More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_25820 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_25820  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  100 
 
 		 419 aa  787    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0364  type II secretion system protein E  52.94 
 
 		 387 aa  324  2e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000591318  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5328  type II secretion system protein E  52.65 
 
 		 383 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.192507 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0477  type II secretion system protein E  59.44 
 
 		 396 aa  300  5e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0012388  normal  0.0255206 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3161  type II secretion system protein E  47.64 
 
 		 432 aa  295  8e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.062169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5870  type II secretion system protein E  51.56 
 
 		 387 aa  295  9e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000410078  normal  0.124998 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1384  type II secretion system protein E  50.68 
 
 		 389 aa  288  1e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192887  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3372  type II secretion system protein E  48.79 
 
 		 433 aa  287  2e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35920  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  50.84 
 
 		 395 aa  285  1.0000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2224  type II secretion system protein E  47.22 
 
 		 386 aa  284  2.0000000000000002e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.492299 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25300  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  50 
 
 		 378 aa  282  8.000000000000001e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0214  type II secretion system protein E  52.82 
 
 		 415 aa  279  7e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0318  type II secretion system protein E  56.25 
 
 		 514 aa  277  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0476276  normal  0.440624 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5192  type II secretion system protein E  51.18 
 
 		 388 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0123395  hitchhiker  0.0000832543 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0480  type II secretion system protein E  49.87 
 
 		 437 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0276  type II secretion system protein E  52.32 
 
 		 372 aa  275  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4805  type II secretion system protein E  50.89 
 
 		 388 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.390977  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4891  type II secretion system protein E  50.89 
 
 		 388 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.665011  normal  0.0830382 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13689  hypothetical protein  51.34 
 
 		 352 aa  272  8.000000000000001e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.89789e-18  normal  0.0993973 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0128  pilus assembly protein CpaF  49.21 
 
 		 398 aa  270  2e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0518  type II secretion system protein E  47.88 
 
 		 389 aa  269  5.9999999999999995e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0729  type II secretion system protein E  52.41 
 
 		 390 aa  268  1e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18190  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  50.15 
 
 		 441 aa  268  2e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.654314  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5421  type II secretion system protein E  50.43 
 
 		 398 aa  267  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4117 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33360  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  49.61 
 
 		 396 aa  266  4e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.111015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4838  type II secretion system protein E  53.87 
 
 		 400 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0619  type II secretion system protein E  52.1 
 
 		 412 aa  263  6e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2777  type II secretion system protein E  53.28 
 
 		 405 aa  260  3e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0724904  hitchhiker  0.0000140927 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4421  type II secretion system protein E  53.78 
 
 		 401 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193692  normal  0.0190954 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3908  type II secretion system protein E  50 
 
 		 393 aa  258  2e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4039  type II secretion system protein E  53.49 
 
 		 401 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0592  type II secretion system protein E  50.86 
 
 		 379 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0052  type II secretion system protein E  45.28 
 
 		 492 aa  244  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.309192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4297  type II secretion system protein E  50.79 
 
 		 422 aa  243  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0512015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  42.9 
 
 		 464 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  43.34 
 
 		 624 aa  229  5e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1982  type II secretion system protein E  48.05 
 
 		 393 aa  229  5e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3422  type II secretion system protein E  44.31 
 
 		 468 aa  226  6e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.351074  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  40 
 
 		 479 aa  226  8e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  37.73 
 
 		 569 aa  225  1e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  39.21 
 
 		 441 aa  224  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  43.77 
 
 		 468 aa  224  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  43.25 
 
 		 634 aa  223  4e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0120  type II/IV secretion system protein  47.12 
 
 		 358 aa  222  8e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  40.06 
 
 		 459 aa  222  9e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  43.18 
 
 		 445 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  44.41 
 
 		 449 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  39.2 
 
 		 572 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  38.24 
 
 		 467 aa  220  5e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  40.26 
 
 		 440 aa  219  6e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  40.67 
 
 		 453 aa  219  7e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  39.67 
 
 		 472 aa  219  1e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  41.61 
 
 		 456 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  41.58 
 
 		 444 aa  218  1e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  39.24 
 
 		 454 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0324  type II secretion system protein E  54.04 
 
 		 383 aa  217  2.9999999999999998e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.20864  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  39.35 
 
 		 482 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  43.56 
 
 		 452 aa  217  4e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0537  type II secretion system protein E  43.89 
 
 		 440 aa  216  5e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  38.17 
 
 		 484 aa  216  7e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  38.04 
 
 		 442 aa  216  7e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  39.03 
 
 		 433 aa  216  8e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  37.85 
 
 		 467 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  38.49 
 
 		 490 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  40.34 
 
 		 472 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  33.64 
 
 		 442 aa  215  9.999999999999999e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  41 
 
 		 462 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  36.02 
 
 		 589 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2354  type II secretion system protein E  41.22 
 
 		 452 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  43.73 
 
 		 450 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  37.73 
 
 		 438 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  36.99 
 
 		 508 aa  214  1.9999999999999998e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  38.82 
 
 		 455 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  41.18 
 
 		 594 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2363  type II/IV secretion system protein  42.39 
 
 		 560 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.158902  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  38.65 
 
 		 638 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  38.82 
 
 		 455 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0247  type II secretion system protein E  41.52 
 
 		 639 aa  214  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2796  putative type II/IV secretion ATPase protein, TadA  39.39 
 
 		 469 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178047  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  38.17 
 
 		 489 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  36.76 
 
 		 487 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  43.58 
 
 		 452 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1109  type II secretion system protein E  41.85 
 
 		 608 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.280352  normal  0.0921606 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  37.81 
 
 		 480 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0298  type II secretion system protein E  37.93 
 
 		 488 aa  213  7e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2700  type II secretion system protein E  40 
 
 		 437 aa  212  9e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1085  secretion ATPase protein  39.57 
 
 		 450 aa  212  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  38.82 
 
 		 455 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  36.94 
 
 		 477 aa  211  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  37.5 
 
 		 478 aa  211  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  39.43 
 
 		 454 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  39.07 
 
 		 491 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  39.47 
 
 		 455 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2540  type II/IV secretion system protein  39.03 
 
 		 446 aa  211  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511754  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  39.24 
 
 		 455 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  39.24 
 
 		 455 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1655  type II secretion system protein E  39.09 
 
 		 469 aa  211  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  38.51 
 
 		 455 aa  210  4e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002649  type II/IV secretion system ATP hydrolase TadA/VirB11/CpaF TadA subfamily  40.13 
 
 		 458 aa  210  4e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  42.91 
 
 		 523 aa  209  5e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>