More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1464 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1464  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
745 aa  1503    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5692  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 
733 aa  191  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.358627 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.73 
 
 
666 aa  189  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2886  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 
640 aa  188  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2251  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 
657 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3712  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.85 
 
 
851 aa  185  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.327076  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3869  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.79 
 
 
616 aa  184  6e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3840  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 
759 aa  182  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.385478  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0581  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 
748 aa  181  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.401859  normal  0.981088 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5550  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 
803 aa  180  7e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0835247 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5151  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.54 
 
 
636 aa  177  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.300471  normal  0.605559 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5089  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.98 
 
 
632 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.997163  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3180  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.98 
 
 
632 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0860119  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5187  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.98 
 
 
632 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0102074 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  38.92 
 
 
1822 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6856  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
1000 aa  173  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3795  histidine kinase  38.68 
 
 
610 aa  173  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0843  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 
713 aa  173  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4619  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 
729 aa  172  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  40.94 
 
 
1845 aa  170  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1544  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 
779 aa  169  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0480666  normal  0.142992 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 
975 aa  169  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.817585  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1907  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.23 
 
 
494 aa  169  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5710  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  39.67 
 
 
515 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2355  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.28 
 
 
902 aa  168  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.415333  normal  0.408426 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  38.93 
 
 
1833 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0942  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.32 
 
 
845 aa  167  8e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5190  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.25 
 
 
1211 aa  165  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.8862  normal  0.202649 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 
1211 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125854  normal  0.0422439 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  40.08 
 
 
1837 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7458  putative sensor histidine kinase with ATP-binding region  38.24 
 
 
406 aa  160  7e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5524  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 
796 aa  160  9e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.536522  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0631  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.01 
 
 
501 aa  159  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.22133  normal  0.283314 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1029  Signal transduction histidine kinase  36.6 
 
 
511 aa  157  6e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5549  sensor histidine kinase  38.2 
 
 
355 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4726  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.69 
 
 
508 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6854  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.75 
 
 
886 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2458  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 
484 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4052  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.92 
 
 
513 aa  154  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2789  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.22 
 
 
503 aa  155  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.237879  normal  0.0648346 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5089  sensor histidine kinase  38.2 
 
 
355 aa  154  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5294  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 
500 aa  154  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.814589  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1343  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.69 
 
 
510 aa  154  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1364  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 
510 aa  154  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6110  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.89 
 
 
513 aa  154  8e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1745  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 
501 aa  153  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216394  normal  0.830414 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0267  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.3 
 
 
631 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.172451  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2316  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.77 
 
 
471 aa  151  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1084  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 
495 aa  151  5e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0884  histidine kinase  37.44 
 
 
635 aa  150  8e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3892  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.19 
 
 
512 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3107  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 
799 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.765319  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6679  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.2 
 
 
658 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5522  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.39 
 
 
875 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.982375  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2097  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.45 
 
 
398 aa  148  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.827775  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0515  histidine kinase  41.82 
 
 
299 aa  148  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.80747 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3813  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.47 
 
 
963 aa  148  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000539796  normal  0.0501343 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2116  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.55 
 
 
524 aa  148  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 
739 aa  147  7.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.500892  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2379  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
538 aa  147  9e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0399  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.03 
 
 
519 aa  147  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.56 
 
 
721 aa  145  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.814379  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2138  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.73 
 
 
351 aa  145  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  33.88 
 
 
1836 aa  145  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1269  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 
839 aa  144  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.834147 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5309  sensor histidine kinase  35.8 
 
 
1744 aa  144  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0910571 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3814  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.41 
 
 
515 aa  143  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2537  two-component hybrid sensor and regulator  36.07 
 
 
225 aa  143  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.246857 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1577  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.9 
 
 
515 aa  143  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.441834  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 
978 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149383  normal  0.186346 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3388  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.17 
 
 
648 aa  143  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2995  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.9 
 
 
662 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1744  histidine kinase  38.89 
 
 
630 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.267344 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2042  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 
379 aa  142  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.419009  hitchhiker  0.00181161 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0213  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.47 
 
 
635 aa  142  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3507  PAS sensor protein  37.04 
 
 
512 aa  142  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0041  sensor histidine kinase  35.98 
 
 
356 aa  141  3.9999999999999997e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.708956  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1557  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 
773 aa  141  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.468664  hitchhiker  0.00480077 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2223  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.35 
 
 
457 aa  141  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.450879  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1517  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 
632 aa  140  6e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4635  histidine kinase  34.73 
 
 
440 aa  140  7e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.94647  normal  0.951565 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0183  protein kinase  34.13 
 
 
1697 aa  140  7e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1826  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 
630 aa  140  7.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0888009 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5152  ATPase domain-containing protein  35.66 
 
 
1682 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198047  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2459  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
514 aa  140  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.536831 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5184  histidine kinase  37.25 
 
 
435 aa  139  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1947  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 
369 aa  139  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1598  two-component transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  36.33 
 
 
857 aa  139  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.701828  normal  0.909939 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0644  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.76 
 
 
487 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5444  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 
838 aa  139  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372664  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3193  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 
902 aa  138  4e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0583373  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1544  ATP-binding region ATPase domain protein  32.94 
 
 
1710 aa  138  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3274  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.03 
 
 
526 aa  138  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2592  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 
838 aa  137  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.625327  hitchhiker  0.00109138 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1700  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 
553 aa  137  5e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.012241  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1540  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  36.22 
 
 
841 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.21204 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1132  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 
838 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0594373  normal  0.673452 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2138  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 
838 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2747  sensory box histidine kinase  34.78 
 
 
879 aa  137  8e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5939  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 
838 aa  137  8e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.24433  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>