More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4891 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_5192  type II secretion system protein E  97.42 
 
 		 388 aa  699    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0123395  hitchhiker  0.0000832543 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4805  type II secretion system protein E  100 
 
 		 388 aa  741    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.390977  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4891  type II secretion system protein E  100 
 
 		 388 aa  741    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.665011  normal  0.0830382 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1384  type II secretion system protein E  76.94 
 
 		 389 aa  543  1e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192887  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13689  hypothetical protein  80 
 
 		 352 aa  510  1e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.89789e-18  normal  0.0993973 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5421  type II secretion system protein E  81.68 
 
 		 398 aa  499  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4117 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0518  type II secretion system protein E  63.71 
 
 		 389 aa  465  9.999999999999999e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3908  type II secretion system protein E  65.13 
 
 		 393 aa  427  1e-118  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35920  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  64.48 
 
 		 395 aa  425  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0276  type II secretion system protein E  65.23 
 
 		 372 aa  424  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0364  type II secretion system protein E  59.12 
 
 		 387 aa  360  2e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000591318  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0729  type II secretion system protein E  60.55 
 
 		 390 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0480  type II secretion system protein E  59.51 
 
 		 437 aa  345  8e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5328  type II secretion system protein E  56.91 
 
 		 383 aa  335  1e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.192507 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0592  type II secretion system protein E  59.33 
 
 		 379 aa  335  1e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5870  type II secretion system protein E  50.9 
 
 		 387 aa  327  2.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000410078  normal  0.124998 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0214  type II secretion system protein E  56.99 
 
 		 415 aa  322  6e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0128  pilus assembly protein CpaF  57.62 
 
 		 398 aa  319  7e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4421  type II secretion system protein E  55.99 
 
 		 401 aa  309  4e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193692  normal  0.0190954 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4838  type II secretion system protein E  59.17 
 
 		 400 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4039  type II secretion system protein E  55.79 
 
 		 401 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4297  type II secretion system protein E  56.33 
 
 		 422 aa  290  2e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0512015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3161  type II secretion system protein E  48.1 
 
 		 432 aa  286  4e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.062169 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0052  type II secretion system protein E  52.45 
 
 		 492 aa  281  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.309192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0318  type II secretion system protein E  57.79 
 
 		 514 aa  281  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0476276  normal  0.440624 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0477  type II secretion system protein E  58.62 
 
 		 396 aa  281  2e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0012388  normal  0.0255206 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1982  type II secretion system protein E  51.1 
 
 		 393 aa  272  7e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25820  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  50.89 
 
 		 419 aa  272  8.000000000000001e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25300  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  47.86 
 
 		 378 aa  265  8e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3372  type II secretion system protein E  48.3 
 
 		 433 aa  262  6.999999999999999e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18190  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  53.82 
 
 		 441 aa  253  4.0000000000000004e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.654314  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2777  type II secretion system protein E  52.16 
 
 		 405 aa  249  5e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0724904  hitchhiker  0.0000140927 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  40.88 
 
 		 467 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  43.52 
 
 		 484 aa  247  3e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  40.88 
 
 		 482 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0298  type II secretion system protein E  43.23 
 
 		 488 aa  245  9.999999999999999e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  40.88 
 
 		 490 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  43.28 
 
 		 476 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  43.19 
 
 		 433 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33360  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  47.62 
 
 		 396 aa  244  3e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.111015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  41.97 
 
 		 508 aa  244  3e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  42.52 
 
 		 488 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  41.94 
 
 		 624 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  43.33 
 
 		 489 aa  242  7.999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  42.86 
 
 		 485 aa  242  9e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  43.23 
 
 		 472 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  43.23 
 
 		 472 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  40.18 
 
 		 455 aa  240  2.9999999999999997e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  39.76 
 
 		 467 aa  240  2.9999999999999997e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  43.23 
 
 		 474 aa  240  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2224  type II secretion system protein E  44.41 
 
 		 386 aa  239  4e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.492299 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  40.13 
 
 		 472 aa  239  4e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  40.56 
 
 		 449 aa  239  5e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  38.34 
 
 		 440 aa  239  6.999999999999999e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  42.95 
 
 		 477 aa  239  6.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  40.85 
 
 		 463 aa  239  8e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  44 
 
 		 521 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  44 
 
 		 515 aa  238  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  41.99 
 
 		 450 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  42.52 
 
 		 482 aa  238  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  44 
 
 		 520 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  41.18 
 
 		 500 aa  237  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  44 
 
 		 523 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  44 
 
 		 520 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  44 
 
 		 520 aa  238  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  44 
 
 		 523 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  42.52 
 
 		 483 aa  237  3e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  42.52 
 
 		 485 aa  237  3e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  41.18 
 
 		 491 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  41.18 
 
 		 491 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1659  type II secretion system protein E  40.29 
 
 		 408 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  41.86 
 
 		 482 aa  236  6e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  42.19 
 
 		 482 aa  235  8e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0726  type II secretion system protein E  42.86 
 
 		 492 aa  235  8e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50497  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  39.67 
 
 		 441 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1640  type II secretion system protein E  41.61 
 
 		 417 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.75229  normal  0.33759 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  37.87 
 
 		 445 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  40.99 
 
 		 491 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  39.12 
 
 		 480 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2323  type II secretion system protein E  37.37 
 
 		 449 aa  234  2.0000000000000002e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.935094 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2160  type II secretion system protein E  39.41 
 
 		 438 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0397447  normal  0.0352451 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  38.37 
 
 		 468 aa  233  3e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  42.23 
 
 		 452 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  40.52 
 
 		 482 aa  233  5e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  42.3 
 
 		 452 aa  233  6e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  39.88 
 
 		 442 aa  233  6e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1528  type II secretion system protein E  39.72 
 
 		 457 aa  232  8.000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1085  secretion ATPase protein  38.11 
 
 		 450 aa  231  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  39.74 
 
 		 472 aa  231  1e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  41 
 
 		 432 aa  231  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  41.53 
 
 		 478 aa  231  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4360  type II secretion system protein E  40.63 
 
 		 451 aa  230  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4250  type II secretion system protein E  40.63 
 
 		 451 aa  230  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  42.76 
 
 		 440 aa  230  3e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  38.6 
 
 		 449 aa  230  3e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1730  type II secretion system protein E  40.31 
 
 		 447 aa  230  4e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000224608 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  39.39 
 
 		 444 aa  230  4e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  43.51 
 
 		 445 aa  230  4e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0214  component of type IV pilus  40.86 
 
 		 492 aa  229  5e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2692  type II secretion system protein E  37.65 
 
 		 462 aa  229  6e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>