More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1384 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1384  type II secretion system protein E  100 
 
 		 389 aa  739    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192887  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5192  type II secretion system protein E  77.98 
 
 		 388 aa  547  1e-154  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0123395  hitchhiker  0.0000832543 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4805  type II secretion system protein E  76.94 
 
 		 388 aa  541  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.390977  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4891  type II secretion system protein E  76.94 
 
 		 388 aa  541  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.665011  normal  0.0830382 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5421  type II secretion system protein E  87.69 
 
 		 398 aa  538  9.999999999999999e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4117 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13689  hypothetical protein  75.78 
 
 		 352 aa  474  1e-132  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.89789e-18  normal  0.0993973 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0276  type II secretion system protein E  68.01 
 
 		 372 aa  445  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0518  type II secretion system protein E  65.22 
 
 		 389 aa  447  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3908  type II secretion system protein E  66.49 
 
 		 393 aa  437  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35920  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  63.82 
 
 		 395 aa  432  1e-120  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0729  type II secretion system protein E  61.94 
 
 		 390 aa  364  2e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0364  type II secretion system protein E  58.29 
 
 		 387 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000591318  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0592  type II secretion system protein E  59.22 
 
 		 379 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5328  type II secretion system protein E  58.17 
 
 		 383 aa  335  7e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.192507 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5870  type II secretion system protein E  53.39 
 
 		 387 aa  335  1e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000410078  normal  0.124998 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0480  type II secretion system protein E  59.12 
 
 		 437 aa  332  9e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0214  type II secretion system protein E  59.78 
 
 		 415 aa  324  2e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0128  pilus assembly protein CpaF  56.39 
 
 		 398 aa  311  1e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4421  type II secretion system protein E  55.99 
 
 		 401 aa  311  1e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193692  normal  0.0190954 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4838  type II secretion system protein E  59.89 
 
 		 400 aa  311  1e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0052  type II secretion system protein E  53.59 
 
 		 492 aa  305  7e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.309192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4297  type II secretion system protein E  59.29 
 
 		 422 aa  302  6.000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0512015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0318  type II secretion system protein E  57.06 
 
 		 514 aa  291  2e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0476276  normal  0.440624 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4039  type II secretion system protein E  54.03 
 
 		 401 aa  290  3e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25820  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  50.68 
 
 		 419 aa  285  7e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3161  type II secretion system protein E  48.1 
 
 		 432 aa  277  3e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.062169 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0477  type II secretion system protein E  56.3 
 
 		 396 aa  273  4.0000000000000004e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0012388  normal  0.0255206 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25300  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  49.45 
 
 		 378 aa  272  6e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1982  type II secretion system protein E  49.74 
 
 		 393 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2224  type II secretion system protein E  46.9 
 
 		 386 aa  266  5.999999999999999e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.492299 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3372  type II secretion system protein E  48.3 
 
 		 433 aa  265  1e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2777  type II secretion system protein E  54.62 
 
 		 405 aa  263  3e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0724904  hitchhiker  0.0000140927 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33360  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  48.59 
 
 		 396 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.111015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  42.72 
 
 		 482 aa  250  3e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  42.72 
 
 		 482 aa  250  4e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  42.72 
 
 		 485 aa  249  5e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  40.12 
 
 		 472 aa  249  8e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  39.53 
 
 		 445 aa  248  9e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  41.77 
 
 		 433 aa  248  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  40.59 
 
 		 482 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  42.16 
 
 		 500 aa  248  1e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  42.29 
 
 		 450 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  41.77 
 
 		 484 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  42.11 
 
 		 485 aa  247  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0298  type II secretion system protein E  40.37 
 
 		 488 aa  247  3e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1528  type II secretion system protein E  39.37 
 
 		 457 aa  247  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  39.12 
 
 		 508 aa  247  3e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  39.77 
 
 		 468 aa  247  3e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  40.69 
 
 		 449 aa  247  3e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  40.59 
 
 		 480 aa  246  4e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  39.95 
 
 		 624 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  42 
 
 		 452 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  41.46 
 
 		 467 aa  245  9e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  41.9 
 
 		 444 aa  245  9.999999999999999e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  42.09 
 
 		 490 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  41.46 
 
 		 489 aa  245  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  40.37 
 
 		 483 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  40.24 
 
 		 476 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  38.12 
 
 		 453 aa  243  5e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  41.18 
 
 		 488 aa  243  5e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  41.46 
 
 		 482 aa  243  5e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  40.85 
 
 		 491 aa  242  9e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  38.59 
 
 		 455 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2796  putative type II/IV secretion ATPase protein, TadA  42.86 
 
 		 469 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178047  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  37.04 
 
 		 479 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2363  type II/IV secretion system protein  42.23 
 
 		 560 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.158902  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  41.67 
 
 		 441 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  39.64 
 
 		 477 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18190  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  51.82 
 
 		 441 aa  240  2.9999999999999997e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.654314  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1655  type II secretion system protein E  42.54 
 
 		 469 aa  240  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  38.39 
 
 		 472 aa  239  5e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1659  type II secretion system protein E  40.94 
 
 		 408 aa  239  5e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  38.32 
 
 		 455 aa  239  5e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  41.39 
 
 		 452 aa  239  9e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  38.4 
 
 		 454 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2323  type II secretion system protein E  40.06 
 
 		 449 aa  238  1e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.935094 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  38.32 
 
 		 459 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  40.2 
 
 		 491 aa  238  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  43.09 
 
 		 521 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  42.81 
 
 		 515 aa  238  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  37.01 
 
 		 467 aa  238  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  43.09 
 
 		 520 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  44.17 
 
 		 445 aa  237  2e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  42.22 
 
 		 438 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  36.96 
 
 		 462 aa  238  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  43.09 
 
 		 520 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  43.09 
 
 		 520 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  43.09 
 
 		 523 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1640  type II secretion system protein E  41.43 
 
 		 417 aa  237  3e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.75229  normal  0.33759 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  43.09 
 
 		 523 aa  237  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  38.83 
 
 		 463 aa  237  3e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  39.87 
 
 		 442 aa  237  3e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  39.47 
 
 		 454 aa  236  4e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0619  type II secretion system protein E  51.89 
 
 		 412 aa  236  6e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2639  type II secretion system protein E  43.71 
 
 		 491 aa  236  7e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  38.1 
 
 		 455 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4190  type II secretion system protein E  40.85 
 
 		 504 aa  235  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  37.6 
 
 		 456 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3422  type II secretion system protein E  46.43 
 
 		 468 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.351074  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  39.13 
 
 		 491 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>