More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_33360 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_33360  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  100 
 
 		 396 aa  755    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.111015  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2777  type II secretion system protein E  61.38 
 
 		 405 aa  333  4e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0724904  hitchhiker  0.0000140927 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0619  type II secretion system protein E  63.22 
 
 		 412 aa  333  5e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5870  type II secretion system protein E  54.3 
 
 		 387 aa  323  3e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000410078  normal  0.124998 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0364  type II secretion system protein E  51.42 
 
 		 387 aa  317  3e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000591318  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2224  type II secretion system protein E  51.59 
 
 		 386 aa  315  7e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.492299 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0324  type II secretion system protein E  61.36 
 
 		 383 aa  315  9.999999999999999e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.20864  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0477  type II secretion system protein E  63.16 
 
 		 396 aa  314  1.9999999999999998e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0012388  normal  0.0255206 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3161  type II secretion system protein E  50.13 
 
 		 432 aa  306  3e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.062169 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4421  type II secretion system protein E  54.57 
 
 		 401 aa  306  5.0000000000000004e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193692  normal  0.0190954 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0729  type II secretion system protein E  50.54 
 
 		 390 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3372  type II secretion system protein E  51.28 
 
 		 433 aa  299  5e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0480  type II secretion system protein E  52.28 
 
 		 437 aa  297  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4039  type II secretion system protein E  57.91 
 
 		 401 aa  293  4e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0214  type II secretion system protein E  50.67 
 
 		 415 aa  291  2e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0518  type II secretion system protein E  45.76 
 
 		 389 aa  287  2e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3908  type II secretion system protein E  50.9 
 
 		 393 aa  287  2e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5328  type II secretion system protein E  50.89 
 
 		 383 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.192507 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4838  type II secretion system protein E  54.84 
 
 		 400 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25820  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  49.61 
 
 		 419 aa  283  5.000000000000001e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0128  pilus assembly protein CpaF  48.86 
 
 		 398 aa  279  6e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35920  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  49.34 
 
 		 395 aa  277  2e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1384  type II secretion system protein E  48.59 
 
 		 389 aa  273  3e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192887  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25300  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  45.6 
 
 		 378 aa  273  3e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0592  type II secretion system protein E  56.61 
 
 		 379 aa  272  7e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0276  type II secretion system protein E  50.27 
 
 		 372 aa  271  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0318  type II secretion system protein E  50.79 
 
 		 514 aa  268  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0476276  normal  0.440624 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5192  type II secretion system protein E  48.01 
 
 		 388 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0123395  hitchhiker  0.0000832543 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4805  type II secretion system protein E  47.75 
 
 		 388 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.390977  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4891  type II secretion system protein E  47.75 
 
 		 388 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.665011  normal  0.0830382 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5421  type II secretion system protein E  51.2 
 
 		 398 aa  259  8e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4117 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13689  hypothetical protein  48.41 
 
 		 352 aa  258  1e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.89789e-18  normal  0.0993973 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2323  type II secretion system protein E  49.13 
 
 		 449 aa  257  2e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.935094 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0052  type II secretion system protein E  47.04 
 
 		 492 aa  254  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.309192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  45.45 
 
 		 444 aa  250  3e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  40.24 
 
 		 442 aa  249  5e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  45.12 
 
 		 523 aa  249  6e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  45.12 
 
 		 521 aa  249  7e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  45.12 
 
 		 520 aa  249  7e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  45.12 
 
 		 520 aa  249  7e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  45.12 
 
 		 520 aa  249  7e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4297  type II secretion system protein E  51.4 
 
 		 422 aa  248  9e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0512015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  46.62 
 
 		 523 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  45.06 
 
 		 515 aa  247  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1982  type II secretion system protein E  47.63 
 
 		 393 aa  247  2e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  43.92 
 
 		 472 aa  246  3e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  46.5 
 
 		 472 aa  247  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  46.5 
 
 		 472 aa  246  6e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  40.84 
 
 		 463 aa  245  9.999999999999999e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  39.23 
 
 		 465 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18190  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  48.6 
 
 		 441 aa  243  3.9999999999999997e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.654314  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  40.84 
 
 		 463 aa  242  9e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002649  type II/IV secretion system ATP hydrolase TadA/VirB11/CpaF TadA subfamily  42.86 
 
 		 458 aa  241  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  45.74 
 
 		 438 aa  241  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  42.07 
 
 		 428 aa  240  2.9999999999999997e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  42.66 
 
 		 442 aa  240  4e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  42.77 
 
 		 454 aa  240  4e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  44.44 
 
 		 440 aa  239  5e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  44.88 
 
 		 474 aa  239  5e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  41.61 
 
 		 441 aa  239  9e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  38.15 
 
 		 453 aa  238  1e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  39.48 
 
 		 445 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  44 
 
 		 634 aa  237  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1659  type II secretion system protein E  44.37 
 
 		 408 aa  236  4e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  44.9 
 
 		 440 aa  236  4e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  41.58 
 
 		 463 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  41.25 
 
 		 468 aa  236  7e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3422  type II secretion system protein E  46.85 
 
 		 468 aa  235  8e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.351074  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0537  type II secretion system protein E  43.44 
 
 		 440 aa  235  1.0000000000000001e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  37.9 
 
 		 462 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  38.74 
 
 		 455 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  42.39 
 
 		 454 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  42.16 
 
 		 455 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  42.39 
 
 		 454 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  41.83 
 
 		 455 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  39.07 
 
 		 449 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  42.39 
 
 		 454 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  44.52 
 
 		 438 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4360  type II secretion system protein E  42.42 
 
 		 451 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4250  type II secretion system protein E  42.42 
 
 		 451 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2160  type II secretion system protein E  45.95 
 
 		 438 aa  233  3e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0397447  normal  0.0352451 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  44.44 
 
 		 624 aa  234  3e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1085  secretion ATPase protein  43.1 
 
 		 450 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2692  type II secretion system protein E  42.31 
 
 		 462 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  39.93 
 
 		 487 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  44.6 
 
 		 466 aa  232  7.000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  44.68 
 
 		 455 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  44.68 
 
 		 455 aa  232  9e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  43.14 
 
 		 638 aa  232  9e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  44.68 
 
 		 455 aa  232  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  44.25 
 
 		 467 aa  231  1e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  37.37 
 
 		 460 aa  232  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2639  type II secretion system protein E  44.12 
 
 		 491 aa  232  1e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0247  type II secretion system protein E  43.26 
 
 		 639 aa  231  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  46.15 
 
 		 455 aa  231  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  41.18 
 
 		 449 aa  231  2e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1640  type II secretion system protein E  40.63 
 
 		 417 aa  231  2e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.75229  normal  0.33759 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  40.79 
 
 		 464 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1655  type II secretion system protein E  45.04 
 
 		 469 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  42.21 
 
 		 478 aa  231  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>