More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3057 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_3057  type II secretion system protein E  100 
 
 		 617 aa  1186    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.901701  normal  0.440204 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5120  type II secretion system protein E  52.4 
 
 		 648 aa  504  1e-141  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0155589  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0195  type II secretion system protein E  52.89 
 
 		 650 aa  496  1e-139  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.617369 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0015  type II secretion system protein E  48.51 
 
 		 644 aa  473  1e-132  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.529162  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3710  hypothetical protein  36.65 
 
 		 932 aa  261  3e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.384037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0047  type II secretion system protein E  40.78 
 
 		 514 aa  230  6e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0424  type II secretion system protein E  28.53 
 
 		 489 aa  120  7.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.983223 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1870  type II secretion system protein E  32.21 
 
 		 492 aa  118  3.9999999999999997e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0816791  normal  0.90316 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1403  type II secretion system protein E  32.21 
 
 		 492 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1344  type II secretion system protein E  34.53 
 
 		 491 aa  114  5e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.286284 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2814  type II secretion system protein E  29.83 
 
 		 556 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1197  type II secretion system protein E  28.62 
 
 		 483 aa  104  6e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.585907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0650  type II secretion system protein E  27.68 
 
 		 572 aa  103  9e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.200962 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1204  type II secretion system protein E  28.48 
 
 		 519 aa  102  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.431618  hitchhiker  0.000463314 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0196  type II secretion system protein E  26.83 
 
 		 577 aa  102  3e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191118  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1537  aminoacyl-tRNA hydrolase  27.67 
 
 		 583 aa  100  5e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20083  hitchhiker  0.0017261 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  28.12 
 
 		 441 aa  100  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  27.91 
 
 		 412 aa  99.8  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2148  type II secretion system protein E  27.32 
 
 		 831 aa  98.6  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0453138 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2386  type II secretion system protein E  26.02 
 
 		 692 aa  97.8  5e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.934402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  28.13 
 
 		 463 aa  97.4  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  28.83 
 
 		 482 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1500  type II secretion system protein E  27.3 
 
 		 682 aa  95.5  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0597313  normal  0.0634104 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  27.73 
 
 		 482 aa  95.9  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1064  type II secretion system protein E  29.45 
 
 		 591 aa  95.1  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0853  type II secretion system protein E  34.1 
 
 		 311 aa  95.1  3e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35920  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  33.33 
 
 		 395 aa  94.4  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  28.76 
 
 		 476 aa  94.4  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  28.57 
 
 		 432 aa  94.7  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  29.19 
 
 		 449 aa  94.4  6e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  27.81 
 
 		 483 aa  93.6  8e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  27.51 
 
 		 477 aa  93.6  9e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  27.47 
 
 		 490 aa  93.2  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0254  type II secretion system protein E  28.03 
 
 		 654 aa  93.2  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2721  type II secretion system protein E  28.05 
 
 		 542 aa  93.2  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.261716 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  27.22 
 
 		 478 aa  92.8  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  26.93 
 
 		 467 aa  92.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  27.11 
 
 		 521 aa  92.4  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  28.27 
 
 		 444 aa  92.4  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  28.4 
 
 		 478 aa  92.8  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0808  type II secretion system protein E  28.16 
 
 		 510 aa  92.4  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2859  type II secretion system protein E  26.85 
 
 		 847 aa  92.4  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  29.6 
 
 		 477 aa  92  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0314  type II secretion system protein E  25.74 
 
 		 991 aa  92  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.281088  normal  0.2578 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  28.92 
 
 		 458 aa  92  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  26.93 
 
 		 433 aa  92  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3512  type II secretion system protein E  28.92 
 
 		 449 aa  91.7  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.657436  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  29.09 
 
 		 454 aa  91.7  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1965  flagella related protein FlaI  25.87 
 
 		 604 aa  91.3  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  28.66 
 
 		 451 aa  90.5  8e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  26.99 
 
 		 485 aa  90.5  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1459  hypothetical protein  25.69 
 
 		 770 aa  90.1  9e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.362322 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  28.09 
 
 		 453 aa  90.1  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1528  type II secretion system protein E  26.84 
 
 		 457 aa  89.7  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4396  type II secretion system protein E  28.57 
 
 		 481 aa  90.1  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1032  type II secretion system protein E  26.06 
 
 		 551 aa  90.1  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.621216  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  26.4 
 
 		 484 aa  89  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  26.67 
 
 		 489 aa  89.4  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  27.11 
 
 		 498 aa  89  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0439  type II secretion system protein E  28.34 
 
 		 671 aa  89  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4190  type II secretion system protein E  26.55 
 
 		 504 aa  89.7  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0009  type II secretion system protein E  26.81 
 
 		 547 aa  88.6  3e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  27.32 
 
 		 440 aa  89  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1034  type II secretion system protein E  30.23 
 
 		 450 aa  88.6  3e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2687  type II secretion system protein E  25.47 
 
 		 549 aa  89  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  27.33 
 
 		 442 aa  88.2  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  25.43 
 
 		 508 aa  88.2  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1405  type II secretion system protein E  27.67 
 
 		 454 aa  88.2  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2796  putative type II/IV secretion ATPase protein, TadA  27.68 
 
 		 469 aa  87.8  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178047  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0949  type II secretion system protein E  27 
 
 		 617 aa  87.8  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0134957  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  27.08 
 
 		 438 aa  87.4  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1655  type II secretion system protein E  27.68 
 
 		 469 aa  87.4  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1172  type II secretion system protein E  24.84 
 
 		 640 aa  87.4  7e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00958345  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  26.71 
 
 		 500 aa  87  9e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0726  type II secretion system protein E  28.53 
 
 		 492 aa  86.3  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50497  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0298  type II secretion system protein E  25.87 
 
 		 488 aa  86.3  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4250  type II secretion system protein E  25.45 
 
 		 451 aa  86.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1445  type II secretion system protein E  27.95 
 
 		 455 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314248  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4360  type II secretion system protein E  25.45 
 
 		 451 aa  86.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  28.12 
 
 		 488 aa  86.7  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  29.89 
 
 		 491 aa  85.9  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6894  type II secretion system protein E  33.72 
 
 		 456 aa  85.9  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0376392  normal  0.261067 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  27.22 
 
 		 487 aa  85.9  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2692  type II secretion system protein E  27.86 
 
 		 462 aa  85.5  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1043  type II secretion system protein E  27.22 
 
 		 450 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.994378  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  26.99 
 
 		 480 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1499  type II secretion system protein E  27.22 
 
 		 450 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000031609 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1523  type II secretion system protein E  27.22 
 
 		 450 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.68059  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  27.92 
 
 		 563 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  25 
 
 		 572 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  27.3 
 
 		 485 aa  85.5  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1085  secretion ATPase protein  25.7 
 
 		 450 aa  85.1  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0537  type II secretion system protein E  29.97 
 
 		 440 aa  84.7  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0352  type II secretion system protein E  27.16 
 
 		 610 aa  85.1  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.540636  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  26.06 
 
 		 482 aa  84.7  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0948  type II secretion system protein E  24.92 
 
 		 546 aa  84.7  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1862  type II secretion system protein E  29 
 
 		 618 aa  84.3  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  28.23 
 
 		 440 aa  84.3  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  25.82 
 
 		 468 aa  84.3  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2104  type II secretion system protein E  32.88 
 
 		 476 aa  84.3  0.000000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.609091  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>