More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5421 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5421  type II secretion system protein E  100 
 
 		 398 aa  768    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4117 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1384  type II secretion system protein E  87.2 
 
 		 389 aa  537  1e-151  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192887  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4805  type II secretion system protein E  81.68 
 
 		 388 aa  498  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.390977  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4891  type II secretion system protein E  81.68 
 
 		 388 aa  498  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.665011  normal  0.0830382 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5192  type II secretion system protein E  81.08 
 
 		 388 aa  494  1e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0123395  hitchhiker  0.0000832543 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13689  hypothetical protein  79.87 
 
 		 352 aa  432  1e-120  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.89789e-18  normal  0.0993973 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0276  type II secretion system protein E  67.86 
 
 		 372 aa  412  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0518  type II secretion system protein E  64.41 
 
 		 389 aa  411  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35920  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  65.77 
 
 		 395 aa  397  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3908  type II secretion system protein E  68.15 
 
 		 393 aa  394  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0729  type II secretion system protein E  61.45 
 
 		 390 aa  361  1e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0364  type II secretion system protein E  58.84 
 
 		 387 aa  333  2e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000591318  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0480  type II secretion system protein E  59.21 
 
 		 437 aa  320  3e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0592  type II secretion system protein E  61.9 
 
 		 379 aa  318  1e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0214  type II secretion system protein E  59.09 
 
 		 415 aa  312  6.999999999999999e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5870  type II secretion system protein E  53.75 
 
 		 387 aa  310  2.9999999999999997e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000410078  normal  0.124998 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5328  type II secretion system protein E  56.89 
 
 		 383 aa  306  3e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.192507 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4838  type II secretion system protein E  60.24 
 
 		 400 aa  286  5e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0128  pilus assembly protein CpaF  56.1 
 
 		 398 aa  286  5.999999999999999e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4297  type II secretion system protein E  60.96 
 
 		 422 aa  285  8e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0512015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4421  type II secretion system protein E  56.46 
 
 		 401 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193692  normal  0.0190954 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4039  type II secretion system protein E  55.56 
 
 		 401 aa  276  5e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0318  type II secretion system protein E  60.15 
 
 		 514 aa  274  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0476276  normal  0.440624 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0052  type II secretion system protein E  52.38 
 
 		 492 aa  272  8.000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.309192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25820  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  50.43 
 
 		 419 aa  264  2e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0477  type II secretion system protein E  57.35 
 
 		 396 aa  262  6e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0012388  normal  0.0255206 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3161  type II secretion system protein E  48.33 
 
 		 432 aa  262  6.999999999999999e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.062169 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25300  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  48.17 
 
 		 378 aa  258  1e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3372  type II secretion system protein E  47.41 
 
 		 433 aa  251  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2777  type II secretion system protein E  52.96 
 
 		 405 aa  250  3e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0724904  hitchhiker  0.0000140927 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1982  type II secretion system protein E  50.57 
 
 		 393 aa  248  2e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  43.84 
 
 		 468 aa  244  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  39.71 
 
 		 444 aa  238  1e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33360  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  51.2 
 
 		 396 aa  238  1e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.111015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  38.99 
 
 		 484 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  42.44 
 
 		 624 aa  238  2e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  42.25 
 
 		 441 aa  237  3e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  38.99 
 
 		 433 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  39.76 
 
 		 482 aa  236  6e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  39.82 
 
 		 485 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  39.16 
 
 		 467 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  39.52 
 
 		 490 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  43.51 
 
 		 482 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2363  type II/IV secretion system protein  46.04 
 
 		 560 aa  233  3e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.158902  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18190  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  52.58 
 
 		 441 aa  233  4.0000000000000004e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.654314  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2224  type II secretion system protein E  44.65 
 
 		 386 aa  233  4.0000000000000004e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.492299 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  39.22 
 
 		 482 aa  233  5e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0298  type II secretion system protein E  38.39 
 
 		 488 aa  232  7.000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  40.58 
 
 		 485 aa  232  8.000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2796  putative type II/IV secretion ATPase protein, TadA  42.16 
 
 		 469 aa  232  9e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178047  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2323  type II secretion system protein E  39.88 
 
 		 449 aa  232  9e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.935094 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  45.09 
 
 		 450 aa  232  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  38.69 
 
 		 489 aa  232  1e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1655  type II secretion system protein E  41.83 
 
 		 469 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  38.51 
 
 		 453 aa  230  3e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  40.55 
 
 		 449 aa  230  3e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  43.45 
 
 		 452 aa  230  3e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  41.33 
 
 		 463 aa  230  3e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  39.8 
 
 		 463 aa  230  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  42.21 
 
 		 454 aa  230  4e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  41.11 
 
 		 472 aa  230  4e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  41.78 
 
 		 462 aa  230  4e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2692  type II secretion system protein E  38.58 
 
 		 462 aa  229  6e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  44.73 
 
 		 452 aa  229  7e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  36.91 
 
 		 442 aa  229  8e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  41.82 
 
 		 500 aa  229  8e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  38.32 
 
 		 482 aa  228  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  41.4 
 
 		 480 aa  228  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  41.4 
 
 		 483 aa  227  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  42.25 
 
 		 455 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0214  component of type IV pilus  40.73 
 
 		 492 aa  227  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  39.4 
 
 		 456 aa  227  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1528  type II secretion system protein E  40.38 
 
 		 457 aa  228  2e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  41.1 
 
 		 460 aa  227  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  39.7 
 
 		 459 aa  227  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1640  type II secretion system protein E  41.97 
 
 		 417 aa  227  3e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.75229  normal  0.33759 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  41.16 
 
 		 445 aa  227  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  42.25 
 
 		 455 aa  227  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  39.73 
 
 		 572 aa  226  4e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3422  type II secretion system protein E  43.26 
 
 		 468 aa  226  6e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.351074  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  40.43 
 
 		 508 aa  226  7e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  42.81 
 
 		 472 aa  226  7e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  41.09 
 
 		 491 aa  225  8e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  40.79 
 
 		 454 aa  225  9e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1659  type II secretion system protein E  43.45 
 
 		 408 aa  225  1e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  42.81 
 
 		 472 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1109  type II secretion system protein E  45 
 
 		 608 aa  225  1e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.280352  normal  0.0921606 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  41.52 
 
 		 455 aa  224  1e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  38.19 
 
 		 563 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  39.08 
 
 		 479 aa  224  2e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  41.85 
 
 		 638 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  37.68 
 
 		 487 aa  224  2e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  36.47 
 
 		 476 aa  224  3e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  41.53 
 
 		 634 aa  224  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  40.73 
 
 		 488 aa  224  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  42.81 
 
 		 474 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  41.67 
 
 		 455 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  40.85 
 
 		 440 aa  223  4.9999999999999996e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  41.03 
 
 		 472 aa  223  6e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  41.9 
 
 		 454 aa  223  6e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>