More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3161 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3161  type II secretion system protein E  100 
 
 		 432 aa  837    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.062169 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3372  type II secretion system protein E  77.49 
 
 		 433 aa  527  1e-148  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0364  type II secretion system protein E  50.4 
 
 		 387 aa  322  7e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000591318  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5870  type II secretion system protein E  51.11 
 
 		 387 aa  322  9.999999999999999e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000410078  normal  0.124998 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0477  type II secretion system protein E  57.24 
 
 		 396 aa  302  7.000000000000001e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0012388  normal  0.0255206 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0276  type II secretion system protein E  49.72 
 
 		 372 aa  301  1e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35920  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  50 
 
 		 395 aa  297  2e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25820  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  47.64 
 
 		 419 aa  297  3e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0480  type II secretion system protein E  51.73 
 
 		 437 aa  296  6e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33360  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  50.13 
 
 		 396 aa  291  2e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.111015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5192  type II secretion system protein E  48.37 
 
 		 388 aa  290  3e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0123395  hitchhiker  0.0000832543 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0592  type II secretion system protein E  54.35 
 
 		 379 aa  290  3e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4805  type II secretion system protein E  48.1 
 
 		 388 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.390977  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4891  type II secretion system protein E  48.1 
 
 		 388 aa  288  1e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.665011  normal  0.0830382 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0518  type II secretion system protein E  46.67 
 
 		 389 aa  286  4e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4039  type II secretion system protein E  51.85 
 
 		 401 aa  284  3.0000000000000004e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1384  type II secretion system protein E  48.1 
 
 		 389 aa  281  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192887  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0214  type II secretion system protein E  48.23 
 
 		 415 aa  280  3e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4838  type II secretion system protein E  52.51 
 
 		 400 aa  280  3e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4421  type II secretion system protein E  50.53 
 
 		 401 aa  280  5e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193692  normal  0.0190954 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2224  type II secretion system protein E  44.66 
 
 		 386 aa  279  6e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.492299 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25300  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  48.69 
 
 		 378 aa  277  3e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0619  type II secretion system protein E  51.81 
 
 		 412 aa  275  1.0000000000000001e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3908  type II secretion system protein E  47.72 
 
 		 393 aa  274  2.0000000000000002e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5328  type II secretion system protein E  50.42 
 
 		 383 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.192507 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18190  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  50 
 
 		 441 aa  271  1e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.654314  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0128  pilus assembly protein CpaF  50 
 
 		 398 aa  269  7e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0729  type II secretion system protein E  51.5 
 
 		 390 aa  268  1e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5421  type II secretion system protein E  48.33 
 
 		 398 aa  266  7e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4117 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0318  type II secretion system protein E  51.44 
 
 		 514 aa  265  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0476276  normal  0.440624 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13689  hypothetical protein  49.84 
 
 		 352 aa  265  2e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.89789e-18  normal  0.0993973 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2777  type II secretion system protein E  50.69 
 
 		 405 aa  258  1e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0724904  hitchhiker  0.0000140927 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0052  type II secretion system protein E  44.36 
 
 		 492 aa  247  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.309192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4297  type II secretion system protein E  50.81 
 
 		 422 aa  244  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0512015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1982  type II secretion system protein E  47.14 
 
 		 393 aa  244  3e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2323  type II secretion system protein E  46.02 
 
 		 449 aa  243  6e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.935094 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  43.27 
 
 		 472 aa  241  2e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  43.43 
 
 		 467 aa  239  6.999999999999999e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  44.75 
 
 		 442 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  44.63 
 
 		 491 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  43.14 
 
 		 441 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  43.3 
 
 		 463 aa  234  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  41.32 
 
 		 440 aa  233  5e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  42.41 
 
 		 455 aa  233  5e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  43.24 
 
 		 455 aa  233  6e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  42.76 
 
 		 455 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  43.45 
 
 		 455 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  43.45 
 
 		 455 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  42.07 
 
 		 455 aa  232  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  42.42 
 
 		 428 aa  232  1e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0608  type II secretion system protein E  43.31 
 
 		 423 aa  231  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  42.57 
 
 		 455 aa  230  3e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  41.81 
 
 		 624 aa  230  3e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  40.42 
 
 		 438 aa  230  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  42.41 
 
 		 454 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  42.41 
 
 		 454 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  42.41 
 
 		 454 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4663  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  40.12 
 
 		 447 aa  229  6e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0858858  decreased coverage  0.000709192 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  38.38 
 
 		 463 aa  229  7e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  44.3 
 
 		 444 aa  229  8e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  42.76 
 
 		 462 aa  229  8e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  42.76 
 
 		 454 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  41.85 
 
 		 474 aa  228  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1730  type II secretion system protein E  40.65 
 
 		 447 aa  227  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000224608 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0324  type II secretion system protein E  48.68 
 
 		 383 aa  227  3e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.20864  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  39.57 
 
 		 472 aa  227  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  39.57 
 
 		 472 aa  227  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  43.43 
 
 		 440 aa  227  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  42.62 
 
 		 465 aa  227  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000847512 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0846  type II secretion system protein E  44.7 
 
 		 418 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3422  type II secretion system protein E  46.18 
 
 		 468 aa  227  4e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.351074  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  43.14 
 
 		 594 aa  227  4e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1655  type II secretion system protein E  40.72 
 
 		 469 aa  226  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1043  type II secretion system protein E  39.24 
 
 		 450 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.994378  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1523  type II secretion system protein E  39.24 
 
 		 450 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.68059  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1499  type II secretion system protein E  39.24 
 
 		 450 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000031609 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  41.98 
 
 		 453 aa  226  6e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1445  type II secretion system protein E  40.36 
 
 		 455 aa  226  6e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2796  putative type II/IV secretion ATPase protein, TadA  40.42 
 
 		 469 aa  226  7e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178047  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0537  type II secretion system protein E  44.88 
 
 		 440 aa  225  1e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  42.76 
 
 		 456 aa  225  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  42.07 
 
 		 460 aa  225  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1528  type II secretion system protein E  40.12 
 
 		 457 aa  225  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  41.14 
 
 		 442 aa  224  2e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  42.12 
 
 		 454 aa  224  3e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2160  type II secretion system protein E  39.44 
 
 		 438 aa  224  3e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0397447  normal  0.0352451 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3512  type II secretion system protein E  41.86 
 
 		 449 aa  223  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.657436  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2567  type II secretion system protein E  40.49 
 
 		 469 aa  223  4e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.368822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2702  tight adherence protein TadA  40.85 
 
 		 444 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.585164  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2324  type II secretion system protein E  40.85 
 
 		 444 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  43.96 
 
 		 445 aa  223  6e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  40.99 
 
 		 445 aa  223  6e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  43.14 
 
 		 450 aa  223  7e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06193  flp pilus assembly ATPase CpaF  42.25 
 
 		 423 aa  222  9e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  41.03 
 
 		 464 aa  222  9e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1405  type II secretion system protein E  39.82 
 
 		 454 aa  222  9e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4853  type II/IV secretion system protein, putative  43.71 
 
 		 418 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4360  type II secretion system protein E  39.36 
 
 		 451 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1659  type II secretion system protein E  42.19 
 
 		 408 aa  222  9.999999999999999e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  42.52 
 
 		 634 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>