More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2777 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2777  type II secretion system protein E  100 
 
 		 405 aa  751    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0724904  hitchhiker  0.0000140927 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33360  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  61.38 
 
 		 396 aa  350  2e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.111015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0364  type II secretion system protein E  55.96 
 
 		 387 aa  338  9.999999999999999e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000591318  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0477  type II secretion system protein E  64.62 
 
 		 396 aa  312  6.999999999999999e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0012388  normal  0.0255206 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0276  type II secretion system protein E  57.23 
 
 		 372 aa  311  1e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2224  type II secretion system protein E  48.75 
 
 		 386 aa  305  1.0000000000000001e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.492299 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0480  type II secretion system protein E  56.94 
 
 		 437 aa  304  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0619  type II secretion system protein E  61.54 
 
 		 412 aa  301  2e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5870  type II secretion system protein E  55.29 
 
 		 387 aa  299  7e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000410078  normal  0.124998 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0214  type II secretion system protein E  51.4 
 
 		 415 aa  298  8e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1384  type II secretion system protein E  54.62 
 
 		 389 aa  297  2e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192887  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25820  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  53.28 
 
 		 419 aa  296  4e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4838  type II secretion system protein E  59.83 
 
 		 400 aa  292  7e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0592  type II secretion system protein E  60.44 
 
 		 379 aa  291  2e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0729  type II secretion system protein E  53.3 
 
 		 390 aa  290  3e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3372  type II secretion system protein E  52.73 
 
 		 433 aa  290  4e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3161  type II secretion system protein E  50.69 
 
 		 432 aa  289  7e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.062169 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35920  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  53.57 
 
 		 395 aa  287  2e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0052  type II secretion system protein E  54.24 
 
 		 492 aa  288  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.309192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4421  type II secretion system protein E  56.68 
 
 		 401 aa  288  2e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193692  normal  0.0190954 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5328  type II secretion system protein E  53.74 
 
 		 383 aa  285  9e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.192507 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0318  type II secretion system protein E  55.19 
 
 		 514 aa  281  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0476276  normal  0.440624 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25300  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  53.8 
 
 		 378 aa  280  2e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0128  pilus assembly protein CpaF  51.02 
 
 		 398 aa  280  3e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5421  type II secretion system protein E  52.54 
 
 		 398 aa  280  4e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4117 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5192  type II secretion system protein E  51.71 
 
 		 388 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0123395  hitchhiker  0.0000832543 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4805  type II secretion system protein E  51.71 
 
 		 388 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.390977  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4891  type II secretion system protein E  51.71 
 
 		 388 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.665011  normal  0.0830382 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0518  type II secretion system protein E  49.12 
 
 		 389 aa  276  4e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4039  type II secretion system protein E  55.79 
 
 		 401 aa  275  8e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13689  hypothetical protein  53.61 
 
 		 352 aa  271  1e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.89789e-18  normal  0.0993973 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4297  type II secretion system protein E  55.63 
 
 		 422 aa  271  2e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0512015  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3908  type II secretion system protein E  51.5 
 
 		 393 aa  269  5e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0324  type II secretion system protein E  63.19 
 
 		 383 aa  268  1e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.20864  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18190  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  55.27 
 
 		 441 aa  266  4e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.654314  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1982  type II secretion system protein E  55.15 
 
 		 393 aa  265  1e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  42.9 
 
 		 462 aa  263  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  42.94 
 
 		 444 aa  262  6e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  45.21 
 
 		 460 aa  263  6e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  44.48 
 
 		 491 aa  262  6.999999999999999e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  43.88 
 
 		 624 aa  261  2e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  42.27 
 
 		 464 aa  260  3e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  43.56 
 
 		 453 aa  259  7e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  40.17 
 
 		 456 aa  259  7e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  43.33 
 
 		 442 aa  258  1e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  41.85 
 
 		 465 aa  257  2e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  42.91 
 
 		 487 aa  258  2e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  42.12 
 
 		 441 aa  258  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  42.12 
 
 		 468 aa  257  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  42.72 
 
 		 478 aa  257  2e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  41.98 
 
 		 477 aa  257  2e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  38.94 
 
 		 463 aa  257  3e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3422  type II secretion system protein E  47.68 
 
 		 468 aa  256  3e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.351074  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  41.98 
 
 		 442 aa  256  7e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  40.91 
 
 		 459 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  39.11 
 
 		 454 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  42.81 
 
 		 472 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1640  type II secretion system protein E  45.03 
 
 		 417 aa  253  3e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.75229  normal  0.33759 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2323  type II secretion system protein E  43.61 
 
 		 449 aa  253  5.000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.935094 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  42.12 
 
 		 467 aa  252  7e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  44.64 
 
 		 455 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  44.29 
 
 		 455 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  43.04 
 
 		 440 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  38.85 
 
 		 451 aa  252  1e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2639  type II secretion system protein E  45.31 
 
 		 491 aa  251  1e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2925  type II secretion system protein E  44.34 
 
 		 471 aa  250  3e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120672  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  43.67 
 
 		 455 aa  250  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2648  type II secretion system protein E  45.28 
 
 		 498 aa  249  5e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  44.52 
 
 		 452 aa  249  5e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  44.67 
 
 		 478 aa  249  5e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2933  type II secretion system protein E  44.97 
 
 		 495 aa  249  6e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.242377  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  43.23 
 
 		 438 aa  249  7e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  44.29 
 
 		 454 aa  249  8e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  44.29 
 
 		 454 aa  249  8e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  44.29 
 
 		 454 aa  248  9e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  44.86 
 
 		 472 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  44.86 
 
 		 472 aa  247  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  46.34 
 
 		 458 aa  247  2e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  39.66 
 
 		 440 aa  247  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  41.89 
 
 		 428 aa  247  3e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  40.12 
 
 		 449 aa  247  3e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  43.94 
 
 		 455 aa  246  6e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  45.08 
 
 		 515 aa  246  6e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  44.29 
 
 		 455 aa  246  8e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  44.29 
 
 		 455 aa  245  8e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1109  type II secretion system protein E  45.42 
 
 		 608 aa  245  8e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.280352  normal  0.0921606 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  44.29 
 
 		 455 aa  246  8e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  45.08 
 
 		 521 aa  245  9e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  45.08 
 
 		 520 aa  245  9e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  43.71 
 
 		 455 aa  245  9e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  45.08 
 
 		 520 aa  245  9e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  45.08 
 
 		 520 aa  245  9e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  45.08 
 
 		 523 aa  245  9e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  45.21 
 
 		 523 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  39.13 
 
 		 500 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  36.19 
 
 		 463 aa  244  3e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  44.52 
 
 		 474 aa  243  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2354  type II secretion system protein E  43.22 
 
 		 452 aa  244  3e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  43.84 
 
 		 454 aa  243  3e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0247  type II secretion system protein E  39.58 
 
 		 639 aa  244  3e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68853  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>