More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0128 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0128  pilus assembly protein CpaF  100 
 
 		 398 aa  765    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5328  type II secretion system protein E  68.62 
 
 		 383 aa  429  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.192507 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0214  type II secretion system protein E  65.79 
 
 		 415 aa  418  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0480  type II secretion system protein E  65.45 
 
 		 437 aa  411  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4838  type II secretion system protein E  71.23 
 
 		 400 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0364  type II secretion system protein E  60 
 
 		 387 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000591318  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35920  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  58.01 
 
 		 395 aa  350  2e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4805  type II secretion system protein E  57.62 
 
 		 388 aa  350  2e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.390977  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4891  type II secretion system protein E  57.62 
 
 		 388 aa  350  2e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.665011  normal  0.0830382 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5192  type II secretion system protein E  57.34 
 
 		 388 aa  348  7e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0123395  hitchhiker  0.0000832543 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0518  type II secretion system protein E  53.06 
 
 		 389 aa  348  1e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1384  type II secretion system protein E  56.39 
 
 		 389 aa  343  4e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192887  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13689  hypothetical protein  57.8 
 
 		 352 aa  323  2e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.89789e-18  normal  0.0993973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5870  type II secretion system protein E  53.41 
 
 		 387 aa  322  7e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000410078  normal  0.124998 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0276  type II secretion system protein E  56.25 
 
 		 372 aa  321  1.9999999999999998e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0592  type II secretion system protein E  62.82 
 
 		 379 aa  318  1e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5421  type II secretion system protein E  56.1 
 
 		 398 aa  317  2e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4117 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0729  type II secretion system protein E  54.83 
 
 		 390 aa  316  5e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0477  type II secretion system protein E  57.27 
 
 		 396 aa  313  3.9999999999999997e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0012388  normal  0.0255206 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4421  type II secretion system protein E  57.85 
 
 		 401 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193692  normal  0.0190954 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4039  type II secretion system protein E  58.47 
 
 		 401 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3908  type II secretion system protein E  52.89 
 
 		 393 aa  303  4.0000000000000003e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4297  type II secretion system protein E  56.69 
 
 		 422 aa  296  4e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0512015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0052  type II secretion system protein E  50.41 
 
 		 492 aa  295  8e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.309192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1982  type II secretion system protein E  53.59 
 
 		 393 aa  293  4e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3161  type II secretion system protein E  50 
 
 		 432 aa  293  5e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.062169 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0318  type II secretion system protein E  56.58 
 
 		 514 aa  292  9e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0476276  normal  0.440624 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25300  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  51.52 
 
 		 378 aa  289  7e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33360  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  48.86 
 
 		 396 aa  288  2e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.111015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3372  type II secretion system protein E  49.74 
 
 		 433 aa  286  5.999999999999999e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25820  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  49.87 
 
 		 419 aa  283  4.0000000000000003e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2777  type II secretion system protein E  50.63 
 
 		 405 aa  281  1e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0724904  hitchhiker  0.0000140927 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0619  type II secretion system protein E  51.1 
 
 		 412 aa  273  3e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4190  type II secretion system protein E  40.79 
 
 		 504 aa  267  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2224  type II secretion system protein E  45.07 
 
 		 386 aa  265  1e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.492299 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  42.24 
 
 		 476 aa  263  4.999999999999999e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  44.22 
 
 		 480 aa  261  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  42.81 
 
 		 485 aa  261  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  44.22 
 
 		 433 aa  261  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  43.88 
 
 		 467 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  44.22 
 
 		 491 aa  259  7e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  44.7 
 
 		 444 aa  258  9e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  43.88 
 
 		 482 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  40.06 
 
 		 463 aa  257  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  42.18 
 
 		 483 aa  257  2e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  42.86 
 
 		 484 aa  256  4e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  41.84 
 
 		 482 aa  256  5e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  44.19 
 
 		 452 aa  256  6e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  43.54 
 
 		 491 aa  255  7e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  43.88 
 
 		 490 aa  255  7e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  41.25 
 
 		 508 aa  256  7e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  40.62 
 
 		 482 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  39.04 
 
 		 479 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  40.94 
 
 		 485 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  44.11 
 
 		 477 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  38.64 
 
 		 462 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  40.62 
 
 		 482 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  40.06 
 
 		 464 aa  254  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  43.04 
 
 		 453 aa  253  3e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  43.2 
 
 		 489 aa  253  3e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  38.12 
 
 		 460 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  41.53 
 
 		 482 aa  253  5.000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  42.52 
 
 		 500 aa  252  8.000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0726  type II secretion system protein E  43.54 
 
 		 492 aa  252  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50497  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  40.79 
 
 		 463 aa  250  2e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0298  type II secretion system protein E  41.75 
 
 		 488 aa  250  3e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  38.22 
 
 		 465 aa  250  3e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  37.57 
 
 		 454 aa  250  3e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  39.28 
 
 		 455 aa  250  3e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  42.12 
 
 		 440 aa  249  4e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  38.32 
 
 		 463 aa  250  4e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  38.72 
 
 		 459 aa  249  5e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0214  component of type IV pilus  43.2 
 
 		 492 aa  249  5e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2323  type II secretion system protein E  42.86 
 
 		 449 aa  249  5e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.935094 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  40.98 
 
 		 491 aa  249  8e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  42.86 
 
 		 488 aa  249  9e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  39 
 
 		 455 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1528  type II secretion system protein E  38.55 
 
 		 457 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  39.81 
 
 		 569 aa  248  2e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4396  type II secretion system protein E  38.87 
 
 		 481 aa  247  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2160  type II secretion system protein E  47.12 
 
 		 438 aa  247  3e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0397447  normal  0.0352451 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  38.58 
 
 		 572 aa  246  4e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  39.28 
 
 		 455 aa  246  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  39.28 
 
 		 455 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  39.28 
 
 		 455 aa  246  6e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  42.16 
 
 		 472 aa  246  6e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  41.41 
 
 		 472 aa  246  6.999999999999999e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  37.57 
 
 		 456 aa  246  6.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  41.1 
 
 		 454 aa  245  8e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  39.2 
 
 		 455 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  37.46 
 
 		 478 aa  245  9.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3512  type II secretion system protein E  38.79 
 
 		 449 aa  244  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.657436  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  41.79 
 
 		 474 aa  243  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  38.72 
 
 		 454 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  38.72 
 
 		 454 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  38.72 
 
 		 454 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  37.13 
 
 		 477 aa  243  3.9999999999999997e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  40.92 
 
 		 468 aa  243  5e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  40.13 
 
 		 589 aa  243  5e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  42.77 
 
 		 515 aa  243  6e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>