More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3372 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3372  type II secretion system protein E  100 
 
 		 433 aa  837    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3161  type II secretion system protein E  77.49 
 
 		 432 aa  549  1e-155  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.062169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5870  type II secretion system protein E  54.2 
 
 		 387 aa  341  1e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000410078  normal  0.124998 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0364  type II secretion system protein E  53.19 
 
 		 387 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000591318  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25820  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  48.79 
 
 		 419 aa  308  1.0000000000000001e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0480  type II secretion system protein E  52.6 
 
 		 437 aa  304  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0477  type II secretion system protein E  59.17 
 
 		 396 aa  303  3.0000000000000004e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0012388  normal  0.0255206 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0214  type II secretion system protein E  50.13 
 
 		 415 aa  302  7.000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0518  type II secretion system protein E  47.09 
 
 		 389 aa  298  9e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33360  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  51.28 
 
 		 396 aa  298  1e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.111015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4039  type II secretion system protein E  55.3 
 
 		 401 aa  295  9e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35920  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  51.14 
 
 		 395 aa  293  5e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4838  type II secretion system protein E  54.19 
 
 		 400 aa  292  8e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0619  type II secretion system protein E  55.46 
 
 		 412 aa  292  9e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4421  type II secretion system protein E  54.44 
 
 		 401 aa  292  9e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193692  normal  0.0190954 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5328  type II secretion system protein E  52.1 
 
 		 383 aa  288  1e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.192507 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5192  type II secretion system protein E  48.58 
 
 		 388 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0123395  hitchhiker  0.0000832543 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0276  type II secretion system protein E  50.43 
 
 		 372 aa  287  2.9999999999999996e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1384  type II secretion system protein E  48.3 
 
 		 389 aa  286  4e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192887  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4805  type II secretion system protein E  48.3 
 
 		 388 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.390977  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4891  type II secretion system protein E  48.3 
 
 		 388 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.665011  normal  0.0830382 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0729  type II secretion system protein E  51.91 
 
 		 390 aa  279  7e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0128  pilus assembly protein CpaF  49.74 
 
 		 398 aa  277  3e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2777  type II secretion system protein E  52.73 
 
 		 405 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0724904  hitchhiker  0.0000140927 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3908  type II secretion system protein E  47.78 
 
 		 393 aa  275  1.0000000000000001e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0592  type II secretion system protein E  55 
 
 		 379 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13689  hypothetical protein  49.68 
 
 		 352 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.89789e-18  normal  0.0993973 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5421  type II secretion system protein E  48.65 
 
 		 398 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4117 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25300  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  48.4 
 
 		 378 aa  273  5.000000000000001e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0052  type II secretion system protein E  47.89 
 
 		 492 aa  271  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.309192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0318  type II secretion system protein E  53.61 
 
 		 514 aa  266  5e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0476276  normal  0.440624 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2224  type II secretion system protein E  42.7 
 
 		 386 aa  263  3e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.492299 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18190  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  48.19 
 
 		 441 aa  261  1e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.654314  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1982  type II secretion system protein E  48.69 
 
 		 393 aa  256  7e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4297  type II secretion system protein E  49.84 
 
 		 422 aa  250  4e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0512015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  44.04 
 
 		 472 aa  241  2e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2323  type II secretion system protein E  45.74 
 
 		 449 aa  239  9e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.935094 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  44.03 
 
 		 428 aa  238  1e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  41.67 
 
 		 472 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  44.24 
 
 		 472 aa  236  8e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  43.93 
 
 		 474 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  44.7 
 
 		 444 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  42.81 
 
 		 441 aa  234  3e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  40 
 
 		 463 aa  234  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0247  type II secretion system protein E  43.2 
 
 		 639 aa  234  3e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  41.9 
 
 		 521 aa  233  4.0000000000000004e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  39.61 
 
 		 432 aa  232  8.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  45.36 
 
 		 442 aa  232  9e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3422  type II secretion system protein E  46.89 
 
 		 468 aa  232  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.351074  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0846  type II secretion system protein E  47.04 
 
 		 418 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  43.61 
 
 		 515 aa  230  3e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  43.71 
 
 		 520 aa  230  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  43.71 
 
 		 523 aa  230  4e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  43.71 
 
 		 520 aa  230  4e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  43.71 
 
 		 520 aa  230  4e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  43.71 
 
 		 521 aa  229  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  43.71 
 
 		 523 aa  229  6e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  37.86 
 
 		 463 aa  229  9e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  42.62 
 
 		 440 aa  228  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  42.17 
 
 		 594 aa  228  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1659  type II secretion system protein E  41.4 
 
 		 408 aa  228  2e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0537  type II secretion system protein E  45.48 
 
 		 440 aa  227  2e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  43.92 
 
 		 458 aa  228  2e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  41.49 
 
 		 491 aa  227  3e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  44.65 
 
 		 445 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0324  type II secretion system protein E  51.88 
 
 		 383 aa  226  6e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.20864  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  42.14 
 
 		 454 aa  226  7e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  41.03 
 
 		 572 aa  226  8e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  45.16 
 
 		 474 aa  225  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  43.24 
 
 		 455 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  43.24 
 
 		 455 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  44.44 
 
 		 624 aa  225  1e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  43.24 
 
 		 455 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13160  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  39.21 
 
 		 438 aa  224  2e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  41.22 
 
 		 464 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  39.63 
 
 		 589 aa  224  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0608  type II secretion system protein E  42.96 
 
 		 423 aa  224  3e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  37.11 
 
 		 451 aa  224  3e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2692  type II secretion system protein E  41.32 
 
 		 462 aa  224  3e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4396  type II secretion system protein E  41.81 
 
 		 481 aa  223  4e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  42.62 
 
 		 465 aa  223  4e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3512  type II secretion system protein E  40.58 
 
 		 449 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.657436  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  40.33 
 
 		 445 aa  223  6e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  42.23 
 
 		 462 aa  223  6e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  42.23 
 
 		 455 aa  223  7e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  42.09 
 
 		 460 aa  223  7e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  42.71 
 
 		 453 aa  223  8e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  39.86 
 
 		 442 aa  222  8e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2925  type II secretion system protein E  46.6 
 
 		 471 aa  222  8e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120672  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  40.07 
 
 		 634 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  42.23 
 
 		 455 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  39.87 
 
 		 498 aa  222  9.999999999999999e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  39.23 
 
 		 428 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1640  type II secretion system protein E  38.06 
 
 		 417 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.75229  normal  0.33759 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2796  putative type II/IV secretion ATPase protein, TadA  41.95 
 
 		 469 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178047  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1655  type II secretion system protein E  42.47 
 
 		 469 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  41.89 
 
 		 454 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  41.55 
 
 		 455 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2160  type II secretion system protein E  39.66 
 
 		 438 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0397447  normal  0.0352451 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  41.89 
 
 		 454 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>