More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0480 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0480  type II secretion system protein E  100 
 
 		 437 aa  828    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0214  type II secretion system protein E  74.62 
 
 		 415 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4838  type II secretion system protein E  73.67 
 
 		 400 aa  436  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0364  type II secretion system protein E  63.9 
 
 		 387 aa  414  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000591318  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0128  pilus assembly protein CpaF  65.45 
 
 		 398 aa  403  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5328  type II secretion system protein E  66.2 
 
 		 383 aa  395  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.192507 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4805  type II secretion system protein E  59.35 
 
 		 388 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.390977  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4891  type II secretion system protein E  59.35 
 
 		 388 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.665011  normal  0.0830382 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5192  type II secretion system protein E  59.24 
 
 		 388 aa  365  1e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0123395  hitchhiker  0.0000832543 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0518  type II secretion system protein E  55.4 
 
 		 389 aa  361  2e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0729  type II secretion system protein E  59.72 
 
 		 390 aa  360  3e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35920  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  57.22 
 
 		 395 aa  357  1.9999999999999998e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1384  type II secretion system protein E  59.12 
 
 		 389 aa  351  1e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192887  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0276  type II secretion system protein E  59.42 
 
 		 372 aa  340  2.9999999999999998e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5421  type II secretion system protein E  59.21 
 
 		 398 aa  340  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4117 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13689  hypothetical protein  60.55 
 
 		 352 aa  340  4e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.89789e-18  normal  0.0993973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5870  type II secretion system protein E  49.62 
 
 		 387 aa  334  2e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000410078  normal  0.124998 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0477  type II secretion system protein E  61.85 
 
 		 396 aa  327  2.0000000000000001e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0012388  normal  0.0255206 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0592  type II secretion system protein E  62.75 
 
 		 379 aa  325  1e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3908  type II secretion system protein E  55.68 
 
 		 393 aa  323  5e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4421  type II secretion system protein E  59.43 
 
 		 401 aa  322  9.999999999999999e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193692  normal  0.0190954 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4297  type II secretion system protein E  63.4 
 
 		 422 aa  316  6e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0512015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4039  type II secretion system protein E  57.26 
 
 		 401 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3161  type II secretion system protein E  51.73 
 
 		 432 aa  311  2e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.062169 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0318  type II secretion system protein E  59.54 
 
 		 514 aa  306  5.0000000000000004e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0476276  normal  0.440624 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1982  type II secretion system protein E  56.58 
 
 		 393 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0052  type II secretion system protein E  52.82 
 
 		 492 aa  302  7.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.309192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33360  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  52.28 
 
 		 396 aa  298  1e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.111015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3372  type II secretion system protein E  52.6 
 
 		 433 aa  298  1e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25300  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  50.83 
 
 		 378 aa  292  9e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25820  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  49.87 
 
 		 419 aa  289  6e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2777  type II secretion system protein E  56.94 
 
 		 405 aa  289  8e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0724904  hitchhiker  0.0000140927 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  42.7 
 
 		 472 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  42.42 
 
 		 472 aa  279  6e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  41.38 
 
 		 474 aa  276  7e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  44.78 
 
 		 523 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  44.78 
 
 		 515 aa  268  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  44.78 
 
 		 521 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  44.78 
 
 		 520 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  44.78 
 
 		 520 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  44.78 
 
 		 520 aa  268  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  44.78 
 
 		 523 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18190  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  51.59 
 
 		 441 aa  267  2.9999999999999995e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.654314  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0619  type II secretion system protein E  50.27 
 
 		 412 aa  267  4e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  39.61 
 
 		 463 aa  266  7e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  41.74 
 
 		 455 aa  264  2e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  40.96 
 
 		 444 aa  265  2e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  42.59 
 
 		 463 aa  260  3e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  38.65 
 
 		 498 aa  260  3e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  38.87 
 
 		 432 aa  259  6e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  37.57 
 
 		 467 aa  259  7e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  38.87 
 
 		 442 aa  258  1e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  38.4 
 
 		 476 aa  258  1e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  40 
 
 		 500 aa  258  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  40.3 
 
 		 634 aa  258  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  37.26 
 
 		 521 aa  256  5e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4396  type II secretion system protein E  40 
 
 		 481 aa  256  6e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  43.62 
 
 		 472 aa  256  7e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  41.89 
 
 		 491 aa  256  7e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  42.18 
 
 		 458 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  43.19 
 
 		 482 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  39.02 
 
 		 456 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2323  type II secretion system protein E  45.05 
 
 		 449 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.935094 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2692  type II secretion system protein E  39.21 
 
 		 462 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  43.1 
 
 		 467 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  38.64 
 
 		 464 aa  254  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  40.17 
 
 		 478 aa  253  4.0000000000000004e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  39.42 
 
 		 480 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2567  type II secretion system protein E  38.95 
 
 		 469 aa  253  5.000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.368822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  40.99 
 
 		 468 aa  253  6e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  39.6 
 
 		 485 aa  252  7e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3422  type II secretion system protein E  47.65 
 
 		 468 aa  252  7e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.351074  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  42.76 
 
 		 484 aa  253  7e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  42.9 
 
 		 624 aa  252  8.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  43.69 
 
 		 445 aa  252  8.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  38.78 
 
 		 453 aa  252  9.000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  38.12 
 
 		 477 aa  252  9.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  37.43 
 
 		 441 aa  252  1e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  39.65 
 
 		 459 aa  252  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  37.9 
 
 		 451 aa  251  1e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  43.43 
 
 		 490 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  39.52 
 
 		 454 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  34.98 
 
 		 482 aa  252  1e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  41.96 
 
 		 460 aa  251  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  42.76 
 
 		 433 aa  251  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0247  type II secretion system protein E  40.35 
 
 		 639 aa  252  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  36.83 
 
 		 488 aa  251  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  37.73 
 
 		 454 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2349  type II secretion system protein E  39.88 
 
 		 485 aa  251  2e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.413673 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  40.24 
 
 		 440 aa  251  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1640  type II secretion system protein E  41.64 
 
 		 417 aa  250  3e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.75229  normal  0.33759 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  41.23 
 
 		 563 aa  250  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  43.67 
 
 		 440 aa  250  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  40.66 
 
 		 462 aa  250  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0554  type II secretion system protein E  44.13 
 
 		 485 aa  250  4e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0302  type II secretion system protein E  44.13 
 
 		 484 aa  249  6e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  41.01 
 
 		 463 aa  249  7e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  37.25 
 
 		 508 aa  249  8e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0298  type II secretion system protein E  41.53 
 
 		 488 aa  249  9e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  39.09 
 
 		 638 aa  249  9e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>