More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_25300 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_25300  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  100 
 
 		 378 aa  725    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0364  type II secretion system protein E  53.72 
 
 		 387 aa  315  7e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000591318  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0477  type II secretion system protein E  57.59 
 
 		 396 aa  288  1e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0012388  normal  0.0255206 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35920  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  54.3 
 
 		 395 aa  286  2.9999999999999996e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5870  type II secretion system protein E  49.84 
 
 		 387 aa  285  1.0000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000410078  normal  0.124998 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0214  type II secretion system protein E  53.43 
 
 		 415 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0052  type II secretion system protein E  50.86 
 
 		 492 aa  282  8.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.309192  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5328  type II secretion system protein E  53.3 
 
 		 383 aa  279  5e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.192507 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25820  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  50 
 
 		 419 aa  279  5e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3161  type II secretion system protein E  48.69 
 
 		 432 aa  278  1e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.062169 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1384  type II secretion system protein E  49.45 
 
 		 389 aa  276  6e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192887  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0518  type II secretion system protein E  48.27 
 
 		 389 aa  275  9e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0480  type II secretion system protein E  50.83 
 
 		 437 aa  274  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5192  type II secretion system protein E  47.86 
 
 		 388 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0123395  hitchhiker  0.0000832543 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0276  type II secretion system protein E  48.9 
 
 		 372 aa  271  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0128  pilus assembly protein CpaF  53.04 
 
 		 398 aa  270  2e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2224  type II secretion system protein E  46.11 
 
 		 386 aa  270  2.9999999999999997e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.492299 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4805  type II secretion system protein E  47.86 
 
 		 388 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.390977  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4891  type II secretion system protein E  47.86 
 
 		 388 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.665011  normal  0.0830382 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4838  type II secretion system protein E  52.6 
 
 		 400 aa  268  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4421  type II secretion system protein E  51.81 
 
 		 401 aa  265  8e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193692  normal  0.0190954 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0729  type II secretion system protein E  48.73 
 
 		 390 aa  264  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4039  type II secretion system protein E  51.81 
 
 		 401 aa  264  2e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5421  type II secretion system protein E  48.17 
 
 		 398 aa  262  8e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4117 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3908  type II secretion system protein E  51.17 
 
 		 393 aa  259  5.0000000000000005e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13689  hypothetical protein  49.28 
 
 		 352 aa  258  1e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.89789e-18  normal  0.0993973 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33360  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  45.6 
 
 		 396 aa  256  5e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.111015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3372  type II secretion system protein E  48.4 
 
 		 433 aa  255  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0619  type II secretion system protein E  52.87 
 
 		 412 aa  253  3e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0318  type II secretion system protein E  52.3 
 
 		 514 aa  251  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0476276  normal  0.440624 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1982  type II secretion system protein E  47.47 
 
 		 393 aa  251  1e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2777  type II secretion system protein E  53.8 
 
 		 405 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0724904  hitchhiker  0.0000140927 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0592  type II secretion system protein E  53.9 
 
 		 379 aa  242  1e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4297  type II secretion system protein E  48.43 
 
 		 422 aa  235  9e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0512015  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18190  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  47.57 
 
 		 441 aa  233  4.0000000000000004e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.654314  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  40.77 
 
 		 467 aa  226  4e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  36.54 
 
 		 463 aa  224  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2323  type II secretion system protein E  39.75 
 
 		 449 aa  224  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.935094 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  42.01 
 
 		 444 aa  224  2e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  41.98 
 
 		 441 aa  223  4e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  37.17 
 
 		 477 aa  222  9e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  41.55 
 
 		 442 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  38.56 
 
 		 438 aa  222  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  37.89 
 
 		 472 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  37.65 
 
 		 476 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  37.06 
 
 		 480 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  40.83 
 
 		 491 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  39.53 
 
 		 442 aa  220  3.9999999999999997e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  34.19 
 
 		 485 aa  219  5e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  40.48 
 
 		 491 aa  219  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  36.74 
 
 		 482 aa  219  5e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1085  secretion ATPase protein  38.3 
 
 		 450 aa  219  7.999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  36.42 
 
 		 482 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  40.25 
 
 		 454 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  41.49 
 
 		 445 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  36.05 
 
 		 483 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  36.42 
 
 		 485 aa  218  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  33.33 
 
 		 500 aa  218  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  36.47 
 
 		 452 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  35.94 
 
 		 482 aa  217  2.9999999999999998e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  38.44 
 
 		 491 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4190  type II secretion system protein E  33.6 
 
 		 504 aa  216  4e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3422  type II secretion system protein E  44.06 
 
 		 468 aa  216  4e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.351074  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  37.07 
 
 		 488 aa  216  5e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  35.78 
 
 		 482 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2160  type II secretion system protein E  38.14 
 
 		 438 aa  216  7e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0397447  normal  0.0352451 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  35.46 
 
 		 467 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  37.74 
 
 		 449 aa  215  9.999999999999999e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4360  type II secretion system protein E  37.69 
 
 		 451 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  38.52 
 
 		 521 aa  214  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  35.65 
 
 		 482 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4250  type II secretion system protein E  37.69 
 
 		 451 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2925  type II secretion system protein E  43.36 
 
 		 471 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120672  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  39.94 
 
 		 445 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  35.99 
 
 		 484 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  36.86 
 
 		 498 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  35.33 
 
 		 433 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  37.38 
 
 		 440 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0537  type II secretion system protein E  40.58 
 
 		 440 aa  212  7.999999999999999e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  39.34 
 
 		 474 aa  212  7.999999999999999e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  40.41 
 
 		 624 aa  212  7.999999999999999e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  35.78 
 
 		 490 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  40.83 
 
 		 463 aa  212  7.999999999999999e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  37.06 
 
 		 473 aa  212  7.999999999999999e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4663  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  39.1 
 
 		 447 aa  212  9e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0858858  decreased coverage  0.000709192 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  34.25 
 
 		 462 aa  212  9e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  35.62 
 
 		 464 aa  211  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0726  type II secretion system protein E  32.56 
 
 		 492 aa  212  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50497  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  39.32 
 
 		 440 aa  212  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  33.88 
 
 		 455 aa  211  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  36.68 
 
 		 454 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0298  type II secretion system protein E  35.67 
 
 		 488 aa  210  3e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  35.67 
 
 		 489 aa  210  3e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1499  type II secretion system protein E  38.78 
 
 		 450 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000031609 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1043  type II secretion system protein E  38.78 
 
 		 450 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.994378  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  33.88 
 
 		 455 aa  210  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1523  type II secretion system protein E  38.78 
 
 		 450 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.68059  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2639  type II secretion system protein E  42.91 
 
 		 491 aa  210  3e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  39.8 
 
 		 453 aa  210  4e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2933  type II secretion system protein E  39.24 
 
 		 495 aa  210  4e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.242377  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>