 
603 aa  131  5.0000000000000004e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1989  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 
566 aa  130  6e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 
630 aa  130  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.449456  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0843  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.12 
 
 
713 aa  130  6e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2976  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 
692 aa  130  6e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.4081 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3814  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.8 
 
 
515 aa  130  7.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2952  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 
598 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.078149 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1549  histidine kinase  33.96 
 
 
598 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.924403  normal  0.563022 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2809  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 
598 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 
598 aa  130  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6856  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 
1000 aa  130  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5524  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 
796 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.536522  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3507  PAS sensor protein  38.8 
 
 
512 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2223  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 
457 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.450879  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2584  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 
654 aa  130  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0399  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.87 
 
 
519 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2042  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.17 
 
 
379 aa  129  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.419009  hitchhiker  0.00181161 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 
398 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.827775  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4052  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 
513 aa  128  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>