More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5870 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5870  type II secretion system protein E  100 
 
 		 387 aa  747    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000410078  normal  0.124998 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0364  type II secretion system protein E  56.78 
 
 		 387 aa  355  1e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000591318  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4421  type II secretion system protein E  56.57 
 
 		 401 aa  342  9e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193692  normal  0.0190954 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1384  type II secretion system protein E  53.39 
 
 		 389 aa  336  5e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192887  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4039  type II secretion system protein E  55.2 
 
 		 401 aa  333  3e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35920  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  53.55 
 
 		 395 aa  333  4e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5192  type II secretion system protein E  51.79 
 
 		 388 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0123395  hitchhiker  0.0000832543 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4805  type II secretion system protein E  50.9 
 
 		 388 aa  325  1e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.390977  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4891  type II secretion system protein E  50.9 
 
 		 388 aa  325  1e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.665011  normal  0.0830382 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0518  type II secretion system protein E  47.37 
 
 		 389 aa  321  9.999999999999999e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0276  type II secretion system protein E  53.42 
 
 		 372 aa  320  3e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0729  type II secretion system protein E  51.09 
 
 		 390 aa  319  6e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3372  type II secretion system protein E  54.2 
 
 		 433 aa  315  9.999999999999999e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13689  hypothetical protein  53.31 
 
 		 352 aa  312  5.999999999999999e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.89789e-18  normal  0.0993973 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0480  type II secretion system protein E  49.62 
 
 		 437 aa  311  9e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0214  type II secretion system protein E  55.83 
 
 		 415 aa  310  2e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3161  type II secretion system protein E  51.11 
 
 		 432 aa  311  2e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.062169 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33360  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  54.3 
 
 		 396 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.111015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5421  type II secretion system protein E  53.75 
 
 		 398 aa  309  4e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4117 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0477  type II secretion system protein E  58.68 
 
 		 396 aa  303  3.0000000000000004e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0012388  normal  0.0255206 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3908  type II secretion system protein E  50.65 
 
 		 393 aa  303  4.0000000000000003e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5328  type II secretion system protein E  54.68 
 
 		 383 aa  302  6.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.192507 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4297  type II secretion system protein E  54.2 
 
 		 422 aa  302  8.000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0512015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0128  pilus assembly protein CpaF  53.13 
 
 		 398 aa  296  3e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0592  type II secretion system protein E  54.11 
 
 		 379 aa  295  9e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4838  type II secretion system protein E  56.11 
 
 		 400 aa  293  4e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25820  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  55.52 
 
 		 419 aa  289  6e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1982  type II secretion system protein E  53.48 
 
 		 393 aa  288  8e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0318  type II secretion system protein E  57.19 
 
 		 514 aa  288  9e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0476276  normal  0.440624 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  49.83 
 
 		 444 aa  281  1e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0052  type II secretion system protein E  52.89 
 
 		 492 aa  280  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.309192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25300  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  49.84 
 
 		 378 aa  278  8e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0619  type II secretion system protein E  55.75 
 
 		 412 aa  273  3e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2777  type II secretion system protein E  55.29 
 
 		 405 aa  270  2e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0724904  hitchhiker  0.0000140927 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  42.81 
 
 		 479 aa  265  7e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  46.39 
 
 		 463 aa  265  8e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  43.62 
 
 		 428 aa  263  3e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  45.7 
 
 		 465 aa  262  8e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  45.54 
 
 		 453 aa  261  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  41.25 
 
 		 472 aa  261  1e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  41.22 
 
 		 515 aa  260  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  43.3 
 
 		 463 aa  261  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  43.9 
 
 		 455 aa  260  3e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  43.9 
 
 		 455 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  42.78 
 
 		 520 aa  259  8e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  42.78 
 
 		 523 aa  258  8e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  42.78 
 
 		 520 aa  259  8e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  42.78 
 
 		 520 aa  259  8e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  42.78 
 
 		 521 aa  258  9e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  45.7 
 
 		 455 aa  258  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2224  type II secretion system protein E  47.9 
 
 		 386 aa  258  1e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.492299 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  43.52 
 
 		 460 aa  258  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  43.66 
 
 		 523 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  47.02 
 
 		 454 aa  257  3e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  43.16 
 
 		 459 aa  256  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  43.36 
 
 		 450 aa  256  5e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  43.6 
 
 		 454 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  43.6 
 
 		 454 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  43.6 
 
 		 454 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  46.53 
 
 		 462 aa  256  7e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  44.33 
 
 		 473 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  42.76 
 
 		 476 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  46.18 
 
 		 455 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  45.79 
 
 		 455 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  45.6 
 
 		 455 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  44.69 
 
 		 452 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  42.91 
 
 		 463 aa  253  3e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002649  type II/IV secretion system ATP hydrolase TadA/VirB11/CpaF TadA subfamily  43.08 
 
 		 458 aa  253  3e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  45.6 
 
 		 455 aa  254  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  43.9 
 
 		 468 aa  253  5.000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  44.71 
 
 		 472 aa  252  6e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  43.54 
 
 		 451 aa  252  7e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  45.21 
 
 		 454 aa  252  8.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2323  type II secretion system protein E  46.76 
 
 		 449 aa  252  9.000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.935094 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  45.64 
 
 		 452 aa  251  1e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  43.2 
 
 		 432 aa  251  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  45.15 
 
 		 456 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  41.76 
 
 		 491 aa  251  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  43.18 
 
 		 464 aa  250  3e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  43.95 
 
 		 472 aa  249  4e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4190  type II secretion system protein E  40.73 
 
 		 504 aa  249  5e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  41.52 
 
 		 449 aa  249  5e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  43.95 
 
 		 472 aa  249  7e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  42.21 
 
 		 521 aa  249  8e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  43.95 
 
 		 474 aa  248  9e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0537  type II secretion system protein E  44.3 
 
 		 440 aa  248  1e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  39.53 
 
 		 478 aa  248  1e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  42.38 
 
 		 458 aa  248  1e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  42.66 
 
 		 477 aa  248  1e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0324  type II secretion system protein E  56.41 
 
 		 383 aa  248  2e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.20864  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  43.25 
 
 		 467 aa  248  2e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2639  type II secretion system protein E  43.66 
 
 		 491 aa  247  2e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  40.3 
 
 		 445 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  43.19 
 
 		 634 aa  247  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  45.83 
 
 		 438 aa  246  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1640  type II secretion system protein E  43.69 
 
 		 417 aa  246  6e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.75229  normal  0.33759 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  42.2 
 
 		 441 aa  246  6e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  42 
 
 		 498 aa  246  6.999999999999999e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  45.36 
 
 		 440 aa  245  8e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  41.92 
 
 		 478 aa  245  8e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.057514 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>